牛牛愛妞牛
“兩種版本”不明確呢，所以會寫出我知道的所有可以被視為“遊戲王同一個卡有兩種版本”的情況，且因為實卡玩家間的價格差距由多種因素決定（實際上，舊卡的品相相對版本的影響更大），所以僅討論不同版本的卡在打牌上是否不同。
其一，兩個版本卡圖不同
遊戲王中同一張卡可能有不同的卡圖，這一類卡不少，但也並不是所有卡都能有這樣的待遇，一般有不同卡圖待遇的，都是主角相關卡，或者情懷度較高的卡，例如遊戲王中最著名的[青眼白龍]，她目前就有8種卡圖，未來還極有可能有新的卡圖。多卡圖的原因簡單粗暴，情懷向卡一般都是收來看畫，打牌能上場的機會不多（當然，白龍在現環境打牌時同樣能用，畢竟有三隻守護龍當大腿orz），精明如K社，總會在某個有說頭的地方，將情懷卡拿出來，重繪個卡圖，從而收割一波錢包。這時兩個卡圖不同的卡在打牌上沒有什麼不同。
（白龍目前有8個不同的卡圖）
其二，兩個版本罕貴度不同
同一張卡，甚至同一張卡圖和描述的情況下，有可能有多個版本的罕貴度。遊戲王的罕貴度有很多，如今數字補充包中常見的罕貴度有n,r,sr,ur,utr,ser,scr,hr，特殊包裡的罕貴度有pr,gr,gsr,gscr,ggr,cr,mr,kc等等，罕貴度在一定程度上代表了其稀有度，但其實很多高罕卡並不稀有（例如在高罕全閃復刻包中），不同罕貴度存在的意義主要是拉開不同卡片的身價，從而撐起TCG類卡片的交易系統（TCG全稱為trading card game，顧名思義，玩家間的卡片交易是玩法的一部分），這些卡只是有不同的閃法，打牌時沒有什麼不同。
（同一張卡圖的黑魔術少女在15AY中是UR，15AX中就是SER）
其三，兩個版本效果不同
同一張卡有不同效果的兩個版本這種事是存在的，它們一般是曾經的禁卡。遊戲王中的禁卡有些會因為環境的變化而變得不是那麼強力，從而解禁，但有的禁卡卻因為環境的更迭變得越來越強，這類禁卡如果還算經典，則一般會獲得修改效果解禁的待遇，例如[三眼怪]，其舊效果“這張卡從場上送去墓地時，從自己卡組把1只攻擊力1500以下的怪獸加入手卡”太過簡單粗暴，以目前的趨勢看來，基本沒有解禁的可能，所以其效果在2016年4月1日被修改，且同時解禁，修改後的效果為“「三眼怪」的效果1回合只能使用1次。①：這張卡從場上送去墓地的場合發動。從卡組把1只攻擊力1500以下的怪獸加入手卡。這個回合，自己不能作這個效果加入手卡的卡以及那些同名卡的發動”，並沒有失去三眼怪原本的特點，也避免了其配合各種雜技卡組為所欲為。沒有修改效果的舊版卡在打牌中同樣被承認，也可以使用，但規定要以修改後的新效果為準，所以打牌的話還是沒有什麼不同。
（修改了效果的三眼怪，當然，圖中這兩張卡的稀有度也不同，前面的是GR，後面的是N）
其四，兩個版本效果相同，但是描述方式不同
還有一些卡，雖然是同一張，效果也一樣，但會有不同描述方式的兩個版本，這是因為在規則變更的同時，K社會一起優化舊卡的效果描述，從而讓舊卡的效果描述變得更規範，例如[死者蘇生]，就被修改為“以自己或者對方的墓地1只怪獸為對象才能發動。那隻怪獸在自己場上特殊召喚”，和新的描述格式看齊。這種沒有修改效果，只是規範了描述的卡在打牌上自然沒有什麼不同。
（修改了描述方式的死者蘇生，實際上新版與舊版在卡面的結構上也是不同的，舊版的效果描述框較小，且各處的間隙都較大）
歸根結底，因為遊戲王的基底託生於實卡，實卡修改或者更新時，沒辦法將舊版一起更新，所以會出現不同版本的同一張卡，但實際打牌上來說，它們都被承認，且都以新的版本為準。
庫拉評番
混沌力量：遊戲篇、海馬篇、城之內篇，主要差別是卡的數量與禁卡時期
ygo：主要差別是在禁卡時期與新卡
動畫：是卡的區別除了通用卡，其他卡都有更新
GB（GBA）版本：主要差別在遊戲模式上
