清同治十年(1871 年)，左宗棠鎮壓了金積堡回民起義後，遷永寧望洪堡回民於靈州 (今靈武)城南安插。當時到達靈州城南五公里處的30多戶100多口回民，看到這裡地勢較高且平坦，交通，灌概便利，相對於四周的汪洋大湖，確實是一處難得的高臺子”，於是便在此安家落戶。
次年，由回民群眾集資建起了包括6間禮拜殿、2間水房、2間阿訇住房的臺子清真寺。
到了民國四年(1915年)，居民增加到53戶、300多口人。顯然臺子清真寺已不適應需要，於是群眾集資建起了一座包括15間禮拜殿、阿訇滿拉住房和水房各6間的清真寺。
到了民國二十二年(1933)，由於住戶和禮拜人數的增多(平時有1百多人，開齋節和古爾邦節會禮時達5百餘人)，於是群眾齊心協力，又集資將該寺擴建為包括有三進院落的大寺，佔地3千多平方米，另有寺田24畝2分。前院是邦克樓和14間水房，中院是禮拜殿和殿前南北共27間廂房，後院是14間教室。
整個寺院佈局合理，結構精巧，宏偉壯觀。加之近處湖水清清，楊柳依依,遠處山色膝朧，靈州古城、鎮河塔、烽火臺依稀可見，登上邦克樓遠眺或近觀，風光旖旎，景色宜人。
1923年10月，法國古生物學家德日進、桑志華來到崇興，拍下數十張臺子清真寺照片，成為寧夏目前發現最早的清真寺相片。
這裡民風淳樸，群眾樂善好施，待人如敬如賓。
1935年秋，一位從江南來大西北採風的孫幼真先生途經這裡，看到這美麗雄偉的清真寺和勤勞善良的人民,寫下了《寧夏鄉間一座極壯麗的建築一一臺子寺》，刊登於1936年南京出版的《晨熹》8卷6期。
1934年寺內設國民小學一處，有 學生120人。
1938年馬鴻逵在寺內設立阿訇教義國文初級講習所。
1945年開辦女子學校一處，有學生60人。
1949年9月，中國人民解放軍經過臺子清真寺時，受到開學阿訇和全坊回族穆斯林群眾的熱烈歡迎。
遺憾的是這座清真寺在十年動亂中被拆毀。 黨的十一屆三中全會以後，撥亂反正，宗教政策得到貫徹落實，1982年全坊回族群眾集資建起佔地4千多平方米的新寺。有可容納5百多人禮拜的54間、480平米的禮拜殿，建有沐浴室、阿訇滿拉住房、接待室等共43間390平方米。 寺內打有機井，建有簡易水塔，大小淨用自來水。
1999年由於吳靈青公路擴建、墊高，寺內汙水無法排除。在全坊高目的集資、獻料、贊助下臺子清真寺於2001年第四次重建，建成仿古式大殿786.4平方米、沐浴室456.3平方米、配房，教學室284.5平方米、捲棚138.7平方米、女學室138平方米、衛生間36.4平方米，共1840.5平方米，佔地面積4950.5平方米。
自清同治11年(1872)建寺至今，先後有14位開學阿訇，他們是：楊阿訇(名不詳)、王天錄、王三、馬穆薩、楊金山、王洪恩、楊文喜、楊大江、楊文華、馬生喜、張學明、馬龍、楊得善、馬子安等。培養了一大批教職人員。該寺是寧夏影響較大的清真寺之一。
臺子清真大寺屬伊合瓦尼，現在全坊有4百多戶、8千多人。近年來阿訇利用主麻日向廣大群眾宣傳黨的政策和法令，促進了穆斯林群眾和漢族群眾之間的團結友愛、互幫互助。
全坊群眾遵紀守法、勤勞致富、鄰里和睦。同時由於阿訇積極帶頭，以身做則，臺子村自1982年以來在計劃生育、交售公糧、植樹造林等方面取得了突出成績，從未發生過一起刑事案件。因此臺子村先後被靈武縣、銀南地區命名為第一批“文明城”之一，臺子清真大寺也在1984年被評為寧夏回族自治區伊斯蘭教為四化服務先進集體。
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