1963年广西博物馆文物工作队来藤县进行田野考古，共发现新石器时代文化遗物10多处，证明距今约1万年至4千年前已有人类活动。
秦以前藤县属于百越地，即众多部落聚居地。秦始皇三十三年(公元前214年)，始划入秦朝的版图，属南海郡辖地，郡治番禹，即今广州。秦末汉初，赵陀在南方建立南越国，藤县属南越国地。
汉武帝元鼎六年(公元前111年)，汉平南越，置南海、苍梧等九郡，今藤县为猛陵县地，属苍梧郡。三国时代(公元22O年一280年)，。今藤县属吴国辖地，区城仍是苍梧郡猛陵县地。晋穆帝升平五年(公元361年)，分猛陵县地设置安沂县，后因地盈宽广，晋安帝义熙中，分安沂县地置夫宁县，同属永平郡。南朝梁代改安沂县为安基县。当时的夫宁、安基仍在今藤县县境。
隋开皇九年(公元589年)永平郡。十年(公元590年)置石州，十二年(公元的591)宁县为永平县。十二年(公元592年)改石州为藤州，这是藤州得名之始。十九年(元599年)增置隋安县、淳民县，均为藤州辖地。隋大业三年(公元607年)，藤州复改为永平郡，统辖永平、安基、隋安、淳民等县，郡治永平县。
隋义宁二年(公元618年)，萧铣据南方称帝，国名梁，永平郡归属梁国。唐武德四年(公元621年）平萧铣，废永平郡复置藤州，州治永平县。五代十国时期(公元907年一960年)，今藤县地初属楚国，公元917年后归属南汉。藤县境内分为镡津县、义昌县、感义县、宁风县。
宋开宝三年(公元970年)，废宁风、感义、义昌三县，并入镡津县，属藤州。元代，今藤县仍称镡津县，属藤州。藤州这时基本上确立了今藤县地理区域。明洪武二年(公元1369年)撤销镡津县，并入藤州。十年(公元1377年)降州为县，命名为藤县，属梧州府，这是藤县得名之始。
清代仍为藤县，属梧州府，归广西行省管辖。民国时，藤县先属苍梧道，后属梧州区。新中国成立后，仍称藤县，归属广西省梧州专区，1951年7月归属容县专区，1958年7月复妇梧州专区1971年11月，梧州专区改名梧州地区，至今归属梧州市。
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