3月29日上午，國家衛健委在武漢組織召開疾控系統疫情防控工作座談會，國家衛健委主任馬曉偉在會上表示，疫情再次傳入我國並引起新一輪傳播擴散的風險依然存在，湖北省尤其是武漢市可能存在傳染源未被完全發現，出現零星散發病例和局部暴發疫情的風險始終存在，防輸入任務也將十分繁重，疫情防控再次面臨巨大挑戰。
馬曉偉表示，疫情初期我們的大隊人馬都在武漢，主要工作精力集中在武漢。當前，對全國醫務人員進行系統培訓，將武漢救治工作的經驗為全國所掌握，對全國疾控人員進行全面培訓和應急演練，這些工作應該迅速做好，抓到議事日程。同時，儘快蒐集整理日本、韓國、新加坡等國防控新冠肺炎的經驗方法，為復工復產復學保駕護航。
在總結前一階段防控工作時，馬曉偉表示，這次疫情防控，對於中國來講是閉卷考試，考的都是新東西。
馬曉偉把疾控工作在此次戰“疫”中的做法總結為“345模式”：所謂“3”就是，把好社區防控、發熱門診、面對面流調“三道防線”，把握好2小時、12小時、24小時“三個時限”，抓好重點地區、重點場所、重點人群防控“三個重點”；所謂“4”就是，落實早發現、早報告、早隔離、早治療“四早”防控措施，管好確診、疑似、發熱、密接“四類人員”，做到應收盡收、應治盡治、應檢盡檢、應隔盡隔“四應四盡”；所謂“5”就是，落實“五包一”社區防控責任制；發放“五個一”工具包；做到排查、管控、督導、宣教、關愛“五個到位”等。
針對此次新冠肺炎疫情應當吸取的教訓，馬曉偉指出，非典以後，我們一直在抓縣鄉鎮衛生院以上的傳染病直播系統建設，但是這次疫情，直報系統發揮的作用有限。
馬曉偉表示，這次疫情對我國衛生健康體系和治理能力是一次大考，檢驗了應對突發公共衛生事件的能力和學科建設的成就，同時也暴露出了短板和問題。比如，重大疫情防控相關法律法規和配套制度不完善，相關應急預案的操作性和針對性不強，信息化建設落後，信息共享機制不健全，各級疾控機構普遍存在能力不強、機制不活、動力不足等問題。
馬曉偉表示，要清醒認識當前疫情防控的複雜形勢，全面築牢社區防控網底，鞏固疫情防控階段性成果，完善從境外到國門、從國門到家門的全鏈條防控策略，堅決防範境外疫情輸入。要研究深化疾控體系改革，完善重大疫情防控體制機制，為人民群眾提供可靠的健康屏障。
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