加州鱸朝魚寄生蟲感染率較高，尤以車輪蟲感染為主，杯體蟲、鉤介幼蟲等檢出率也較高，也有個別池塘感染斜管蟲、毛管蟲等；從症狀看，加州鱸朝魚白身、白尾爛尾、“打轉”等最為常見。
加州鱸育苗逐漸進入分篩環節，容易造成魚體損傷，而加州鱸進入散春期，抵抗力較差，容易染病。綜合看，應著重防控蟲、菌病害。
2.1 加州鱸朝苗寄生蟲：車輪蟲、杯體蟲、毛管蟲、鉤介幼蟲、斜管蟲等。
加州鱸朝苗的車輪蟲感染率較高，但大量感染車輪蟲卻較為少見，且車輪蟲多寄生於魚苗的尾鰭、臀鰭等鰭條上，而鰓上的車輪蟲往往不多，因此，在處理車輪蟲時，不宜“下猛藥”，建議使用苦參鹼等中草藥或溫和性的殺車輪蟲專用藥進行處理。
杯體蟲的感染常見於有外傷或因發病而體質變差的加州鱸苗，偶見鰭條、鰓等大量感染，但其危害不大，且較易處理，根據指導使用纖蟲清等殺纖毛蟲專用藥即可。毛管蟲同。
鉤介幼蟲為蚌的幼蟲，常見於清塘不徹底的苗塘，因其寄生宿主後伸出吸管刺入宿主內吸取營養，故一般殺蟲藥物對其無效。幸在其少量寄生時並無大礙，可不處理。
斜管蟲感染率不高，但其危害極大。如有感染，建議及時使用專用藥物進行殺滅。
對於寄生蟲可以使用安全的藥物進行防控，樂暢桉樹精油具有天然的單萜烯、倍半萜烯、1,8-桉葉素等抗蟲抑蟲成分，能夠作用於多個靶細胞，對於常見的車輪蟲、指環蟲、斜管蟲、錨頭鰠等都有很好的防控作用，能夠阻斷寄生蟲的傳播途徑，防控寄生蟲寄生蟲寄生。
2.2 加州鱸朝苗細菌病：黃桿菌
從檢測的情況看，取熟身病和白頭白尾病病魚的肝、脾、腎等接種，都未能培養出明顯菌落；但病魚體表的黃桿菌檢出率幾近100%。儘管目前還不能確定該菌是否為第一致病菌，但毫無疑問該菌是熟身病和白頭白尾病的重要病原菌。
黃桿菌主要經過皮膚侵入魚體體表，因此，在消毒時應選擇滲透性較強的消毒劑。
2.3 加州鱸朝苗病毒病：彈狀病毒/神經壞死病毒
近期，加州鱸朝苗“打轉”病十分猖獗。該病發病急，死亡量大，處理不當甚至會導致全塘覆沒，用藥需十分謹慎。就目前的檢測來看，該病的病原極有可能是彈狀病毒或神經壞死病毒。儘管學術上病毒病是無藥可治的，但根據市場的反饋，五黃+金銀花潑水可有效控制該病(已有多次實踐驗證)。對於出現“打轉”病的加州鱸苗塘，一定要謹慎用藥，並控制投餵量，建議使用五黃+金銀花潑水。
2.4 成魚寄生蟲：釘蟲等
釘蟲本身不至於導致成魚死亡，但釘蟲咬傷引起繼發真菌或細菌感染卻很致命。對於已長期未殺蟲的池塘，可以選擇樂暢桉樹精油進行防控，切斷寄生蟲的傳播途徑，有效防控寄生蟲寄生。
2.5 成魚細菌病：諾卡氏菌病
諾卡氏菌是嚴重危害加州鱸的慢性致病菌。該病原菌潛伏時間長，且嚴重破壞宿主的免疫器官，且我國目前允許使用的漁藥中無針對該菌的高效藥物，因此，該病的治療難度較大。日常應加強巡塘，如有出現鰓出血或體表長膿皰等症狀，及時採樣送到活寶源魚病實驗室進行專業檢測。
在預防上，應避免頻繁大量換水等強刺激性操作，多使用有益菌，保持水質優良；注意控制投餵，避免急加料；此外可以拌料投餵膽汁酸，促進肝臟的排毒，恢復肝臟健康，提高自身免疫力，預防疾病的發生。
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