落馬洲河套區，位於皇崗與落馬洲兩個口岸之間，面積約 99 公頃。落馬洲河套地區的歸屬權屬於深圳，但管制權給了香港特區，該地區於是成為了深圳的一塊 “飛地”。
那麼這塊特殊的“飛地”到底是怎麼形成的呢？落馬洲，與深圳市福田區皇崗僅一河之隔。據傳說，南宋末年宋帝曾駐驊於此，行人路過必下馬以示敬意，故名 “落馬洲”。此處原是一小山崗，在內地改革開放之前，曾一度在為外國遊客住足遠望中國內地的旅遊點；1989 年在此建成落馬洲口岸，成為香港與內地間的公路通道之一。
落馬洲土地原來屬於深圳市範圍。1990 年代末，港深兩地政府進行的深圳河治理工程竣工後，新舊河道在間形成一個河套區域，撥歸香港管理。
1997 年深圳河截彎取直的改造工程將這塊原本突出、三面環水的河套區變成了一個四面環水的小島，深圳河的新舊河道分別將其環抱。由於港深之間的分界線以深圳河河道的中間線為界，經歷了 1997 年對深圳河的改造工程之後，原先位於深圳河舊河道以北、屬於深圳的落馬洲河套地區成為了深圳河新河道以南、香港特別行政區邊境管制區的一部分。
根據當時的決策，落馬洲河套地區的歸屬權仍然屬於深圳，但管制權則交給了香港特區。
落馬洲站是港鐵的終點站，也是最後一個啟用的前九鐵車站。位於新界元朗區落馬洲一帶，服務東鐵線沿線前往中國大陸的乘客，已於 2007 年 8 月 15 日下午 4 時起啟用。本車站的興建目的為疏導羅湖站過境人流。
從落馬洲站經福田口岸過境至深圳，可接駁深圳地鐵龍華線福田口岸站，前往深圳地鐵沿途各站。落馬洲站位處邊境禁區內，鄰近深圳河，所有乘客必須持有有效禁區通行證或旅遊證件方可使用本站。
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