雖然我國近幾年木結構建築發展迅速，但仍面臨著不少問題和挑戰。
一：土地利用問題
我國是個人多地少的國家，國土資源部2003年專門發文限制建造獨立別墅，即今後我國將嚴格控制高檔商品房用地，停止報批別墅用地。從住宅用地來看，由於土地資源位置的固定性和稀缺性，供應量不斷減少，價格不斷上升會推高建造成本，別墅建築的發展受到制約，故以別墅為主的木結構住宅也毫不例外。鑑於上述原因，建議我國木結構建築的發展，首先重點應放在村鎮新農村建設和地震多發地區。其次是城鄉結合部的多層混合和可移動木結構建築，以及生態旅遊景區的臨時性建築。其理由是：村鎮農村的村民具有自己的宅基地且多為單層建築，因此改建不會影響土地的使用，還提高了土地使用的效率；地震多發地區主要是幅原廣闊的農村或山區，土地不為耕種用地，木結構住宅可作為有效抗震措施。在城鄉結合部建造木混結構住宅與現實沒有差別，而可移動木結構住宅，既不破壞耕地，又能解決經濟實不強的年青夫婦和暫住人口的買房難問題。對一些生態旅遊景點，木結構景觀建築是其理想選擇，不僅不破壞耕地，還美化環境，應用得當還會成為亮麗的景觀。
二：森林資源問題
我國森林資源短缺，加之國家保護森林的禁伐政策，由於木結構建築會大量使用木材，是否制約木結構建築的發展空間。近十多年來，森林覆蓋率不斷提高，森林保護政策宣傳深入人心。但是要注意到這一點，國家僅對天然林實施了保護工程，禁止採伐。但人工速生林是鼓勵使用的，如每年大量的楊木做成多層膠合板和單板層積材（LVL）出口給國外建木結構建築。隨著木結構用材市場的需求和技術進步，國內完全有能力生產結構定向刨花（OSB）、層板膠合木（Glulam）、層疊木片膠合木（LSL）、平行木片膠合木（PSL）、指接材（Finger-jointed Lumber）和工字形木擱柵（I－joist）等新型材料。此外，北美進口規格材（SPF）以其價廉物美進入國內市場，以及俄羅斯的落葉松、樟子松資源豐富，都是建造木結構建築的好材料。
三：思想觀念問題
幾十年來，在我國民用建築中一直採用磚混結構，其建造成本低、給人感覺上牢靠、耐 久性好、維護成本低，而木結構住宅會不牢固安全、易發火災、蟻蟲害侵蝕、潮溼會引起腐朽發黴等，以至於很難接受這種新型的木結構建築。由於對木結構建築的認識不足，這些擔心是完全可以解理的。木結構住宅只要在成本上、安全上、保護上、功能上採取適當的措施，通過大量的實驗對比，專業知識的宣傳，用樣板房的展示，特別是中華古木建築及文化的影響，相信人們的觀念是會改變的，木結構建築是完全可接受的。
四：建造成本問題
在木結構住宅的開發建造中，開發商、建造商和消費者最關心的是成本問題，由於現階段在國內建造的木結構建築多為別墅，加之建造材料多為進口，有的材料或構件甚至要到國外加工，使木結構房屋不包括土地的建造成本達到4000～6000元/m2，使用過程中還需要不斷地維護，會增加使用成本，會使大多數人望而卻步。木結構住宅建造和使用成本是否會成為其推廣應用被制約的瓶頸呢？回答是否定的。因為影響木結構建築建造成本的因素較多，如不同地區、不同檔次、不同材料、不同裝飾要求其成本必然不同，關鍵在於如果控制成本。假如在村鎮和地震多發地區的鄉村，造價過高肯定是無法推廣的。控制建造成本應從幾方面入手。首先，要使用價格合理的國產材代替進口材，特別是使用蓄積量豐富的人工速生林。其次，使用國內生產加工的構件，因為國內外人工費相差懸殊。第三，有些非關鍵的零部件儘可能因地制宜、就地取材，節約運輸成本。第四，在設計構造上降低成本，如在一層可採用木框架，磚隔牆，有的地方竹材豐富，可採用木竹混合結構。總之，簡單但不簡陋，低價但不低質，在滿足住宅基本要求和功能的條件下，對農村地區儘可能低的造價是可能的。據有關資料分析，木結構與磚混結構住宅建造成本基本相當，磚混結構住宅維護成本略低，但木結構住宅由於節能使用成本較低，兩者間的精確差異有待進一步比較研究。
五：設計與技術問題
國內木結構建築企業最缺的是木結構設計方面的專業人才以及相關的生產、施工技術。嚴重製約了木結構建築企業的發展空間。目前的狀況是一些企業沒有專業設計人員，完全照搬北美或北歐的建造體系，受制如人；另一種是僅有效果圖（從網上、資料而得），靠施工人員憑經驗折騰，這種方式不可取，因為建築必須安全第一，這種做法會給建築留下很多隱患，也擾亂木建築市場。另外，由於國內缺乏大型構件的生產、成型技術，或缺乏技術標準，使得在公共建築中使用木結構嚴重受阻。針對以上問題，國內已經引起了足夠的重視，出現了很著名高校參與了木結構建築的研發工作，如同濟大學、哈爾濱工業大學、東南大學等，還有少數林業高等院校培養了一批批本科人才。加拿大木業協會在此方面做了大量的培訓工作。在設計上儘可能探索出有中華文化底蘊和獨特結構的中國模式，爭取用5～10年在世界木結構建築領域佔有重要地位。在生產技術上，早期儘可引進國外的先進製造技術和產品，最終要打造出自己的產業和製造商。加快木結構建築的本土化、國產化，以設計為主導，重點解決在結構材料和構件生產、施工建造等方面的技術。重視戶內外膠粘劑和金屬連接件的研究，開發出適合我國木結構建築的設計軟件，橫向聯合不同學科，對建築材料、結構、室內外裝飾進行全方位的攻關。有關主管部門儘快補充完善相關技術標準，特別是木質材料的物理力學性能指標，加速我國木結構建築的發展進程。
六：功能與防護問題
為了保護木結構建築主體、延長其使用壽命以及建築的居住安全，必須對木結構建築採取防火、防蟲和防腐措施，或對建築的木構件進行有效地處理，以達到國家標準《木結構設計規範》的有關要求。在木結構建築中由於比較多地採用木質材料，而蟲害在各類木材中都有可能發生，特別象白蟻、甲蟲等，能在木材上形成蟲眼和蟲溝，有的甚至能深入木材的木質部深處，使木材受到很大的破壞；特別是結構用木材受到白蟻等侵害時，會影響建築物結構的強度、穩定性和耐久性等指標，有時可能會釀成很嚴重的事故。除此之外，還有木結構建築的功能問題，如牆體的隔聲、保溫與隔熱、振動和噪聲等，特別是抗震與防火安全問題，都是人們普遍擔心和關注的問題。所以，在建造木結構建築時，都應該採取有效的預防措施。
木結構建築，在地震災後重建和旅遊資源開發中扮演著重要角色，發揮著不可替代的重要作用，其發展仍舊任重道遠。
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