8 月8日，當“埃姆登”號抵達帕根島與斯佩分艦隊主力會合時，受到了另外三艘巡洋艦的官兵的熱烈歡呼，因為在此之前，有謠傳說“埃姆登”號已經與俄國巡洋艦 “阿斯科爾德”號同歸於盡了。8月13日，斯佩中將召開艦長會，討論進一步行動的方向，斯佩中將決定艦隊將繼續在東方活動，作為一支“存在的艦隊”吸引英國海軍的兵力.
但是，此時的印度洋幾乎已經成為英國的內湖，艦隊在那裡活動幾乎不可能獲得任何必要的燃料和物資補給，而東南太平洋即南美西海岸有著漫長的中立海岸，可以從友好的智利那裡獲取必要的物資，這對整個分艦隊來說是十分重要的。但是穆勒艦長對此卻有不同見解，他儘管同意斯佩有關補給問題的看法，但是認為南美海岸距離過遠，同時那裡缺乏有價值的目標，對戰爭不會有太大幫助，儘管整個分艦隊前往印度洋確實有無法解決的補給問題，但是單獨行動的輕巡洋艦卻可以設法解決，並使用靈活的機動擺脫追擊，打擊英國航運，甚至可以比整個分艦隊前往印度洋發揮更大的作用，因此，不必整個分艦隊全部前往南美，可以派出部分輕型艦隻前往印度洋對英國航運實施破襲，而他本人和“埃姆登”號願意承擔這一任務。
在一夜的考慮之後，斯佩同意了穆勒的提議，14日，“埃姆登”號攜運煤船“馬克多尼亞”號離開分艦隊主力，啟程前往印度洋。不久後，日本對德國宣戰，先後佔領了馬里亞納群島，吉爾伯特群島，馬紹爾群島和加羅林群島，這樣，“埃姆登”號和分艦隊主力被徹底分隔，分別在兩個滿是敵人的大洋上，面對英聯邦，法國，俄國和日本艦隊的追捕。在這種情況下，“埃姆登”號在印度洋的航運襲擊行動似乎與自殺無異。這艘作為北海上偵察巡洋艦所設計的艦艇與英國的“殖民地巡洋艦”不同，在超載煤炭的情況下，它的續航力在12節時大約只有3700海里，24節時僅有1200海里。因此，它在印度洋實施破襲時最大的困難是如何獲取燃料補給—— 但“埃姆登”號採用了最大限度的利用其戰利品的做法在一定程度上解決了這個問題。
九月，“埃姆登”號用一個假煙囪將自己偽裝成一艘英國“郡”級巡洋艦後進入了孟加拉灣。9月10日，“埃姆登”號捕獲了它進入印度洋後的第一個獵物——3 392噸的貨輪“印度河”號，該船正打算前往孟買裝運馬匹，船上除了壓艙物之外，只有一批香皂，但是這些價值有限的貨物卻在“埃姆登”號上引起了不小的歡樂情緒，穆勒艦長在率領“埃姆登”號在離開青島前，由於過於匆忙，忘了攜帶足夠的肥皂，此時船上剩下的肥皂充其量只能用兩個星期，而且都是骯髒的印度肥皂，就在不久前副艦長穆克還對艦長穆勒抱怨肥皂的數量和質量，並一本正經地就打劫一艘肥皂船的必要性提出建議，而此時“印度河”號上裝有整整150箱香皂！消息迅速傳到印度後，這個小小的插曲激發了受到損失的香皂公司的廣告靈感。
