瘟疫伴隨著人類共生共存，人類的成長史就是一部與瘟疫鬥爭的歷史。
上古時就有關於瘟疫的傳說。據說疫病的來源其實是顓頊帝的三個兒子死後為疫鬼，一個居住在江水，為瘧鬼；一個居住在若水，為魍魎鬼；一個居住在別人宮室裡，專門驚嚇小兒，為小鬼。《周禮·夏官·方相氏》中記載：“方相氏掌：蒙熊皮，黃金四目，玄衣朱裳，執戈揚盾，帥百隸隸而時儺，以索室驅疫．”鄭玄曰：“蒙，冒也。冒熊皮者，以驚驅疫癘之鬼，如今魌頭也。時難，四時作方相氏以難卻兇惡也。（黃帝專門挑選了一個長相非常兇悍的人，任命為方相氏，在正歲的時候負責驅除疫鬼。方相氏頭上蒙著熊皮，有四隻金色的大眼睛，穿著黑色上衣紅色褲子，手裡拿著戈和盾，率領手下驅除疫鬼。）
文字出現後，我國早在殷墟甲骨文已有“蟲”“蠱”“瘧疾”“疾年”等的記載。在《小屯殷虛文字乙編》上，商代的巫師在向上天卜問的兩件事，
甲子卜，殻貞：疒役（疫），不彳止（延）？
貞：疒役（疫），其彳止（延）？
（甲子這天問卦，一是商王武丁是否染上瘟疫；二是卜問疫病是否會擴散流傳。）這可以說是世界上最早的關於瘟疫的記載。
《詩經·小雅·節南山》記載，公元前781至前771年，周幽王時期“天方薦瘥[jiàn chài]，喪亂弘多 。”更近一步的《尚書》、《素問》等古書中，則記載了很多關於“癘(lì)”字的描述，比如《素問·六元正紀大論》裡就寫了：厲大至，民善暴死。
《周禮·天官·冢宰》記載：“疾醫掌養萬民之疾病，四時皆有癘疾。”《呂氏春秋·季春紀》記載：“季春行夏令，則民多疾疫。
有記載的治疫的歷史從戰國時開始
1，報告
《封診式》竹簡中記載了在戰國時期就有逐級報告傳染病和對可疑病例調查的制度。
2，隔離
《睡虎地秦墓竹簡》中提到“城旦，鬼薪癘，可（何）論？當遷癘遷所。”“癘遷所”也稱“ 癘所”，是專門隔離麻風病患者的地方。“丙而不把毒，毋（無）它坐“確認不是傳染病人後才可以獲得自由。晉朝規定：朝臣家有疾染三人以上，自己無病也百日不能入宮。
3，控制源頭
宋神宗年間的虔州瘟疫，其源頭是上游被汙染的水源，有這源源不斷的汙染源，瘟疫蔓延速度極快。眼瞅著疫情越來越嚴重 ，新任知州劉彝果斷採取措施，以“雨汙分離”的思路建成了著名的“福壽溝”，確保汙水繞開生活區。也正是用了這一招，虔州瘟疫才被徹底遏制
將藥物塗抹在道教認為的人體的幾個重要地區，如人中、耳門等處。《肘後備急方》“闢溫（瘟）病粉身方……以塗粉於身，大良”；《備急千金要方》“闢溫（瘟）氣,雄黃散方……以塗五心額上鼻人中及耳門”。這些都被認為是可以防疫防瘟的。《疫診一得》中記載，“中皆有藥，入口即活，天下大疫，有得藥如塗其門，則一家不病，病者立愈”，這是一劑名叫“清瘟敗毒散”的方藥，直到現在依然在使用。古人還用焚燒蒼朮、木香、降香等芳香藥物，以達到避穢、健脾化溼的功效。《金匱要略》中還記載了一劑名叫澤瀉湯的藥，也對瘟疫有抑制的作用。將藥物做成配飾，靠其揮發藥性，殺死病菌，防護自身，十分有效。
5，衛生
秦朝時，對亂扔垃圾，“棄灰於道者”實施懲罰，不但要罰錢，還會責令他服苦役。古人還特別重視對水源和居住環境的消毒防疫，孫思邈就在《千金要方》中記載了這類防疫方法。地方官員們也對百姓的用水衛生逐漸重視起來，“疫之所興，或溝渠不洩，蓄其穢惡，燻蒸而成者。”官府採取的辦法，除了“差淘渠人通渠”外，還“疏浚河道，勿使積汙，廣鑿井泉，勿使飲濁”，後期甚至才用了“驅蠅祛疫”的方法。
春秋時期《管子》中已經提出“春三月”要“抒井易水,所以去茲毒也”。如果不注意疏通溝渠、水道，久而久之則會積累汙穢之氣，引發疾病。
在個人衛生上，古人認為“疾病，內外皆掃，徹褻衣服，加新衣”。所謂“褻衣”，就是舊衣或者髒衣服。髒衣服藏汙納垢，很容易滋生細菌。同時提倡“衣被宜潔淨，飲食宜淡泊，臥房宜開闊，窗戶宜開爽，疫氣自然消”。
6，接疫苗
清代的《痘科金鏡賦集解》中記載說：“聞種痘法起於明朝隆慶年間（公元1567~1572年）寧國府太平縣（今安徽太平）……由此蔓延天下。”
7，消毒
蒸汽高溫滅菌。賈山亭《仙方合集.闢瘟諸方》說：“天行時疫傳染，凡患疫之家，將病人衣服於甑上整過，這一家不染。”
8，政府治疫
唐朝時期，唐玄宗親制《廣濟方》頒示天下，要求各個郡縣按照《廣濟方》中主要的內容刻錄在石板和木板上，放置在村中要道。宋朝時期還會印製大量的醫術，讓各個郡縣向民眾推廣防瘟疫的知識。這些做法大大提高了百姓的醫學常識和防瘟疫的知識，讓瘟疫的危害降到最低。瘟疫期間政府除了提供醫療上的幫助，還會提供經濟上的幫助。經常會開倉放糧、減免租賦等措施，比如西漢宣帝就下詔：“令郡國被災甚者，毋出今年租賦”。
當然，人類在也經歷了對瘟疫的慢慢認知的過程，走了一些彎路。
1，祭祀
用祭祀討好,或以虔悔來消除鬼魂的不滿,或表示屈服以取悅鬼魂,或用某種儀式驅趕疫鬼。
《禮記》說:“儺,人所以逐疫鬼也”這是原始社會形成的一種巫舞，驅除疫病鬼魅。
2，送瘟神
古人將瘟疫會看成是老天發怒在懲治人間，因此在瘟疫爆發之後，家都會重點治理貪官汙吏，而各地官員也會躬身自省，並且趕快祭拜上天，希望上天能夠饒過百姓。也會認為是有哪位官員審了冤假錯案，導致上天震怒，國家會將之前審過的案子重新梳理一遍，如果要是用冤假錯案儘快平反。
3，做帝王罪己詔
漢代的文帝，武帝都曾經做過瘟疫自責罪己詔。
4，道符咒語
這常見於道家治疫，有專門的瘟疫符。《遵生八箋》卷六中有“除日以閤家頭髮燒灰，同腳底泥包投井中，咒曰：“敕令我家眷屬竟年不害傷寒，避卻五瘟疫鬼。”
5、貔貅角治瘟疫
南雄的民間傳說，將蕭統太子追捕貔貅，以取其角，來為百姓治療瘟疫， 因此積勞成疾而過世；其理由可能與犀牛角「主治百毒蠱疰、邪鬼瘴氣……傷寒瘟疫、頭痛寒熱諸毒氣」 的藥效有關，所以人們將貔貅的角，聯想成像犀牛角一樣，也具有治癒瘟疫的療效之故吧。
6、喝酒放炮
古人對待防疫有著獨特的方式，就是在過年的時候飲屠蘇酒和燃放鞭炮，據說是華佗發明了屠蘇酒。
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