音忍四人众
组织成员：
鬼童丸、多由也、左近&右近、次郎坊
在大蛇丸招收精英的音忍村中，四人众是其中的精英份子，负责护卫大蛇丸，能让野心家大蛇丸如此信任的人，可想而知他们的实力十分强大。（备注：初期岸本笔下很厉害而已）
从最初的木叶崩溃战中，四人使用连三代目火影都无法破解的忍法·四紫炎阵开始，到潜入木叶诱惑佐助没人发现，并且击败两个特别上忍，一直到现在的佐助投靠音忍为止，他们与众木叶下忍的战斗也体现出了他们各自的能力。
在夺回佐助的任务中，他们先后被秋道丁次、日向宁次、牙（勘九郎）、鹿丸（手鞠）、小李（我爱罗）击败。
忍刀七人众
组织成员：（分为四批成员）
第一批成员：枇杷十藏、西瓜山河豚鬼、栗霰串丸、通草野饵人、无梨甚八、黑锄雷牙、（其中一位路人甲）
第二批成员：桃地再不斩、干柿鬼鲛、林檎雨由利、鬼灯满月（仅四人）
第三批成员：鬼灯水月、长十郎（仅两人）
第四批成员：由尾道八朔、干柿尸澄真、蛇莓、笛吹巨蜂、鬼柚子一朗太、黑锄文淡、枸橘神乐
忍刀七人众《火影忍者》系列及衍生作品中的称号，这是一个可继承性的称谓，七个人都配有一把非常适合自己忍术的忍刀，实力在上忍中也属于罕见的，传说七人联手可以在一夜之间攻陷一个小国。
原本专门为历代水影执行高难度的任务，但由于四代目水影
长期被宇智波带土的幻术所操控，导致雾隐村变得天昏地暗，忍刀七人众中很多优秀的忍者也因不满村子的暴政，而纷纷逃走。 鹰小队
组织成员：
宇智波佐助、鬼灯水月、香燐、重吾
鹰小队是日本动漫《火影忍者》中的一个忍者四人小队，由佐助招募并组建的队伍，四名队员都是身怀稀有能力的特殊忍者。最初组建时名为“蛇”，目标是杀死佐助的哥哥——灭族凶手宇智波鼬。
佐助将鼬杀死后，从“宇智波斑”（宇智波带土）口中得知鼬灭族的真相，于是为了替鼬报仇而将“蛇”改变成“鹰”，目标也改为毁灭木叶，“鹰”最后随着佐助在第四次忍界大战中的转变而取消了原有目标。
根组织
组织成员：
信、佐井、山中风、油女取根、油女龙马、寺井、药师野乃宇、大和、旗木卡卡西、信乐狸、大蛇丸（一度为团藏手下，后退出）、药师兜（在团藏的要挟下加入，误杀养母野乃宇之后脱离）
根，又称“暗部培训部门”，但不属于暗部，是一个独立的团体。《火影忍者》及其衍生作品中的一个神秘组织。
在猿飞日斩继任火影后，志村团藏以暗部培训部的名义成立属于自己的独立组织“根”，正如一棵树由根生出一样，这一组织把自己比作支持木叶这棵大树的基本，所以用“根”来命名。并以领导者的身份在暗处活跃着。
他深深继承了第二代火影冷酷的思想，信念是彻底遵守规定，由于日斩没能延续第二代火影治理宇智波一族的基本方针，因此使团藏背负起了村子的黑暗。
在宇智波灭族事件之后，下令解除团藏“火影辅佐”的职务，让“根”这个组织解散。在疾风传中，该组织再次出现，估计是得到木叶两位顾问的支持，得以继续重组。
守护忍十二士
组织成员：
猿飞阿斯玛、地陆、北子、南午、西都、东卯、和马、激进派其余五人不详
“守护忍十二士”是负责保护火之国大名的十二位精英忍者，是大名的私人独立直属部队，实力非常强大，标志是腰上的“火”字腰布。
木叶忍者村三代目火影的次子猿飞阿斯玛、火之寺住持地陆曾经属于这个组织。
奈良鹿丸在阿斯玛死后也曾被邀请加入，但被鹿丸本人拒绝。
TV原创剧情守护忍十二士章中，“守护忍十二士”因内部矛盾而解散，分裂成以阿斯玛为首的稳健派和以和马为首的激进派。
和马刺杀大名失败，与阿斯玛一行对抗，最终大量人员伤亡，“守护忍十二士”也因此彻底解散。
晓
组织成员：
带土、鼬、长门、小南、弥彦、迪达拉、大蛇丸、蝎、绝、十藏、飞段、鬼鲛、角都、佐助、香磷、重吾、水月
“晓”，《火影忍者》及其衍生作品中的一个秘密组织。成员身穿绣着红云的黑色风衣，头戴系着风铃的斗笠，相应手指佩戴标有自己代号的戒指（右手大拇指到左手大拇指依次为：零、青、白、朱、玄、空、南、北、三、玉），指甲涂有指甲油，护额上有一道划痕。平时执行任务时两人一组一起行动。
两任首领分别为弥彦和长门，最初目的是为了给自己的国家带来和平，后弥彦的死亡导致长门堕落，长门对晓进行了改革，改变了晓的计划，目的是收集尾兽。
长门死后带土则成了“晓”的首领，并挑起了第四次忍界大战。
木叶十二小强（木叶天团）
组织成员：
木叶12小强指《火影忍者》中主要记述的“第七班”“第三班”“第八班”“第十班”共十二名年轻忍者，包括——漩涡鸣人，宇智波佐助，春野樱，日向宁次，李洛克，天天，日向雏田，犬冢牙，油女志乃，奈良鹿丸，秋道丁次，山中井野。
哈哈是不是没想到，这个最强组合！岸本大手笔！
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