在水產養殖中，生石灰在清塘等作業中廣泛使用，其原理是生石灰遇水後發生化學反應，放出大量熱量，產生氫氧化鈣，在短時間內使池水的pH 值迅速提高到11 以上從而殺滅水體中的微小生物，因此而用途廣泛。
1、清塘消毒
生石灰清塘分幹法清塘和帶水清塘兩種。幹法消塘一般每667 m2 用生石灰75 kg，帶水清塘則水深1 m，每667 m2 用量為150 kg，能有效地殺死魚塘中的野雜魚、敵害生物和魚類寄生蟲、病原菌等。
2、防治魚病
在魚病易發季節，根據水質情況，在池塘中施用適量的生石灰，對防治細菌性疾病如白頭白嘴病、打粉病、腐皮病、赤皮病等，對爛鰓病、腸炎病等也能收到良好的效果。
3、調節水質
施用生石灰，對池水中的水體有沉澱作用，增大了池水的透明度，同時促進了水中物質的代謝和循環。在夏天，魚類生長旺季時，在池塘中施用生石灰可以減少耗氧，有防止泛塘的作用。
4、改良底泥
生石灰遇水後產生碳酸鈣沉澱。碳酸鈣能疏鬆底泥，增大了底泥的通氣條件，從而促進了底泥中各種微生物的活動，加快了泥底中有機質的分解和礦化作用。
5、增加肥度
施用生石灰後，池塘中的鈣離子的濃度增加，可把淤泥中吸附的各種鹽類交換出來，重新溶入池水中，增加了池水肥度，有利於魚類餌料生物的生長和繁殖。
6、解除毒性
施用生石灰後，所產生的鈣離子，能消除或減弱池水中鉀、鈉、鋅、錳、鐵、鉛等金屬離子過多的毒性。
漁業生產中，施用生石灰須注意以下幾方面的問題：
①若池底淤泥較多，可適當多施，新開挖的池塘或池底淤泥較少，宜少施。
②酸性土質可多施，呈減性土壤則不施或少施。
③施用豬糞、牛欄草糞較多的池塘多施，加速其腐爛分解。
④冬春季水溫較低，可用豬糞、牛欄糞與石灰一同施用，以提高水溫。
⑤新開的池塘，用於清塘消毒時，可以重施。
⑥生石灰不能與漂白粉、硫酸銅、敵百蟲同時使用，因為生石灰遇漂白粉、硫酸銅會起中和反應而失效或減弱藥效；生石灰遇敵百蟲會使毒性增高數倍。
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