所謂留抵稅額就是一般納稅人的當期進項稅額大於銷項稅額，不僅當期不用交稅，超過的部分還可以留到下期繼續抵扣。
留抵稅額金額較大的情況主要存在於初創期的企業和“低銷”“高進”的農機、生產服務等行業。比如初創期的企業，前期需要大量的投入，但同時銷售還沒有形成規模，投入購進的資產進項稅額沒有對應的銷項稅額抵減，形成大量留抵稅額；再比如大型賓館，銷項稅率為6%，購進不動產的進項稅率9%，購進傢俱、床上用品、衛生潔具的進項稅率13%；
對於大型企業來說，動轍幾千萬的留抵稅額，擠佔著企業的資金，造成企業現金流的壓力。同時2019年4月1日起不動產購進分兩年抵扣的政策改變成一次性全額抵扣，企業進項稅額可能進一步提前變多。但原來規定，留抵稅額只能抵、不能退，只能掛在增值稅的申報表上，成為鏡中月、水中花。而經過此次增值稅改革，留抵稅額可以不僅能抵，還能申請退，成為真金白銀。
根據《財政部稅務總局 海關總署關於深化增值稅改革有關政策的公告》（財政部 稅務總局海關總署公告2019年第39號）的規定：自2019年4月1日起，全面試行留抵退稅制度，不再區分行業，只要增值稅一般納稅人符合規定的條件，都可以申請退還增值稅增量留抵稅額。
退稅條件
條件一：看增量
自2019年4月稅款所屬期起，連續六個月（按季納稅的，連續兩個季度）增量留抵稅額均大於零，且第六個月增量留抵稅額不低於50萬。記住，增量留抵稅額，是指與2019年3月底相比新增加的期末留抵稅額，2019年3月的留抵稅額餘額永恆不變的基數。假如是2019年4月1日以後新設立的納稅人，由於2019年3月底的留抵稅額為0，其增量留抵稅額即當期的期末留抵稅額。
假設A企業2019年3月的留抵稅額
餘額為100萬元。2019年4月2019年9月六個月每月（按季的為每季）留抵稅額餘額都應大於100萬元，2019年9月的留抵稅額餘額應超過150萬元。
條件二：看規範
1、企業的納稅信用等級為A級或者B級；C、D、M級的都不符合條件，其中M級是新設企業，由於設立時間未跨過一個自然年，所以沒有參加信用等級評定。
2、企業申請退稅前36個月未發生騙取留抵退稅、出口退稅或虛開增值稅專用發票情形的；
3、申請退稅前36個月未因偷稅被稅務機關處罰兩次及以上的；
條件三：看優惠
自2019年4月1日起未享受即徵即退、先徵後返（退）政策的。比如自2011年1月1日起，對納稅人銷售其自行開發生產的軟件產品，其實際稅負超過3%部分實行即徵即退。那麼該企業就不能申請留抵退稅。
以上條件必須同時符合。
退稅計算
退稅計算分三步，舉個例子：
小何公司2019年3月底的留抵稅額是100萬元，2019年9月留抵稅額是160萬元，假設小何公司滿足上述退稅條件。
第一步：計算增量留抵稅額：2019年9月留抵稅額餘額-2019年3月留抵稅額餘額=160-100=60萬元
第二步：計算進項構成比例：
進項構成比例，為2019年4月至申請退稅前一稅款所屬期內已抵扣的增值稅專用發票（含稅控機動車銷售統一發票）、海關進口增值稅專用繳款書、解繳稅款完稅憑證註明的增值稅額佔同期全部已抵扣進項稅額的比重。
假設小何公司2019年4-9月進項稅額合計500萬元，進項稅額包括：購進農產品自開收購發票的進項稅額98萬元、通行費電子發票稅額1萬元，出差人員的車票計算抵扣1萬元，增值稅專用發票註明的進項稅額350萬元、海關進口增值稅專用繳款書註明的進項稅額50萬元。（350+50）/(98+1+1+350+50)=80%
第三步：計算當期允許退還的增量留抵稅額：允許退還的增量留抵稅額=增量留抵稅額×進項構成比例×60%
允許退還的增量留抵稅額=（160-100）*（400÷500）*60%=28.8萬元。
增值稅一般納稅人取得退還的留抵稅額後，又產生新的留抵，要重新按照退稅資格條件進行判斷。特別要注意的是，“連續六個月增量留抵稅額均大於零”的條件中“連續六個月”是不可重複計算的，即此前已申請退稅“連續六個月”的計算期間，不能再次計算，也就是納稅人一個會計年度中，申請退稅最多兩次。比如小何公司退還了28.8萬後，9月底留抵稅額餘額160-28.8萬=131.2萬元。需要到半年之後的2020年3月，如果條件再次滿足，還可以再次申請退稅。
由於新辦企業只有等到信用等級確定為A、B級，才可以申請留抵退稅。比如是2019年4月成立的，至少應等到2021年初才能申請退稅，並以申請日前6個月的指標確定是否符合要求確定能否退稅。
退稅申請時間
由於留抵稅額是個時點數，會隨著增值稅一般納稅人每一期的申報情況發生變化，因而提交留抵退稅申請必須在申報期完成，以免對退稅數額計算和後續核算產生影響。
申報調整
增值稅一般納稅人取得退還的留抵稅額後，應相應調減當期留抵稅額，並在申報表和會計核算中予以反映。
同時對實行增值稅期末留抵退稅的納稅人，允許其從城市維護建設稅、教育費附加和地方教育附加的計稅（徵）依據中扣除退還的增值稅稅額，可以調整各項附加稅的計稅依據。各項附加稅也可以隨之少交，真是意外的驚喜。
出口企業處理
增值稅一般納稅人出口貨物勞務、發生跨境應稅行為，適用免抵退稅辦法的，辦理免抵退稅後，仍符合留抵退稅規定條件的，可以申請退還留抵稅額，也就是說要按照“先免抵退稅，後留抵退稅”的原則進行判斷；同時，適用免退稅辦法的，相關進項稅額不得用於退還留抵稅額。
