京都大學（Kyoto University），是日本以及亞洲乃至全世界著名的頂級綜合研究型大學之一，其本部位於日本京都市左京區。京都大學擁有核能原子爐研究所，iPS細胞研究所，防災研究所，靈長類研究所等多個世界頂尖且唯一的科研機構。作為日本最高學府之一，京都大學在全球都享有極高的聲譽，被譽為“科學家的搖籃”。
京都大學在2018與2019年泰晤士高等教育日本大學排名中位列日本第1位，2019年上海交大世界大學學術排名中位列全球第32位，日本第2位，在自然科學和生命科學領域均位列全球第21位；在2020年QS世界大學排名中，京大排名全球第33位。
迄2019年，京都大學已誕生了11名諾貝爾獎（亞洲地區諾貝爾獎得主數量最多的大學）、3名菲爾茲獎、1名高斯獎、5名拉斯克獎、1名陳省身獎、9名京都獎、3名日本國際獎、114名日本學士院獎、6名沃爾夫獎、4名芥川獎得主，
日本唯一的達爾文-華萊士獎章得主，以及五位日本首相，其世界500強企業CEO校友數居全球第12名，可謂巨擘輩出，畢業生在科研學術界乃至政界商界普遍擁有舉足輕重的地位。
京都大學創建於1897年，最初名為“京都帝國大學”；二戰後，正式更名為“京都大學”；2004年改組為國立大學法人京都大學。京大是東亞研究型大學協會成員，日本文部科學省的“超級國際化大學計劃”A類頂尖校和指定國立大學，學術研究懇談會成員，入選日本G30、卓越研究生院計劃、領先研究生院計劃、日英RENKEI項目。
京都大學現共有10個學部，各學部所屬系科及附屬設施有文學部，含文學、史學、哲學及人際學4系，共51個講座，並設有文學博物館、中亞研究所等；
教育學部，含教育學、社會學、心理學3系共14個講座；
法學部，僅有法律學一個系含公法、民刑法、基礎法學及政治學4科共39個講座，附屬圖書館中設國際政治法律文獻中心；
經濟學部，含經濟學、經營學2系共11個講座；
理學部，為京都大學最大的學部之一，幾乎包括自然科學各個領域，即有數、理、化、生、宇宙、地球科學等9個系共70個講座，各系既相互獨立又相互交叉，
設施有兩個天文臺，8個火山、地震、氣候、天體學等方面的觀測所，4個海洋實驗所，一個植物園等；
醫學部，含有基礎和臨床兩大分部的若干系科共有39個講座，附屬機構有校醫院，腦神經研究、免疫學研究設施，人體先天異常標本中心，綜合解剖中心，動物實驗設施等。
工學部，是京都大學最龐大的學部，含24個系168個講座，研究領域涉及冶金、電氣、自動化、航空、機械、原子能、土木建築、化工、交通、信息工程等，附屬機構有離子工程，自動化研究所、環境微量汙染防治、重質炭資源轉換等工程研究設施；
藥學部，含藥學、製藥化學兩系共13個講座，附設藥用植物園；
農學部，含10個系53個講座，並有附屬農場、林場、牧場、及供農學研究、亞熱帶作物、水產、細胞培養、農業會計等方面進行研究的設施等。
根據日本大學偏差值（入學難度）的排名，京都大學在絕大部分學科上的難度都是與東京大學並列第一。其中醫學部，工學部，理學部 是京都大學的優勢學科，為日本甚至亞洲頂尖水平。其醫學部誕生過多名諾貝爾獎生理醫學獎得主，工學部工業化學科誕生過多名諾貝爾化學獎得主。經濟學部，法學部等其他學部相對來說略顯遜色，但仍然穩坐日本前三的位置。
科研
基礎理論研究
在基礎理論研究方面，京都大學更是走在日本各大學的前頭，影響最大的是以湯川秀樹為首任所長髮展至今的基礎物理研究所，現已成為世界基礎物理理論研究的中心之一，研究領域包羅了天體物理、基本粒子、原子核、宇宙、統計物理、物性等諸多方面。湯川因基本粒子的中子物理研究於1949年獲得了日本第一個諾貝爾獎。現今，每年一次的湯川國際討論會吸引了世界各國的科學家來京大交流、討論理論研究的進展。“湯川財團”獎學金向國外招募長期或短期研究人員來京大進行合作研究。在化學反應理論研究方面，福井謙一的量子化學邊界軌道理論已應用於化學工程，
1981年獲得了諾貝爾獎。數理分析研究溝通了自然科學和社會科學兩大領域。藉助數學模型的方法已愈來愈普及到對許多理論問題的研究，並實現計算機處理的程序化。病毒的研究、癌的發生和遺傳理論也有所進展。通過對猿猴等靈長類動物的形態、生理、心理、神經活動、社會行為、生物學基礎等方面的研究，為探討人類這些方面的客觀狀況和規律取得了許多進展。
核科學研究
在核科學研究方面，無論是理論研究還是工程運用研究，美國學者也不得不承認，京都大學已走在國際的前沿。從組織上，京都大學有工學部的原子核工程系，有理學部的關於原子核和基本粒子的眾多學科，有原子能研究所、核反應堆研究所、螺旋質普儀核聚變研究中心，基礎物理研究所等眾多機構都參與的研究中心，有著一流的研究人員和一流的研究設施。核反應堆研究所的熱功率達5000千瓦的核反應堆及其他各種實驗裝置，可供每年5000名研究人員來所進行工作。在螺旋質普儀核聚變研究中心，日本政府耗資80億日元建立了世界最大的核聚變反應爐，溫度可達千萬度。連同重質炭同位素資源的轉換工程研究，為日本開發新能源和節能研究邁出了重要的一步。
醫學教育與研究
在醫學教育與研究方面，除學科齊全的醫學部和藥學部外，還有設備先進、功能多樣的附屬醫院。後者佔地150,187平方米，有病床1,081張，僅1989年一年中，接診的校內外病員分別為33萬和44萬人次。此外，具有特色的胸腔疾病研究所和附屬醫院，
也有160張病術，每年接待近10萬名病員。連同人體先天特異標本解剖中心、綜合解剖中心、藥用植物園、實驗動物研究等設施，使京大在腦神經、免疫、胸腔疾病、癌、新藥合成等醫藥研究領域成果卓著。據不完全統計，至今醫學部有數十名人員獲得日本科學院獎或其他方面的表彰與獎勵。藥學部矢島治明教授，1981年率先完成了含有128個氨基酸的核糖核酸酶合成全過程並得到結晶，因而獲日本科學院獎。佐佐木隆獲得日本第二屆文化勳章。利根川進因其卓越的研究成果而摘取諾貝爾生理學醫學獎的桂冠。另外，化學所在抗癌藥物的篩選，病毒所在癌的發生與遺傳方面的研究均處於一流水平。
人文科學研究
在人文科學的研究方面，京都大學同樣十分重視具有自己的特色，在京大歷史上也出現了不少世界著名的優秀學者，有的還得到日本文化勳章，如日本哲學宗師西田幾多郎，法學的佐佐木恣。中國史的的貝冢茂樹，中國文學的吉川幸次郎等。文學部附屬文學博物館收藏有5萬年以前至今的許多珍貴出土文物，其中不少是國寶。還有來自日本、高麗、中國、印度、中亞、埃及、歐洲和美洲等國的達20萬件古代展品。1987年對外開放，展品在日本和其他國家多次展出。
文學部另一機構中亞研究所（羽田會館）藏有許多早年從中國瀋陽帶過去的重要文物的攝影和一萬多種重要文獻資料，在國內外享有極高的聲譽，因而京都大學文學部成為外國留學生最為憧憬的留學之地。校屬人文科學研究所設有日本、東方、西洋三部，其中尤以東方研究部的中國研究最為著名，以中國的社會、政治、歷史、革命史、古典文學為重點，在唐詩、元曲、尚書正義、天工開物、漢書律曆志的研究上遠勝於日本其他大學，為世界大學中的佼佼者。所內藏有研究漢學的珍貴中國文獻41萬冊，其中有些是連中國國內也難找到的。比如商甲骨文、漢籍拓本，以及日本從我國各地帶回來的像片、地圖、錄像帶、縮微影片等。考古研究中心發掘、調查、研究進而保護古城京都的歷史古蹟起了重要作用。
農學研究
在農學研究方面，農學部的農業會計研究設施在農業會計學和農家經濟分析學方面為日本唯一的研究與教育普及部門；植物生殖設施在植物的起源、分化、傳播、遠緣雜交、遺傳資源的收集保存等方面顯示出該資源的優勢，被國際遺傳資源理事會認定為“基本銀行”而成了國際活動中心。
京都大學與東京大學雖為日本東西兩方同等齊名的國立大學，但它們的傳統與辦學目標迥然不同。東大以培養治國人才為主；京大則以培養科學家見長。所以，儘管到目前為止京都大學只出過近衛文麿和池田勇人兩名首相，也少有著名的科學家活躍於日本政壇，但在科學研究方面，人才和成果都不少，因而被人們稱為“科學家的搖籃”。特別引以自豪的是，在1949-1987年的39年中，
日本獲諾貝爾獎的7名得主中京大就佔4名（又有人說是四個半，其中一位原在京都大學就讀後轉入東京大學）：湯川秀樹、朝永振一郎、福井謙一、利根川進，多於東大。獲日本文化勳章和日本科學院獎以及其他方面獎勵的更是數不勝數，這些成就的取得同它的優秀傳統是分不開的。
京大從創校以來就有理重於文的傳統，在全校的學部、研究所、教學與科研中心中理科明顯佔優勢。一向注重於學術上的高標準，尤以理科著稱，因而形成了自在特色的“京都學派”。人們曾這樣形容“京都學派”：京都大學的學者教授們“十分執著於理論研究，即使在常人看來芝麻一樣的小事，京大教授了會饒有興趣，只要合乎學術道理的，就會義無反顧地去做”。這個學派最早是京大文學部著名的哲學家西田幾多郎以及他的弟子田邊元、三木清等人倡導發起的，原意是指他們對日本哲學的研究有獨到的見解，後來日本學術界引伸為京都大學畢業出來的“不問實際，只管求知”的一群人。正是他們這種“興趣”和“執著”才使京大成了科學家的搖籃。
從機構的設置和科學研究的組織上也可以充分看出京都大學的特色。有不少研究所和中心是全國獨一無二的，先進的儀器設備和優良的研究環境為科學研究準備了得天獨厚的條件，研究人員如魚得水，因而無論在研究課題和研究成果上在日本均很有影響。這不僅可以從前述一些具有獨家性和獨特性的研究所建制中反映出來，而且一些研究設施也很引人注目。
實行對外開放，重視國際交流，亦是京都大學在國際上知名度不斷提高的一個重要原因。京都大學每年要派出近百名研究生出國學習。至於教員出國研究、調查、講學、參加國際會議等活動則更多，每年超過1500人次。學校鼓勵以個人、系、專業、研究等多種形式對外交流和開展合作，包括邀請國外學者攜帶課題來京大進行長期或短期合作研究。到1990年5月止，京都大學已接收來自世界55個國家和地區的764名留學生、600名訪問學者和研究人員，並同中國的清華大學、北京大學、同濟大學、武漢大學、復旦大學等校簽訂了校際交流協議。2018年7月3日，京都大學高等研究院代表團一行來訪上海科技大學物質科學與技術學院，雙方簽署了學術合作備忘錄並舉行了聯合學術研討會。
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