在元代，松潘、黎、雅地區藏族所需茶葉已經單獨形成一個品種，稱為“西番茶”，以區別於其它各種川茶。忽思慧《飲膳正要》：“西番茶，出本土，味苦澀，煎用酥油”。其實“西番茶”就是現所稱的“邊茶”，其產自天全、雅州、漢源等地區，後擴大至邛州、名山、峨眉、夾江等地。元代川茶的製法仍以末茶、餅茶為主，民間茶飲繼承宋代遺風，散茶有較大發展。
進入明代，四川有保寧、夔州、邛雅、敘州四大產茶區，所產茶葉多調運西北藏族地區互市。在我國茶葉製法和飲用史上，元末明初是從末茶到葉茶，從烹煮到沖泡的轉折時期。明代的四川已普遍推行雅茶和葉茶，團茶漸被淘汰。政府課茶有四個品種，即：雅茶、葉茶、烏茶和剪刀粗茶。
明高濂《遵生八箋·論茶品》就列舉了全國各地名茶，其中屬於四川傳統名茶的有劍南蒙頂石花、峽州碧澗、邛州火井、思安、渠江薄片、巴東真香、瀘州納溪梅谷。明黃一正在《事物紺珠·茶類》收錄全國98種名茶，其中四川就佔了21種，即20%。如出於蒙頂山頂的在唐以前為仙品的仙茶，出於雅州中頂山的雷鳴茶、瀘州的納溪茶、南川茶、黔江茶、彭水茶、武隆茶、邦都茶、峨眉茶、瀘州茶、石泉茶、永寧茶、天全茶、建始茶、賓化茶、白馬茶、涪陵茶、毛茶、火井、思安茶、真香和香山茶等。
明代的川茶產量較之宋代最高的年產量三千萬斤，出現了大幅度的下降，只在幾百萬斤徘徊，究其原因，南宋末年四川遭受長期戰爭，摧殘嚴重，元氣久久未能恢復；其次明朝廷過多強調茶葉的“馭番”作用，而輕視了其商品的職能；其三是茶農束縛備加，市場管理過死，形成產銷阻滯，使茶葉產量大大下降。
歷經明末和清初的長期戰亂，四川哀鴻遍野，良田荒蕪，人口銳減，川茶業受到重創。康雍時期，由於實行“湖廣填四川”，移民農墾，農業生產逐步恢復，人口增長，經濟亦趨繁榮，茶葉業生產也獲得恢復與發展。此時，在種茶麵積、茶葉的產量以及政府的茶引收入，比起明代都有大幅的增長。但在清中期，由於政府重在茶葉稅收，剝奪農民利益，茶農無力經營，茶葉減產，致使這時的川茶業出現了中衰的傾向。
而鴉片戰爭以後直到清末，中國逐步淪入半封建半殖民地的境地，中華民族處於水深火熱之中。長期在國際茶葉市場首屈一指的世界茶葉老大逐漸被印度、錫蘭(今斯里蘭卡)、日本的茶葉業所排擠。更有甚者，印茶以各種辦法打入西藏市場，妄圖取代川茶地位，從而使川茶業發生嚴重危機。四川、西藏的地方政權對英人的經濟侵略進行了堅決抵制。當然，我們也應該看到，從古到今，川茶名茶輩出，歷來都是著名產區。蒙頂茶為蒙頂山上清峰所產，自唐迄清，一直是進貢上品。
關於此茶，歷來對它有多種神奇傳說，並美其名“仙茶”。灌縣(今都江堰市)茶也是進貢之佳品。在蒲村，柵口有石花茶園，其茶葉小且嫩，其芽猶如“六出茶”，所製茶葉均以其形象命名。味江則有雀舌、鳥嘴、麥顆、片甲、蟬翼等。邛州的白鶴寺、大塘鋪所產茶尤為佳妙，湯色黃綠明亮，香味雋永，清心爽口，是當之無愧的貢品。雅安寶興寺茶也是貢品名茶，產於七盤山寶興寺，茶品質絕佳，香氣四溢。城口雞鳴茶，味濃厚，如橄欖，飲時先苦而回甘，清道光修《城口廳志》載：“古茶園在八堡雞鳴寺後，相傳自明以來，即為茶園。茶樹皆明時植，所產之茶，較他處諸茶細嫩，又獨早，其味清香，愈於凡品。”
據清末《成都通覽》記載，全川共有六十餘廳州縣為產茶區。新增產茶州縣有：涪州、清溪、蘆山、馬邊、茂州、鹽源、南充、屏山、筠連、敘永、青神、銅梁、黔江、忠州、石柱、大竹、城口、彰明等地。
民國時期，四川茶業受到極大摧殘，日趨衰落。其根本原因是政治腐敗，軍閥更迭，加之戰禍不斷，橫徵暴斂，全省工農業生產受大摧毀性的破壞，茶葉生產也不例外，產量銳減，農商交困。
據統計，民國時期，四川共134縣，產茶縣約84個，佔全川縣總數的62.6%。據估計，宋代川茶茶葉產量最高時達到了3000萬斤，比同時期東南地區茶葉總產量還高23%。然後來，就一年不如一年，明代川茶產量不過8萬擔，清代茶葉產量有所提高，達到25萬擔。
民國時期，綜合各家估計的數字，全川每年茶葉產量只有18萬擔。民國時期，東南各省的茶葉大量出口，在國際茶葉市場的競爭中，茶葉在種植技術上也有相當的改進；但四川依然注重於內銷，相當封閉，因循守舊。
當時四川按茶葉的品類和傳統流向分為五大產區即：
西路茶：以灌縣為中心，有腹茶、邊茶兩種，又稱為“正西路茶”。其餘汶川、大邑、什邡等縣稱“西路邊茶”。
北路茶：以平武為中心，包括北川及甘肅南部茶區，供應本省邊、腹地及銷往蘭州。
南路邊茶：以雅安為中心，包括滎經、天全、名山、邛崍等。名山和邛崍已轉向生產腹茶，運銷成都、川北和陝甘，於是南路邊茶就只有雅安、滎經、天全所產了。
下河茶：又稱“南路邊茶”。本地區以下川南道屏山、峨眉、夾江、馬邊、高縣、筠連為主。原來該地區產腹茶，系腹茶產區。清末因南路邊茶不足以供打箭爐(康定)市場需要，經政府批准，採辦下河茶由水路運至雅安，製成邊茶。所以在相當時期，下河茶也納入南路邊茶的產地。
東路茶：以萬源、城口為中心，包括梁山、達縣和忠縣等地，除銷本省外，還運銷陝西。
民國時期，川茶按製造方法和形態有以下四大類：
其一紅茶類：包括白毫、花白毫、毛尖、熙春紅茶、金尖、金玉、金倉等。
其二綠茶類，有雀舌、雨前(穀雨前)茶、春茶等。
其三磚茶類，有紅磚茶、綠磚茶，都摻有粗葉和茶莖。
其四初製茶，有毛茶(茶農的初製品)和馬茶(即邊茶)，幹後用篦包裝，銷往藏區。
成都是歷史悠久的一座消費城市，也是四川腹茶的主要集散地和消費市場，《成都通覽·成都之茶》載：“成都之茶鋪多，名曰茶社，如文廟之甌香館則名館，順草湖之臨江亭則名亭，山西館口之廣香閣則名閣，亦不一定名曰社也。現經警署發有規則，每鋪皆用欄干，省城共計四百五十四家。在前之鬥雀、評得等事已禁止，惟評書、洋琴二事尚仍舊也。甕鍋之名甕子，水多系井水，俗名圓河水，可以隨意買回……勸業場開後遂發生特別茶鋪數家，茶香、水好、座雅、樓高，宜春樓、第一樓、懷園均好。”
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