音忍四人眾
組織成員：
鬼童丸、多由也、左近&右近、次郎坊
在大蛇丸招收精英的音忍村中，四人眾是其中的精英份子，負責護衛大蛇丸，能讓野心家大蛇丸如此信任的人，可想而知他們的實力十分強大。（備註：初期岸本筆下很厲害而已）
從最初的木葉崩潰戰中，四人使用連三代目火影都無法破解的忍法·四紫炎陣開始，到潛入木葉誘惑佐助沒人發現，並且擊敗兩個特別上忍，一直到現在的佐助投靠音忍為止，他們與眾木葉下忍的戰鬥也體現出了他們各自的能力。
在奪回佐助的任務中，他們先後被秋道丁次、日向寧次、牙（勘九郎）、鹿丸（手鞠）、小李（我愛羅）擊敗。
忍刀七人眾
組織成員：（分為四批成員）
第一批成員：枇杷十藏、西瓜山河豚鬼、慄霰串丸、通草野餌人、無梨甚八、黑鋤雷牙、（其中一位路人甲）
第二批成員：桃地再不斬、幹柿鬼鮫、林檎雨由利、鬼燈滿月（僅四人）
第三批成員：鬼燈水月、長十郎（僅兩人）
第四批成員：由尾道八朔、幹柿屍澄真、蛇莓、笛吹巨蜂、鬼柚子一朗太、黑鋤文淡、枸橘神樂
忍刀七人眾《火影忍者》系列及衍生作品中的稱號，這是一個可繼承性的稱謂，七個人都配有一把非常適合自己忍術的忍刀，實力在上忍中也屬於罕見的，傳說七人聯手可以在一夜之間攻陷一個小國。
原本專門為歷代水影執行高難度的任務，但由於四代目水影
長期被宇智波帶土的幻術所操控，導致霧隱村變得天昏地暗，忍刀七人眾中很多優秀的忍者也因不滿村子的暴政，而紛紛逃走。 鷹小隊
組織成員：
宇智波佐助、鬼燈水月、香燐、重吾
鷹小隊是日本動漫《火影忍者》中的一個忍者四人小隊，由佐助招募並組建的隊伍，四名隊員都是身懷稀有能力的特殊忍者。最初組建時名為“蛇”，目標是殺死佐助的哥哥——滅族兇手宇智波鼬。
佐助將鼬殺死後，從“宇智波斑”（宇智波帶土）口中得知鼬滅族的真相，於是為了替鼬報仇而將“蛇”改變成“鷹”，目標也改為毀滅木葉，“鷹”最後隨著佐助在第四次忍界大戰中的轉變而取消了原有目標。
根組織
組織成員：
信、佐井、山中風、油女取根、油女龍馬、寺井、藥師野乃宇、大和、旗木卡卡西、信樂狸、大蛇丸（一度為團藏手下，後退出）、藥師兜（在團藏的要挾下加入，誤殺養母野乃宇之後脫離）
根，又稱“暗部培訓部門”，但不屬於暗部，是一個獨立的團體。《火影忍者》及其衍生作品中的一個神秘組織。
在猿飛日斬繼任火影后，志村團藏以暗部培訓部的名義成立屬於自己的獨立組織“根”，正如一棵樹由根生出一樣，這一組織把自己比作支持木葉這棵大樹的基本，所以用“根”來命名。並以領導者的身份在暗處活躍著。
他深深繼承了第二代火影冷酷的思想，信念是徹底遵守規定，由於日斬沒能延續第二代火影治理宇智波一族的基本方針，因此使團藏揹負起了村子的黑暗。
在宇智波滅族事件之後，下令解除團藏“火影輔佐”的職務，讓“根”這個組織解散。在疾風傳中，該組織再次出現，估計是得到木葉兩位顧問的支持，得以繼續重組。
守護忍十二士
組織成員：
猿飛阿斯瑪、地陸、北子、南午、西都、東卯、和馬、激進派其餘五人不詳
“守護忍十二士”是負責保護火之國大名的十二位精英忍者，是大名的私人獨立直屬部隊，實力非常強大，標誌是腰上的“火”字腰布。
木葉忍者村三代目火影的次子猿飛阿斯瑪、火之寺住持地陸曾經屬於這個組織。
奈良鹿丸在阿斯瑪死後也曾被邀請加入，但被鹿丸本人拒絕。
TV原創劇情守護忍十二士章中，“守護忍十二士”因內部矛盾而解散，分裂成以阿斯瑪為首的穩健派和以和馬為首的激進派。
和馬刺殺大名失敗，與阿斯瑪一行對抗，最終大量人員傷亡，“守護忍十二士”也因此徹底解散。
曉
組織成員：
帶土、鼬、長門、小南、彌彥、迪達拉、大蛇丸、蠍、絕、十藏、飛段、鬼鮫、角都、佐助、香磷、重吾、水月
“曉”，《火影忍者》及其衍生作品中的一個秘密組織。成員身穿繡著紅雲的黑色風衣，頭戴繫著風鈴的斗笠，相應手指佩戴標有自己代號的戒指（右手大拇指到左手大拇指依次為：零、青、白、朱、玄、空、南、北、三、玉），指甲塗有指甲油，護額上有一道劃痕。平時執行任務時兩人一組一起行動。
兩任首領分別為彌彥和長門，最初目的是為了給自己的國家帶來和平，後彌彥的死亡導致長門墮落，長門對曉進行了改革，改變了曉的計劃，目的是收集尾獸。
長門死後帶土則成了“曉”的首領，並挑起了第四次忍界大戰。
木葉十二小強（木葉天團）
組織成員：
木葉12小強指《火影忍者》中主要記述的“第七班”“第三班”“第八班”“第十班”共十二名年輕忍者，包括——漩渦鳴人，宇智波佐助，春野櫻，日向寧次，李洛克，天天，日向雛田，犬冢牙，油女志乃，奈良鹿丸，秋道丁次，山中井野。
哈哈是不是沒想到，這個最強組合！岸本大手筆！
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