Asukas
六号机与其他机体的不同：
六号机（Mark.6）是新剧场版中才出现的，在剧场版《序》中第一次露面是在月球上。首次出现时被推测是由使徒直接改造而成，而并非使徒的克隆，这是它与之前出现的所有的EVA机体本质上的不同，之后的剧场版《Q》中得到了证实。
（还有一说是Mark系列所有机体均为直接改造过得使徒，都自带S2机关，拥有无尽的能量。）
六号机怎样中断的“第三次冲击”？
在剧场版《破》的末尾，用卡西乌斯之枪刺穿了初号机，暂时中断了初号机引发第三次冲击。所谓的卡西乌斯之枪，就是这把通体黑色的长枪，与红色双螺旋构造的朗基努斯之枪的外表不同。
朗基努斯之枪名字来自于处刑耶稣的罗马人，而卡西乌斯之枪的名字来自于刺杀凯撒的主谋，前者“弑神”后者“弑王”。官方虽然没做过明确解释，不过可以推断，两者应该具备同级别的能力，可以封印EVA的力量。
然而在剧场版《Q》中我们得知，“第三次冲击”最终还是发生了，具体原因不明，卡西乌斯之枪是没能完全阻止初号机。
值得注意的细节：
在剧场版《Q》的末尾，我们发现六号机被封印在了莉莉丝的身体之中，在十三号机拔出两把朗基努斯之枪之后，六号机的封印解除。被砍掉头之后化作了第12使徒，所以说六号机很可能是由第12使徒改造而来的。
十三号机吞噬了化作使徒的六号机，觉醒为白色的完全体。这说明，碇源渡主导制造六号机的最终目的，是用来帮助EVA成神。《Q》中让真嗣和渚薰去拔出长枪的真正用意，是为了解开六号机的封印，让十三号机通过吞噬掉它而觉醒。
动漫简评
在 EVA 动画中由于有新旧两版剧场版，所以 6 号机代表的机体是不同的，在旧剧场版中 6 号机是量产机的一员，搭载了 S2 机关，配有复制的朗基努斯之抢，目标就是为了实现 SEELE 的人类补完计划。而题主所说的的应该是新剧场版中渚薰的那台 EVA 6 号机，EVA Mark 06，这台 EVA 在建造方面最大的不同就是由 SEELE 的老人们不经过 NERV 直接在月面基地上建造，虽然名义上这台机体是属于 NERV，但实际上统辖管理在 SEELE，在新剧场版破中碇源堂和冬月副司令曾经搭乘宇宙船想要前往月面基地，但最后 SEELE 没有允许碇源堂他们登陆月面基地，碇司令和冬月只是远远的看了下 Mark 06 的制造现场，出现了一个类似旧 TV 版中莉莉丝外形的黑色巨人，SEELE 将 Mark 06 称之为「真 EVA」。
从原先 TV 版的设定来讲 EVA 是人类模仿亚当建造的对抗使徒的决战用兵器，没有灵魂，而 EVA 的灵魂往往是源于测试者，比如初号机拥有的是碇唯的灵魂，二号机拥有的明日香妈妈一半的灵魂，而渚薰当初搭乘的 6 号机应该就是新剧场版破中的黑色巨，也就是这个 EVA Mark 06 是拥有灵魂，拥有 S2 机关，自身就拥有完整使徒力量的一台机体，所以在 Mark 06 登场的时候就能头顶光环，而一枪打爆初号机倒不是 Mark06 有多强力，而是 Mark 06 的那把卡西乌斯之枪。
卡西乌斯之枪也是新剧场版的谜团之一，在 Q 中提到当 13 号机拥有卡西乌斯之枪还有朗基努斯之抢就可以让世界重新来过，至少卡西乌斯之枪一枪就能打爆拟神状态的初号机，证明这把枪或许意味着终结。而在 Q 中 Mark 06 体内隐藏的就是第 12 使徒，
ACG狗屋
从问题看，所说的EVA6号机应该是指新剧场版中的Mark06，在老剧场版中5至13号机是量产机，是没能力爆初号机的。
而在新剧场版破中，Mark06是SEELE在NERV管辖之外特别在月球开发的，连碇源堂也没有靠近的权力。从动画细节上看，应该是用使徒的身体直接覆盖装甲的，可能就是被封印的第12使徒。可能与初号机相似（一直都说初号机本体就是亚当）所以和其他EVA机体肯定是不同的。
最后从天而降的Mark06之所以能够终止第三次碰撞的继续，我认为主要还是因为：1.用以刺穿初号机的是卡西乌斯枪，和朗基努斯枪同级的神器。2.Mark06的驾驶者渚薰是使徒，而并非普通人类适格者。3.初号机的这次觉醒有很大的意外性，提前获得S2机关，且刚开始觉醒，应该觉醒程度未到不能终止的程度。4.贞本大神的坑，他说了算。
陶罐酱心
(1)从制作的材料上看，六号机并不是普通的亚当复制品，六号机的外貌和形态都与NEVR中央教条区的莉莉丝很像，而且它带有和莉莉丝一样的七目面具。他的驾驶员为渚薰。
2 六号机使用AT立场时， 会像使徒一样出现光环，判定其可能原型并不是ADAM或者LILITH的复制，而恰恰月球上有一只使徒，而六号机又整好是在月球上建造的，由此可以推测出六号机的原型极有可能是一位使徒，因此六号机才能拥有无限的能量，，不用使用脐带电源。
3 根据TV和剧场版的叙述，月球上的使徒为第十二使徒。所以，六号机应该是在月球上由十二使徒直接改造的。战斗力爆表！
证据:《Q》后版部分六号机登场和两把朗基努斯长枪一起出现在莉莉丝尸体的肩部并变为纯白色。后来十三号机把两把枪拔出后，六号机变回《破》中的样子，身体涌出光环，其识别信息也变为“第十二使徒”。
4 破里面的新机型，EVA六号机被命名为Mark.06（Mark Six），由使徒渚薰驾驶，SEELE称之为“真正的EVA”。
剧场版《破》里说过SEELE想要造出真正的神，之后冬月说过：“是MARK.06吧”。也就是六号机可能是真正的神。六号机的原型戴着七眼面具。在SEELE心中，六号机地位明显不同于其他EVA。
综上所述，可以推断出六号机能打爆初号机，这个解释可满意？
嘉腾绘
首先每台EVA6号都是有内在的核心驱动的存在的，也就是主角的母亲的灵魂。而觉醒是在EVA的剧场版真心为你和新剧场版：破之中出现的，旧剧场版代表的是第二使徒莉莉丝和第一使徒亚当的合体，然后莉莉丝由于她的灵魂寄宿体凌波丽和真嗣的情况，所以莉莉丝选择了初号机和它的驾驶员决定人类的存亡。而新剧场版，破之中的觉醒是在对战第十使徒的时候，由于真嗣想要就会凌波丽所以以人类之姿态达到神之领域。我是这样认为的。
张姄
因为六号机是在月球建造，不属于nerv管辖，应该是用使徒的克隆体，直接改造完成的六号机，而且六号机降落的时候，头上也有淡淡的光环，应该也处于觉醒状态，不够这种状态应该是可控的，不过我觉得那把枪的功劳大一点
白白白白白姑娘
feng68143433459
朗基努斯之枪，神器，可以贯穿一切。TV版里，这把枪负责封印二号使徒。之后被拿去贯穿了飘在太空中的使徒，威力可见一斑。所以贯穿初号机，主要是这把枪的功劳。小弟个人看法，非喜勿喷。谢谢。