為國爭光!合肥這家公司擊敗美國谷歌等對手奪得世界第二!

厲害了!合肥綜合性國家科學中心創新平臺半湯大基因中心極元科技,在美國FDA舉辦的基因測序數據分析質量評比中,奪得世界第二!

據瞭解,在這場評比中,共有 30家世界知名的大學/生命科學研究院和基因測序公司參加,包括美國哈佛醫學院的Broad Institute、谷歌等機構。

能從如此優秀的全球競爭企業中脫穎而出,尤其是擊敗美國谷歌等公司,真是大漲國人志氣!

更可喜的是,該技術能極大提高新生兒遺傳病診斷效率——傳統辦法要3-4個月才能確定病因,通過綠色超算技術分析樣本,只要1天時間就能診斷!

為國爭光!合肥這家公司擊敗美國谷歌等對手奪得世界第二!

合肥半湯大基因中心地標

FDA基因測序數據分析質量評比第二

2017年7月,在美國藥監局 FDA 舉辦的 Precision FDA Hidden Treasure 基因測序數據分析質量評比上,共有 30家世界知名的大學/生命科學研究院和基因測序公司參加,包括美國哈佛醫學院的Broad Institute、谷歌等機構。

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基因測序數據分析質量評比得分表

其中,僅有10家機構/公司成功地檢測出所有的植入變異和他們對應的Variant Allele Frequency (VAF),其中就包括極元科技(Aginome Scientific)。在對其他變異的分析上,極元科技取得了總分第二好成績,科研實力邁入國際領先水平。

綠色超算極大提高疾病診斷效率

算法在診療中的作用,更讓人感到神奇。遺傳疾病在新生兒中佔有一定的比例,傳統診療週期長、費用高,現在通過基因檢測和綠色超算能將這一局面徹底改變。俞容山博士介紹,“遺傳病罕見,複雜症狀,傳統辦法要三四個月才能確定病因,通過基因檢測,快速計算,一天時間分析樣本就可以診斷。”

綠色超算如此出眾的奧秘

綠色超算系統基於獨有的GPU/CPU異構並行計算技術,一個綠色超算系統節點處理基因大數據能力約等同於100相似CPU配置服務器組成的集群處理能力,極具創新性和市場競爭力。俞容山博士介紹,“美國另外一家公司靠芯片做到同樣的速度,我們在通用計算機通過軟件就可以。”

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中科院北京基因組研究所專家曾使用自帶的全基因組測序數據,對半湯大基因中心綠色超算系統進行了測試。結果顯示,對於完成同一個全基因組測序(WGS)數據處理任務,目前業界絕大多數常規通用的超算單節點完成標準流程序列映射(mapping)需要8小時,而綠色超算系統單節點僅用18分鐘,運算速度是前者的27倍;變異檢測根據可選擇流程模塊,提高運算速度10-80倍!

綠色超算科學家介紹

為國爭光!合肥這家公司擊敗美國谷歌等對手奪得世界第二!

半湯大基因中心極元科技CEO俞容山博士

俞容山博士,半湯大基因中心極元科技CEO、廈門大學“閩江學者”特聘教授、數字福建健康醫療大數據研究所所長、IET會士,曾任美國杜比實驗室主任研究員、新加坡科技發展局通信資訊研究院信號處理研究所所長和項目首席科學家。

在國際著名學術期刊及會議上發表了70多篇論文。為了表彰他對數字技術發展及國際標準制定所做出的傑出貢獻,新加坡科學與技術部於2007年授予其“新加坡國家科技獎”,這是新加坡科技界的最高榮譽。

半湯大基因中心將進入成果爆發期

除了綠色超算之外,半湯大基因中心還有更多尖端科技,匯聚成科技進步的強大力量,有力促進人類健康、長壽、幸福美好願景的實現!

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中國半湯生物谷航拍圖

自2017年5月,半湯大基因中心揭牌以來,依託一流的硬件環境、開放的人才政策、雄厚的科研實力,短短一年時間,集聚了基因測序、綠色超算、生物信息分析、DNA數據存儲、CAR-T細胞治療、合成生物學等領域的科學家和博士,

構建了測序、算法、解碼和應用的基因全產業鏈,成為安徽乃至中國基因研究與創新發展的生力軍

一批科研成果逐漸嶄露頭角,2019年將進入科研成果集中爆發期!(來源:“波動未來”微信公眾號)


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