林蛋大66
兩所大學都是教育部直屬，985，211，雙一流，都是各自省內最強的大學。下面從幾個方面對比：
一是大學排名。
山東大學校友會排名20。
南京大學校友會排名8。
二是師資力量。
2018年，山東大學擁有在職教職工7493人（不含附屬醫院），共有教授1246人，博士生導師897人。其中，諾貝爾物理學獎獲得者Peter Grünberg受聘為特聘教授，研究生導師莫言教授榮獲2012年諾貝爾文學獎；中國科學院和工程院院士7人，雙聘院士63人，終身教授8人，人文社科一級教授16人；“千人計劃”國家特聘教授33人、“青年千人計劃”入選者33人；“長江學者獎勵計劃”特聘教授30人、講座教授15人、青年項目入選者3人；國家傑出青年科學基金獲得者37人、優秀青年科學基金獲得者22人；“萬人計劃”領軍人才15人、教學名師5人、青年拔尖人才10人；國家百千萬人才工程入選者29人；泰山學者攀登計劃入選者9人、泰山學者特聘教授（專家）108人、泰山學者青年專家18人。
南京大學有中國科學院院士28人，中國工程院院士3人，中國科學院外籍院士1人，第三世界科學院院士4人，俄羅斯科學院院士1人，加拿大皇家科學院院士1人，“千人計劃”創新人才30人、創業人才14人，“外專千人計劃”入選者2人，“萬人計劃”科技創新領軍人才4人、百千萬工程領軍人才1人、教學名師2人，教育部“長江學者獎勵計劃”特聘教授95人、講座教授25人、青年學者項目4人，國家傑出青年科學基金獲得者109人，國家級教學名師10人，國務院學位委員會學科評議組成員19人，國家級有突出貢獻的中青年科學、技術、管理專家16人，“973計劃”和重大科學研究計劃項目首席科學家36人次，“青年千人計劃”入選者91人，“萬人計劃”青年拔尖人才8人，教育部“新世紀優秀人才支持計劃”獲得者238人，“百千萬人才工程”國家級人選32人。81人擔任150餘種國際SCI（E）學術期刊編委會成員，其中21人擔任主編或副主編。
三是碩士和博士點。
山東大學碩士一級學科54個，博士44個。
南京大學專業碩士學位授權點25個、碩士學位授權一級學科8個；博士學位授權一級學科38個，博士學位授權二級學科點（不含一級學科覆蓋點）3個。
四是教育部學科評估。
山東大學8個A以上學科，最強的數學為A+，其餘馬克思主義理論 中國語言文學為A，
應用經濟學 外國語言文學 控制科學與工程 藥學 工商管理為A—。有31個B-以上學科。
南京大學21個A以上學科，最高評級為A+ 級，天文學、地質學、圖書情報與檔案管理。A級，哲學、社會學、中國語言文學、外國語言文學、中國史、物理學、生物學、計算機科學與技術、環境科學與工程、軟件工程、工商管理。A-級，理論經濟學、法學、數學、化學、地理學、生態學、電子科學與技術。有21個B—以上學科。
五是地理位置。
山東大學位於山東省，經濟發達，但是不如江蘇省。
南京大學地處全國最發達的長三角，地理位置優越。
綜上所述，南京大學綜合實力強於山東大學，但山東大學辦學規模大於南京大學。如果分數能夠上南京大學學科評估B類以上專業，首選南京大學。
