水黴一般是在低溫魚體有傷引起的一些併發感染。鰓黴也是一種真菌，但它跟水黴完全不一樣，鰓黴往往是在高溫的時候，水質有機濃度非常高的時候，經常會出現鰓黴。
苗期經常會出現的鰓黴，它主要表現在大小不均勻，小苗黑身，鰓絲髮黑，不採食，引起魚苗培育成活率大大下降。
初期：不吃食，成群結隊的在食臺周圍打轉。
中期：發病魚就表現為離群獨遊，白天浮在水面上，病魚眼球外凸，魚體發黑，有的鰭條發白，同時伴隨著肝膽和腸炎等併發症出現，腹水，腸道內出血並伴有黃色液體出現。
肉眼可以看到，鰓絲腫脹，鰓上粘液明顯增多，有的出血、淤血、缺血和壞死的斑點，呈現花斑鰓外觀；病重時魚高度貧血，整個鰓呈青灰色。
寄生鰓黴的魚普遍鰓絲未端發白，腫脹，有呈塊狀爛鰓現象，但因為魚的體表還有多種其它病症表現症狀，比如爛鰓，腐皮，爛嘴，點狀充血等，所以鰓黴很容易被忽略而導致誤診。鰓黴在鰱魚、草魚、鱸魚、叉尾鮰等魚鰓上都有發現，鰓黴感染後初期沒有多大死亡，但通常到了一個星期至半個月左右後魚的死亡量會急劇上升。
感染鰓黴，整個鰓絲，軟骨，跟鰓絲血管裡面長滿了樹枝狀的黑絲，一般顯微鏡都可以檢查到，也可以在小規格的魚鰓絲裡面，用鑷子把它夾出來，對著陽光就可以看到整個鰓絲的血管，裡面愛充滿著真菌發黑鰓黴菌。
它的影響也非常廣泛，一般成魚裡面的也會發現，當出現爛鰓以後，用了一些對水質破壞性比較強的消毒劑，引起水質惡化，也會引起鰓黴菌感染。即便冬天也會因為水質惡化引起鰓黴感染，最後引起的一些爛鰓魚的爬邊。
要控制鰓黴，首先要注意底質和水質的調理。做好水質管理，防止底質惡化，這是最有效的辦法。
鰓黴病常發生在水質較壞，有機質含量很高的發臭池塘，常在5—10月發生。6— 7月份為流行。發病率可達70%一80% ，死亡率可達90%上，危害嚴重。
鰓黴病常規處理方案：
預防：主要是從調節水質入手，不使用過多未經發酵的有機糞肥，定時使用芽孢桿菌，光合細菌等微生物製劑分解池塘內的有機物，保持水質的清爽，基本上就可以達到很好的預防效果。
要是已經發病了，在治療的真菌的過程中，可抑制真菌的產品有水楊酸，聚維酮碘，蛋氨酸碘等外用消毒劑，也可以參照水黴病的防治方法，最好是同時使用中草藥和黃芪多糖等免疫增強劑內服，修復機體的體質及抵抗力，更有利於鰓黴的治癒。
另外，可用50%硫醚殺星全池潑灑，陰雨天潑藥後開增氧機2小時。因為有繼發性魚病感染，故建議使用碘溶液全池潑灑。
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