本能蜀黍
一、增值稅一般納稅人進項稅額大於銷項稅額出現留抵稅額，在申報過程中偶然出現是正常現象，其原因是驗證勾選的進項稅發票數額大於當月開出的發票數額。
二、國家稅務總局公告2017年第11號，第十條“自2017年7月1日起，增值稅一般納稅人取得的2017年7月1日及以後開具的增值稅專用發票和機動車銷售統一發票，應自開具之日起360日內認證或增值稅發票選擇確認平臺進行確認，並在規定的納稅期內，向主管國稅機關申報抵扣進項稅額”。也就是說你取得的專用發票可以在360天內驗證抵扣，記住是360天不是一年。
三、如果進項稅發票過多，這裡有一個方法可以控制每個月的納稅金額，既月未結賬時根據當月開出發票的金額按照80%的比例勾選驗證進項發票。例出當月開出發票100萬元，你有120萬元的進項發票，那麼你驗證80萬元的進項發票，餘下的40萬元留到以後月份驗證。這樣既保證了每個月交稅增值稅又避免了因為留抵稅額經常發生而引發的稽查風險。
國琮
對於一般納稅人而言，長期進項大於銷項，就是說增值稅長期應納稅款為零。交稅是根據企業經營情況來的，會計也是真實反映企業經營情況的。所以，只要是真實的業務，規範做賬報稅即可，不用過度關注。
但是，長期如此，必然引起關注，也會帶來一些不必要的麻煩。
一、一般納稅人的增值稅。
增值稅應納稅額=銷項稅額-進項稅額。
進項稅額較大，一般主要是企業初創時期或者大型製造企業。採購生產線、零部件、倉儲等的進項較大，暫時銷售較少，產生銷項小於進項。
注意：增值稅申報時，認證的進項當月及時申報，進項大於銷項的部分形成留抵稅款，抵扣後期的銷項即可。
二、長期留抵的影響。
長期存在大量留抵稅款，不繳納增值稅稅款，稅局金三系統必然會引起預警關注，從而比對各稅種報表，企業所得稅的收入利潤等，當然業務真實是不怕比對的。
但是，誰也不願意讓稅局盯上，哪個企業也保不準一點問題沒有。這就需要企業會計與稅局及時溝通，說明情況，確實業務剛開展銷售低，預計何時盈利。還是最近新上的設備，企業擴大投資等等。
溝通非常重要，互相瞭解情況，大家都不會瞎猜。
三、留抵退稅出新政。
2019年深化增值稅改革政策，4月1日起，稅率調整16變13，10變9，同時增加了一項增量留抵退稅政策。
19年4月1日後產生的新留抵稅額，滿足一定的條件下可以申請退稅啦。具體參考本人往期回答。
北辰說財稅
我是一名稅務工作者，我根據自己的一點經驗回答你的提問。
首先說，公司在一定時間段內進項大於銷項的情況一般出現在公司的初創階段，由於公司新開業，購進存貨，固定資產的業務較多，而此時銷量較少或無銷售，因此導致這一階段內進項稅額大量留底，這屬於正常現象。
其次，由於納稅人長時間存在留底，就自然會導致申報時“應納稅額”為零，公司不用繳稅，不佔用企業流動資金，有利於企業開展企業業務經營活動，這就是你所詢問的對企業有哪些好處。
最後，如果企業長期進銷項倒掛，“應納稅額”長期為零，會因此引起目前稅務徵管系統的自動關注，會作為風險疑點推送給主管稅務機關，那麼，稅務稽查或評估人員可能會及時約談企業，讓企業解釋這一現象。如果解釋不到位，就會進一步調查核實。
