1、硫酸銅
硫酸銅對細菌和病毒的殺滅作用較小，但有殺死細胞、藻類、真菌和原生動物的高效力。如果蝦池內浮游生物過多、蝦池水太肥，夜光藻和甲藻類等以及水中懸浮物多時，可用濃度為0.7毫克/升的硫酸銅溶液潑灑全池。用藥必須在晴朗天氣進行，用藥時不要投餌，3～4小時後水質逐漸變清，透明度達到理想值為佳，即在30～40釐米。如果沒有條件換水，慎用。硫酸銅的作用機制主要是銅離子能與蛋白質中的巰基結合，干擾巰基酶的活性而達到對病原生物的致死作用。但在蝦病暴發期間，如果多次使用硫酸銅消毒，使池內藻類全部死亡，水清見底，反而會促使對蝦迅速發病死亡，因而切不可亂用，必須慎重為好。
2、漂白粉
漂白粉具有較強的殺菌作用，2%的溶液能在5分鐘之內使細菌幾乎全部致死，也能殺死大量藻類而使生態系發生變化，因此需嚴格控制用藥量。
漂白粉是氯酸鈣、消石灰和氯化鈣的混合物，遇水生成次氯酸放出初生態氧，能氧化細菌的原漿蛋白，使其活性失去作用。氯與細菌蛋白質中的氨基結合成氯胺類化合物，使細菌失去活力。但漂白粉中有效氯含量不穩定，受光照、溼度、溫度及pH影響。pH偏高時藥效降低，pH為8以上時效果明顯減弱。所以，用生石灰時不要用漂白粉。
值得注意的是，在剛放苗後，儘量不用含氯消毒劑（漂白粉、漂白精、次氯酸鈉），因會迅速改變水體生態平衡，有機殘氯會刺激對蝦，引起蝦拒食，抗病力下降，而且易發生水質變瘦，藻類死亡，特別是下大雨前後使用含氯消毒劑危害更大。大多蝦池使用後會出現種種問題。大量的有機氯、氯酚、氯氨、臭氯味的產生，這種副作用會使正常的蝦中毒死亡，體弱的蝦易感染蝦病而死亡。所以用漂白粉是有學問的，不要隨意亂用。漂白粉較便宜，但使用要科學、否則，適得其反。下大雨或暴雨宜用石灰來調節pH和殺菌。總之，選用消毒劑要具體掌握。
廣譜殺菌劑納米銀能針對超過650種以上的細菌和病毒，超級納米銀擁有獨家制粒技術，將銀製成5—7nm的微小顆粒，可直接穿透細胞，銀的粒徑越小，穿透力越強，直接進入細胞內部，破壞細菌、病毒等的官能團，強效殺菌消毒！納米級顆粒直接穿透細菌的細胞膜，使其失去活性，不直作用於苗種，安全無刺激。
3、高錳酸鉀
選用高錳酸鉀作為消毒劑也要掌握好，要具體情況具體處理。高錳酸鉀能將水中有機物氧化，破壞病原生物蛋白，從而起到殺菌作用。但在鹼性或者微酸性水中，其會析出二氧化錳，影響對蝦的呼吸，使其鰓機能減退或脆弱，使用時也必須大量進水，否則會帶來不良後果。
另外，還可選用過氧化鈣進行蝦池消毒。因過氧化鈣遇水後逐漸放氧並生成氫氧化鈣，不汙染環境，它除有生石灰的優點外，還具有增氧作用。全池潑灑，濃度為3毫克/升，可起到殺菌消毒作用，但會引起水色變清，需及時施肥（可用雞糞發酵消毒來肥水），否則會給養蝦池帶來不穩定的水質。
目前市場上增氧產品種類繁多。傳統的增氧產品受技術和配方制約，一般為3-8小時集中放氧。該類集中放氧的產品短時間內迅速放氧，氧氣容易快速溢出水體，池塘存留效果差，且對養殖動物刺激性較大。同時使用成本高，並需要人工時時關注增氧情況。最新的技術是採用先進的緩釋技術和特殊配方，使氧氣可以在池底緩慢釋放，增氧效果長達30個小時以上。該類增氧產品成本低，放氧時間長久且持續，省時省事又省力。
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