一八五六年秋,洪秀全密詔韋昌輝、石達開、秦日綱帶兵入天京誅殺楊秀清。
韋昌輝非常積極,立刻帶兵三千,從江西回京,秦日綱從丹陽前線返回,會合韋昌輝。
七月二十六日夜,內應陳承瑢打開城門,迎接二人進城。城內的守衛大多是楊秀清控制的,但他們毫無警覺,韋昌輝立刻佈置誅楊行動。不到兩個時辰,他們就控制了各要害據點和通達東王府的街道。
二十七日凌晨,韋昌輝指揮誅楊大軍突然發難,襲擊東王府。東王府毫無防備,迅速被踏平,楊秀清也被韋昌輝斬殺。洪秀全聞訊,馬上發諭,說楊秀清竊據神器,犯謀反罪,以此響應韋昌輝的誅楊行動。
韋昌輝屠完東王府後發現,有一部分東王府的人逃了,而且分佈在城中其他地方的楊秀清餘黨還有很多,為了讓自己沒有後患,他想斬草除根。這時候,洪秀全也傳令說韋昌輝殺人超出了指標,違背了只辦首惡的方針。韋昌輝趁機想出一條苦肉計。
他和秦日綱放出風,說在天王的教育下,他倆認識到了錯誤,不該牽連東殿無辜人員,所以甘心受罰。兩天後在廣場受罰,給東殿無辜人員賠罪。同時,假借天王口諭,召楊秀清的部屬前去觀刑。
行刑那天,韋昌輝和秦日綱戲演得逼真,被打板子,連板子都打斷了,圍觀的那楊秀清部屬有五千餘人,他們卸下了原有的防備,散場時被騙進指定的大房子,韋昌輝立刻指揮埋伏好的軍隊用槍炮轟射,頓時血流成河。接下來還滿城搜捕,持續月餘。
石達開本想躲開這事,讓韋昌輝按照約定除掉首惡,但沒想到韋昌輝完全被野心和私慾催化,局面失去了控制。情急之下,石達開只帶了幾個隨從進京,勸說韋昌輝封刀,韋昌輝不滿石達開當初耍滑頭,一起奉召,他卻躲在後面不來。另外,楊秀清死後,韋昌輝成了最大的實力派,而石達開對他有威脅,因此,幹掉石達開,他就無人匹敵了。
石達開連夜縋城而逃,但他的翼王府複製了東王府的悲劇。韋昌輝指石達開為反賊,滿城搜捕他,但他知道,這肯定得不到天王的應允,於是,他橫下一條心,想把天王控制在手,這樣想要什麼樣的聖旨就有什麼樣的聖旨,扣帽子、定罪、處決都會名正言順。
石達開逃走的第二天,韋昌輝就帶兵來到了天王府,說有人看到反賊石達開躲進了天王府,想進去搜捕,但被天王府的兩千女衛士攔住了,洪秀全傳出嚴令,問韋昌輝闖天王府有何居心,想作亂嗎?石達開也不在天王府,已經出城了。韋昌輝聽後,有些心虛起來,石達開出城了,也會學他帶兵回京......
但他還是覺得,先把天王控制在手最關鍵。於是,他換了種方式,好言好語轉呈天王,說既然石達開不在這裡,為了防止他前來作亂,天王府需要增兵保護起來。隨後開始包圍天王府,洪秀全聽後,大罵韋昌輝假心假意,保護天王府都是假的,不能任由他。
一陣僵持之後,天王府的衛士和韋昌輝的軍隊交火了,天王府的兩千多衛士大都是由客家大腳婦女組成,她們很強悍,最後把韋昌輝的兩三千軍給打退了。
韋昌輝狼狽敗回後,軍心開始散亂,再加之石達開所率平亂大軍逼近天京,韋昌輝更是惶惶不可終日。最後,天王說動秦日綱反正,讓他率領所部和天王衛隊一舉擊垮了韋昌輝的軍隊,活捉韋昌輝後,將之處以極刑。