学习笔记:BiblioShiny使用介绍

本文基于公众号“玉树芝兰”《如何用R快速了解科研领域》撰写,感谢老师的分享。

BiblioShiny官方网址:https://bibliometrix.org/

BiblioShiny

Biblioshiny分为:

三个不同级别指标的分析和图表:

-来源

-作者

-文献

知识的三个结构(K结构):

-概念结构 :主题和趋势

-知识结构 :作者对该领域的影响力

-社会结构:作者、机构、国家如何彼此影响

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BiblioShiny思维导图

简单来说,这款工具可以对某一科研领域的作者、期刊、文献计量分析,无需敲打代码,就可以对该科研领域有一个简单的认识。

接下来的篇幅,主要围绕BiblioShiny各个模块介绍,大家可以根据需求进行相应分析。

数据

数据从Web of Science下载,选择数据库“Web of Science核心合集”,检索式主题“information serendipit*”or 主题“information encounter*”,时间跨度“所有年份”。

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检索式

对结果精炼,文献类型“ARTICLE”。

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只选ARTICLE

避免文献相关性过低,通过观察,选择前1000条。

导出格式选择“其他文件格式”,记录来源“1至500”,记录内容“全纪录与引用的参考文献”,文件格式“BibTex”。下一次导出,记录来源改变“501-1000”。将下载的文件保存为Archive.zip。

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选择其他文件格式


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文件格式"BibTex"

安装

通过官网安装R与Rstudio,安装后,在Rstudio中执行以下命令。

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安装命令

如果安装包过程中出现问题,有可能是镜像问题。

选择“Tools”中“Global Options”,Packages-CRAN Mirrors-China(Beijing)-enter键。

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镜像选择

安装成功,会跳出如下页面。

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biblioshiny界面

数据加载与过滤(Data&Filter)

选择Data-Import or Load,Import raw file(s)-Web of Science(WoS/WoK)-BibTex,将下载的wos数据上传,可以选择将bibliometrix文件另存为excel/R Data Format格式。

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数据加载

过滤:可以根据文献类型、出版年份、被引次数、来源。

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数据过滤

数据集

Main Information(部分)

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数据描述

Annual Scientific Production:每年发文量

Average Citations per Year:每年平均引用次数

Three-Fields Plot:可以更改不同字段、调整数目,绘制可视化图,记得Apply!

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Three-Fields

Sources(来源)

Most Relevant Sources:与该主题相关的期刊

Most Local Cited Sources:高被引期刊(当前文献集)

Bradford’s law:根据布拉德福定律划分出核心区

Source Impact:期刊影响因子

Source Dynamics:期刊出现次数

Authors(作者)

Most Relevant Authors:最高产作者

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Most Relevant Authors

其中,Fractionalized Frequency是作者对于论文的贡献率。

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Fractionalized Frequency

Author’s Production over Time:高产作者近期发文

Lotka’s law:洛特卡定律(核心作者)

Author Impact:作者影响因子

Most Relevant Affiliations:最高产机构

Corresponding Author’s Country:合著作者的国籍

其中MCP表示与其他国家作者合著论文的数量;SCP表示同国籍作者合著论文数量。

MCP_Ratio可以看出国际合作的比率高低。

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Corresponding Author’s Country

Country Scientific Production:各个国家发文量

Most Cited Countries:高被引国家以及被引次数

Document(文献)

Most Global Cited Documents:在web of science中高被引文献

Most Local Cited Documents:在当前数据集中高被引文献

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Most Local Cited Documents

Most Local Cited References:在当前数据集中高被引的参考文献

Reference Spectroscopy:每年参考文献的数量

Most Frequent Words:高频词

根据需求,更改字段。

Keywords Plus:WoS增加的关键词是和原文章相关的关键词,但是作者本人没有添加,为了增加文章在相关专题下的命中率。

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Most Frequent Words

WordCloud:词云

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WordCloud

TreeMap:树图

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TreeMap

Word Dynamics:词出现次数,展示词变化趋势

Trend Topics:根据当年词出现频次推测热点话题

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Trend Topics

Conceptual Structure(概念结构)

Co-occurrence Network:共现网络

可以选择对应词,确定与其相关联的其他词

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Co-occurrence Network

Thematic Map:主题地图

横轴:中心度;纵轴:密度

第一象限(右上角):motor themes,既重要又有良好发展;

第二象限(左上角):highly developed and isolated themes,已有良好发展,但是对于当前领域不重要;

第三象限(左下角):emerging or declining themes,边缘主题,也没有好的发展,可能刚刚涌现,也许即将消失;

第四象限(右下角):basic and transversal themes,对领域很重要,但是未获得良好发展。一般是指基础概念。

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Thematic Map

Thematic Evolution:主题演化

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Thematic Evolution

Factorial Analysis:析因分析

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Factorial Analysis

三种方法:

Correspondence Analysis:对应分析

Multiple Correspondence Analysis:多重对应分析

Multidimensional Scaling:多维标度法

word map(词汇地图)将研究领域划分为几个类别

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word map

最具贡献论文(Most Contributing Papers)

Contributing:汇总的信息中每篇论文的权重

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Most Contributing Papers

在wos被引次数最高的文献(Most Cited Papers)

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Most Cited Papers

Intellectual Structure(知识结构)

Co-citation Network:同被引网络

Historiograph:了解数据集中重要性较高文献

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Historiograph

Table列表中,LCS表示当前数据集中,文献被引次数,也就是文献在该领域的重要程度;GCS表示Web of Science 中,文献被引次数。

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Historiograph

Social Structure(社会结构)

Collaboration Network:合作网络(作者、机构、国家)

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Collaboration Network(countries)

Collaboration WorldMap

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Collaboration WorldMap


以上对biblioshiny中的指标解读可能会存在不足,欢迎大家批评指正!


绘制图是第一步,解读图至关重要,合理应用计量指标以及设置参数,可以快速了解某一科研领域。


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