GinkgoBioworks搜集汇总了全球合成生物学社群针对COVID-19的项目集合，并且仍在不断更新增加中。人类作为命运共同体，正在调用全球科研力量和最新科技手段共克时艰。
金斯瑞作为合成生物学社群的重要成员，一直在为全球抗疫研究贡献力量。在检测试剂方面，金斯瑞提供SARS-CoV-2病毒的qPCR探针、引物和阳参对照以及一步法整体检测方案，经验证可以成功检测出阳性对照，提升了检测的成功率和速度；在抗体发现方面，GenScript ProBio采用Berkeley Lights的Beacon平台快速开展抗体筛选，为全球抗体药研发提供助力；此外，金斯瑞的基因合成、质粒等多条业务线，也全力生产、快速响应，为全球科学家开展SARS-CoV-2病毒科研提供帮助。
一、数据支持
开放的公共卫生、病毒学和免疫学数据的许多优秀资源可以用于支持对抗COVID-19。
1.免疫应答表征
Adaptive Biotechnologies - 与微软合作，为COVID-19的免疫应答提供开放数据
2.病毒生物学
Allen Institute COVID-19开放研究数据集 - 针对COVID-19已发表的文章和预印本的合集
ARTIC Network - 测序＆分析实验步骤开放资源
Genome sequence
Immunitrack - 辅助疫苗研究的COVID-19免疫刺激表位的结构
McLellab Lab，德州大学奥斯汀分校 - Spike蛋白的结构
3.病毒追踪与进化
Ares Genetics - 追踪病毒进化的新一代测序技术
Nextstrain - 病毒进化的实时跟踪技术
4.公共卫生跟踪
COVID追踪项目 - 美国的测试数据
COVID扩增率跟踪
开放COVID-19研究 - 追踪症状
5.临床研究数据
Vivli
6.其他数据和新闻汇总
COVIDbase - 项目、新闻和数据的精选列表
Github – 开放共享资源
SynBioBeta – 新闻与政府新闻
Tableau - COVID-19全球数据中心
WEF – 公司们如何应对冠状病毒
二、研究工具
来源于病毒的分子，核酸如RNA或DNA，或蛋白质，是COVID-19 研发的重要工具，是诊断的基础，且对开发和测试新疫苗和治疗极其重要。下列这些公司正在为COVID-19研究提供抗原、抗体、RNA和DNA
1.研究检测试剂盒 - qPCR
Biomeme - 手持qPCR装置
GenScript - qPCR探针和引物，一步法整体检测方案
2.研究检测试剂盒-免疫检测
Creative Diagnostics
Eagle Biosciences
Epitope Diagnostics
EUROIMMUN
3.核酸
Arbor Biosciences – 免费的NGS杂交捕获试剂盒
Ginkgo Bioworks - 蛋白质表达相关的病毒cDNA合成
IDT - 用于诊断和疫苗开发的DNA合成
SGI-DNA - 50000美元的合作资助，用于支持诊断、疫苗和治疗学的合作
Twist Bioscience - RNA控制和NGS面板
4.抗原与抗体
BEI Resources
The Native Antigen Company
Tierra Biosciences
SinoBiological
5.软件
AWS
Foldit
SalesForce ProGen
Synthace
TeselaGen
6.社群资源与加速器
BIO Coronavirus Hub
The COVID accelerator
IndieBio Coronavirus Initiative
Just One Giant Lab
三、诊断
在疫情大规模流行的现阶段，广泛的检测对减缓病毒的传播速度至关重要。许多组织（医院、学术实验室、新创立的跨国公司）都在加速开发、制造和扩大检测试剂盒的生产规模。
1.核酸检测
Abbott
Aldatu Biosciences
Cepheid
Curative
Hologic
Mobidiag
New England Biolabs
QIAGEN
Roche
Thermo Fisher
Veredus
2.免疫检测
Attomarker
Krammer Lab - COVID血清学检测实验步骤
Mologic
Nirmidas Biotech
Predigen
RayBiotech
Sona Nanotech
Sugentech
United Biomedical Group
3.基于CRISPR的诊断
Broad Institute – 可开放获取CRISPR测试实验步骤
CASPR Biotech - 方法预印本
Mammoth Biosciences
Sherlock Biosciences
4.其他检测方法
MiProbes – 鉴定病毒蛋白的快速检测方法
5.检测中心
attelle
Broad Institute
Chan Zuckerberg Biohub
Innovative Genomics Institute
UCSF
UK Whole Genome Sequence Alliance
University of Washington Department of Virology
6.自动化和整列实验步骤
OpenCell - 扩大检测基础设施
OpenTrons - 扩大/普及检测自动化
Salis Lab - 大规模并行检测实验步骤
Zymergen - 支持Chan Zuckerberg Biohub检测自动化
7.环境试验
检测表面和其他环境（如下水道）中病毒的存在有助于追踪和监测COVID的传播。
Aanika Bioscience - 企业客户环境检测
Chai Bio - 基于RT-PCR的通过拭子的环境检测
Stemloop – 无细胞的生物传感器
Twist Bioscience and Mason Lab at Cornell - NYC公共交通取样
大量新的和再利用的药物正在进行临床前研究和临床实验以到达最需要它的病人手中。这一列表偏向于生物药物，如抗体，而不是治疗感染的小分子治疗药物。这些治疗用的抗体多来源于从冠状病毒中恢复的患者血浆，以帮助患者的免疫系统直接对抗病毒。
1.检测中心
AbCellera - Eli Lilly开发抗体疗法
CytoDyn - 抗体疗法2期试验
Emergent BioSolutions - 血浆源性抗体治疗
Regeneron - 血浆源抗体治疗
Vir - 用Bingen开发抗体疗法
2.抗体快速发现
Berkeley Lights – 抗体筛选(GenScript ProBio亦采用Berkeley Lights的Beacon平台快速开展抗体筛选)
Distributed Bio - 应用计算机的抗体发现
ImmunoPrecise Antibodies - 多靶点抗体发现平台
Macromoltek - 抗体的计算机设计
Prellis Bio - 抗体生产平台
Swiftscale Biologics - 加速抗体发现的进程
3.其他疗法
lnylam - 基于siRNA的Vir疗法
CEL-SCI – 利用肽的免疫疗法
Pentelute Lab, MIT - 肽结合spike蛋白
Voigt Lab, MIT - 高通量治疗发现
五、疫苗
从长远来看，疫苗对于根除危险病原体尤为重要。许多公司正在开发和测试几种不同类型的疫苗。疫苗会训练免疫系统识别病毒，以便在感染的第一时间清除病毒。疫苗可以由多种不同的生物分子制成：DNA、RNA、蛋白质、病毒样颗粒或灭活病毒。更多信息可查看WHO候选疫苗的相关网站。
1.灭活病毒疫苗
Codagenix
Humane Genomics
Sinovac
2.病毒样颗粒（VLP）疫苗
Medicago - 在植物中表达
3.非复制型病毒载体疫苗
Altimmune
CanSino Biologics - 正在进行1期临床试验
GeoVax
Greffex
Institut Pasteur, with Themis and the University of Pittsburgh
Johnson & Johnson
Vaxart
4.mRNA疫苗
Arcturus – 与Duke-NUS医学院合作
BioNTech and Pfizer
CureVac
HelixNano - 多抗原mRNA疫苗
Imperial College London
Moderna - 正在进行Ⅰ期临床试验
5.DNA疫苗
AnGes Inc. - 与大阪大学合作
Inovio
Takis - 应用DNA科学和Evvivax
Zydus Cadila
6.蛋白疫苗
AJ Vaccines
Clover Biopharmaceuticals - 与GSK合作
EpiVax
ExpreS2ion
Heat Biologics
iBio and CC pharming — 植物中表达的蛋白
Ligandal
Novavax
Sanofi
University of Queensland
7.其他疫苗
Prokarium
8.佐剂
DynaVax
六、制造与大规模生产
一旦一种新的抗病毒疗法或疫苗完成开发及测试，就需要对其进行大规模的运输。
Culture Biosciences – 生产工艺优化和开发
疫情当前，全球科研社群空前团结，无论是生物学领域的诊断、治疗和疫苗开发，还是临床医学领域全球医疗工作者的集结、逆行与信息共享，我们在危难中看到了全人类的凝聚力。只有全球团结一心，才是我们得以获得最终胜利的希望所在。
参考链接：
https://www.ginkgobioworks.com/2020/03/22/synthetic-biology-and-beyond-community-response-to-covid-19/
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