由于进化心理学非常强调成功繁衍是人类所有行为的最终动机。于是，同性恋现象成了进化心理学家不得不面对的问题之一。
事实上，时至今日也没有一个进化心理学家能给同性恋现象提供一个合理的解释。也许同性恋现象并非某种心理层面的变化，如今科学家正积极谋求其在遗传学上的解释，并取得了一些成果。
如一些遗传学家通过研究，发现男同性恋的一些基因根源。他们并没有发现同性恋基因，但是他们确定了包含“X-q28”基因标志的染色体与此有关。即使最后找到同性恋基因及其序列，但是仍然无法解释——在绝大多数同性恋个体里，这些基因是如何存活下来并延续下去的。
男性同性恋的基因可以遗传给后代，但是并非通过男同性恋者本身遗传，而是由他们的姐妹或其他女性亲属遗传。遗传学家假设同性恋基因驱使男性或女性做出同样的行为——渴望与男性发生关系。
如果携带该基因的生物体是男性，那么他就会成为男同性恋。如果携带同性恋基因的生物体是女性。那么热爱男性，并处于卖方市场的她们，其子女肯定多于没有携带同性恋基因的女性。因为他们的男性性伴侣较多，男同性恋失去的繁衍机会，会由他们这些具有繁衍能力的姐妹弥补回来，从而使男同性基因得以延续。
以上论述被科学界称为“色情姐妹假说”。该假说自诞生以来争议不断，但是最近已经有研究足够支持该项理论：男同性恋的母系家族里其女性成员的子女，比男异性恋的母系家族的子女要多。
但是学者们也发现男同性恋者能够延续至今，最可能的原因是在大多数的历史时期中，迫于社会规范和法律规定的压力，男同性恋只能隐瞒兴趣取向，像其他男性那样结婚生子将同性恋基因遗传下去。若果真如此，那么同性恋解放运动，只会导致同性恋者绝迹。
到目前为止，还没有学者能够就基因的角度，解释女同性恋倾向。
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