三维模型既是面向功能的，又是面向数据流的。从功能方面看，它指出了集成化的信息系统具有跨部门、跨功能，使各层次有所贯通，使各种功能能够相互结合的集约化管理特征，即“功能集成”。然而，这些功能模块必须是在集成化的数据环境中运行的，分散、混乱、无序的数据环境不能支持集约化管理的跨部门、跨功能、各层次贯通、各种功能的相互结合。
功能模块都是按数据中心原理去存取集成化的数据存储，即功能集成是以“数据集成”为基础的。对于有一定应用基础和一些分散的MIS的企业来说，信息系统的集成并不是搞些接口连接的问题，而是建立企业信息基础设施，进行规范化的信息资源管理和重新规划设计企业集成信息系统的再造工程。与之同步甚至为其先导的，则是业务过程的重新设计(Business Process Reengineering，BPR)。应该看到，BPR是指对经营方式、部门界限和管理机制进行根本性的结构改革，要经过严格评估，抛弃过时的处理方式，利用最新技术建立新的业务过程。
BPR项目面临的最大障碍有:企业管理部门缺乏实质性的投入和领导;对BPR概念的错误理解，使企业主要领导对BPR项目提出不现实的规模和期望;变革阻力在企业里到处都有，大部分来自中层管理部门。由此可见，要搞全企业MIS的集成与业务过程重建，是有相当大的困难和风险的，只有经过管理上和技术上的充分准备，特别包括在理论借鉴方面的准备，在条件成熟时才能进行。
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