兒童身體各器官發育不成熟，在用藥過程中要比成人更加謹慎，這樣才能既幫助孩子早日康復，又能在最大程度上避免藥物的毒副作用對孩子造成的不良影響。
1、氨基糖苷類：常見：慶大黴素、阿米卡星、鏈黴素、卡那黴素、小諾米星、大觀黴素、新黴素等禁忌：6 歲以下兒童禁止使用，6歲以上慎用，原因：使用過量會導致聽力下降，嚴重者可使聽神經發生變性和萎縮，從而導致不可逆性的耳聾、耳鳴。禁止與速尿合用，可加強耳毒性；禁止與頭孢菌素合用，可致腎功能衰竭。
2、阿司匹林及其複方製劑禁忌：3個月以下兒童，以及有水痘或流感樣症狀的兒童或青少年禁用。原因：兒童患者，尤其有發熱及脫水時，使用阿司匹林易出現毒性反應；急性發熱性疾病，尤其是流感及水痘兒童使用阿司匹林，可能發生瑞氏綜合徵（一種常見的急性腦部疾病，病死率高達50%）。
3、萘普生、雙氯芬酸、尼美舒利、美洛昔康、吡羅昔康禁忌：2歲以下兒童禁用萘普生；12歲以下兒童禁用尼美舒利；14歲以下兒童禁用雙氯芬酸；15歲以下兒童禁用美洛昔康；兒童禁用吡羅昔康。原因：非甾體抗炎藥均可能引起致命的腎損害、胃腸出血、心血管事件（阿司匹林除外）；尼美舒利即使短期使用也可引起無症狀的、致命的肝損害；吡羅昔康、美洛昔康所引起的嚴重皮膚反應的風險高於其他非甾體抗炎藥物。
4、大環內酯類：紅黴素、無味紅黴素 禁忌：2 個月以內儘可能避免使用，2個月以上慎用或醫生密切監護使用。原因：嚴重者導致兒童肝臟損傷、肝功能衰竭、藥物性肝炎，甚至死亡。
5、複方地芬諾酯（地芬諾酯、阿托品）禁忌：2歲以下兒童禁用。原因：①地芬諾酯為哌替啶的衍生物，有與嗎啡相同的基本結構，對中樞神經系統有抑制作用，長期應用時可產生依賴性；②複方地芬諾酯極易導致小兒中毒，早期主要有發熱、皮膚潮紅、興奮易激惹等阿托品樣中毒表現；後期主要有呼吸抑制、中樞抑制、瞳孔縮小等阿片樣中毒表現。
6、阿苯達唑、哌嗪、噻嘧啶、左旋咪唑禁忌：2歲以下兒童禁用阿苯達唑；1歲以下兒童禁用哌嗪、噻嘧啶；兒童禁用左旋咪唑。原因：2歲以下的兒童接觸蟲卵的機會要少，一般不需要服用驅蟲藥；兩歲以內的幼兒肝腎發育尚不完善，藥物會傷害幼兒的肝腎。哌嗪、噻嘧啶：可引起頭暈、頭痛、嘔吐及肝功損害，對人體（特別是兒童）具潛在的神經肌肉毒性，應避免長期或過量服用。阿苯達唑，左旋咪唑：均可導致腦炎綜合徵、急性脫髓鞘腦炎、遲發性腦病。其中，阿苯達唑的腦炎樣反應發生率較低；左旋咪唑發生率較高（臨床已極少使用）。
7、磺胺類：複方新諾明(SMZ-TMP) 新生兒忌用，可產生高鐵血紅蛋白血癥，臨床表現為缺氧性全身發紫；新生兒黃疸，2 歲以上醫生指導下使用。
8、喹諾酮類藥物常用藥物：諾氟沙星、環丙沙星、氧氟沙星、左氧氟沙星、莫西沙星等。禁忌：18歲以下的小兒及青少年不宜使用。原因：喹諾酮類藥物用於數種幼齡動物時，可致骨關節病變，特別是負重骨關節軟骨組織的損傷。
9、西咪替丁禁忌：16歲以下兒童不推薦使用。原因：西咪替丁可通過血-腦脊液屏障，具有一定的神經毒性，幼兒用藥後易出現中樞神經系統毒性反應。
10、雷尼替丁禁忌：8歲以下兒童禁用。原因：H2受體拮抗劑（西咪替丁、雷尼替丁、法莫替丁）連續使用均對小兒的肝、腎功能、造血系統和內分泌系統有一定損害。雷尼替丁的不良反應較西米替丁少而且輕。雷尼替丁偶有報道會導致肝細胞性、膽汁鬱積性或混合型肝炎。通常是可逆的，但偶有致死的情況發生。雷尼替丁偶有心律失常，例如心動過速、心動過緩、心博停止、心室阻滯及心室早博。
11、維生素A 兒童慎用，過量可引起毛髮枯乾、皮疹、瘙癢、厭食、骨痛、頭痛、嘔吐等中毒症狀，影響骨的發育，長不高。
12、洛哌丁胺禁用：2歲以下兒童禁用洛哌丁胺；5歲以下的兒童不宜使用鹽酸洛哌丁胺膠囊劑。原因：洛哌丁胺的化學結構類似氟哌啶醇和哌替啶，適用於各種病因引起的急、慢性腹瀉的治療。但其作用較地芬諾酯強而迅速，用於低齡兒童易致藥物不良反應，包括過敏性休克、陰莖水腫、麻痺性腸梗阻、急性腎功能衰竭、意識障礙等，加之曾有新生兒用藥致死的報道，故國內外均限制其用於低齡兒。
13、藥用炭片（膠囊）禁忌：禁止3歲以下小兒長期應用。原因：藥用炭能吸附導致腹瀉及腹部不適的多種有毒與無毒刺激物，減輕對腸壁的刺激，減少腸蠕動，從而起到止瀉作用。但由於該藥吸附作用強烈且無選擇性，能影響胃蛋白酶、胰酶等消化酶的活性，減少維生素的吸收，長期應用可致小兒營養不良。
14、氯苯那敏、賽庚啶、酮替芬、苯海拉明禁忌：酮替芬：3歲以下兒童使用本藥的安全性和有效性尚不明確；氯苯那敏、賽庚啶、苯海拉明：國內新生兒和早產兒禁用；國外2歲以下兒童避免使用。原因：第一代抗組胺藥是親脂性的小分子化合物，易透過血腦屏障，從而抑制中樞、並有抗膽鹼能及微弱的局部麻醉作用，不良反應為嗜睡、注意力不集中，煩躁不安，也可引起胃腸功能紊亂，食慾亢進等。現有證據表明這些藥物還可能導致矛盾的中樞興奮，煩躁不安，失眠或癲癇發作等，過量時還可引起心動過速、心臟傳導阻滯或心律失常。雖然第一代抗組胺藥用於“使兒童平靜下來”，並使他們睡得更好。但是，現已經證明第一代抗組胺藥，如撲爾敏和異丙嗪可以顯著擾亂睡眠結構，在睡眠和快速眼動睡眠時相增加延遲發作，縮短睡眠和整體睡眠。
15、維生素C 兒童慎用，服用過量可引起腹痛、腹瀉等症；服用時忌吃豬肝。
16、維生素D 兒童慎用，過量可引起低熱、嘔吐、腹瀉、厭食、甚至軟組織異位骨化、蛋白尿、腎臟損害等症，嬰兒服用過多，則引起嬰兒高血壓。
17、異丙嗪禁忌：2歲以下兒童禁用。原因：異丙嗪可致2歲以下兒童呼吸抑制甚至死亡；還可能引起小兒腎功能不全；患急性病或脫水的小兒，注射本藥後易發生肌張力障礙（錐體外系症狀）；兒童單次口服本藥75~125mg，可發生過度興奮、易激動或噩夢等異常反應。
18、氨茶鹼兒童慎用，超量會導致氨茶鹼急性中毒，出現煩躁不安、出虛汗、心動過速甚至休克死亡，應嚴格按醫生指導掌握用量。
19、阿司咪唑、特非那定禁忌：12歲以下兒童避免使用。原因：偶可引起Q-T間期延長，室性心律失常、心臟驟停等。目前許多醫院已棄用該藥。
20、中藥滋補劑：人參、人參蜂皇漿、冬蟲夏草等 兒童及青少年慎用，可致性早熟
21、氯黴素禁忌：新生兒、早產兒禁用氯黴素，包括眼用製劑、搽劑和滴耳液。原因：新生兒肝臟酶系統未發育成熟，腎臟排洩功能又差，藥物自腎排洩較成人緩慢，故氯黴素應用於新生兒易導致血藥濃度過高而發生毒性反應(灰嬰綜合徵)，故新生兒不宜應用本品，有指徵必須應用本品時應在監測血藥濃度條件下使用。
22、氮卓斯汀禁忌：口服給藥：12歲以下兒童口服給藥的安全性及有效性尚不明確；滴眼液：不推薦4歲以下兒童使用；鼻噴劑：不推薦5歲以下兒童使用。原因：氮卓斯汀除抗組胺作用，還有抗炎、平喘及抗過敏作用。氮卓斯汀有一定的中樞抑制作用，可引起嗜睡、頭暈、口乾、多夢、咳嗽、腹痛、噁心、乏力、鼻痛等。對使用本品易產生嗜睡、眩暈的患者，用藥後不宜進行駕駛車輛。
23、微量元素鋅 濃度大於5 ml ／L 時損害巨噬細胞，減弱殺滅真菌的能力，增加膿瘡病的發病率。
24、呋喃妥因、呋喃唑酮禁忌：新生兒禁用。原因：新生兒酶系尚未發育完全，易誘發溶血性貧血，尤其是葡萄糖-6-磷酸脫氫酶缺乏者。
25、哌替啶(度冷丁) 嬰幼兒慎用，1 歲以內小兒一般不應靜脈注射本品或行人工冬眠，兒童慎用。26、替硝唑、奧硝唑禁忌：替硝唑口服：僅限3歲以上兒童治療腸道阿米巴病；替硝唑注射劑：12歲以下兒童禁用；奧硝唑注射劑：建議3歲以下兒童不用。原因：治療厭氧菌感染及預防術後厭氧菌感染的安全性和有效性尚不明確。另外，硝基咪唑類均可能引起癲癇發作和周圍神經病變。
27、地西泮(安定) 新生兒、6 個月以下兒童忌用，兒童慎用，可致粒細胞減少、肝功能損害。
28、呋塞米(速尿) 兒童慎用，用藥量宜少，間隔適當延長，忌與氨基糖苷類合用。
29、吲哚美辛(消炎痛) 兒童對本品敏感，有用本品後因激發潛在性感染而死亡的報道，兒童慎用。
30、撲熱息痛 兒童若每日用量超過3g時，便可能發生急性中毒，甚至可以引起致死性肝損傷。
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