目前全国各省市已经陆续开启了领证通道，多数考生已经领到了自己的执业药师证书，开始进入证书注册环节。
每年6~8月，是执业药师注册高峰期。如今，执业药师首次注册、再次注册、变更注册均可通过全国执业药师注册管理信息系统办理。与以往去省会城市现场办理相比，这种模式为办证人员节省了时间和经济成本，真正实现了“数据多跑路，群众不跑腿”。目前，北京、天津、河北等16个省（区、市）已实现执业药师注册网上全程办理。
往年，按照相关要求，通过资格考试的执业药师都需到相应省级药品监管部门现场递交资料，往返成本很高。有时还会因为材料不齐全，必须再跑一趟。执业药师普遍反映的“办事慢、来回跑”，曾经是执业药师注册管理中的痛点。
之前的注册流程大致是这样的：
为了全面推行执业药师注册网上全程办理，2017年，原国家食药监总局将“开展执业药师注册网上全程办理工作”列为省局年度考核指标之一。
相比现场办理，执业药师注册网上全程办理的手续更加简化、行政效率大为提高。执业药师足不出户，在网上填写信息，上传相关申报材料照片即可办理。执业药师首次注册、再次注册、变更注册及注销注册都可以在线办理，同时还可在线查询办理进度和审批结果。
已实现执业药师注册网上全程办理的16个省（区、市）食药监局还不断优化行政许可流程，压缩审批时限，以提供更好的服务。其中，上海市食品药品监管局落实“马上办、网上办、就近办、一次办”的要求，制定新的执业药师办事指南，在减时间、减环节、减资料等方面向所有行政相对人提供无差别便利化审批服务，将执业药师注册许可事项压缩到5个工作日。河北省食品药品监管局将执业药师首次注册、再次注册及注销注册的审批时限也由原来法定的20个工作日，缩短为10个工作日。从2018年7月1日起，陕西省执业药师注册审批也实行了网上全程办理，执业药师可在“网上申报·窗口受理”和“网上全程办理”两种方式中自行选择注册方式。在完成审批后，根据执业药师选择注册证领取方式，全省各地注册机构将通过快递和窗口自取两种方式将注册证送达到执业药师手中。
目前，已有43965名执业药师通过“网上全程办理”进行注册。实行网上办理后，真正实现了“零见面、零收费、无纸化”办理，省时省力，快捷方便。
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