首先來說是東南亞沒有出現大一統的帝國的。先說東南亞的幾個有代表性的大帝國疆域圖。
1、高棉帝國
高棉帝國疆域包括老撾、柬埔寨全部，泰國的大部分，越南、緬甸部分地區。只有東南亞大陸部分的一半。
2、緬甸東籲王朝
可以看到，除了越南、柬埔寨（殘存的高棉國家）以及馬來半島，東籲王朝統一了東南亞大陸部分。這是東南亞歷史上最大的大陸王國，但這個最大疆域沒有維持多少年。
3、滿者伯夷
滿者伯夷，幾乎統一了除菲律賓以外馬來人區域，也就是現在的馬來西亞和印尼。這幾個帝國是東南亞歷史上自己形成的，非外來統治的最大的幾個帝國。
原因簡單說下自己的看法。
第一，地理因素
1、東南亞地域太大。
東南亞面積有500w平方公里（私自加上了新幾內亞），算上海域面積就超過1000w平方公里了。擁有這麼大面積的大帝國，在世界歷史上也是不多的。
現代社會，達到500w級別的有：俄、加、中、美、巴、澳。其中除了中國和俄羅斯，其他的都是近代歐洲殖民者在落後的大陸打造出來的，也毀滅了絕大部分土著民族。 東南亞最大的國家是印度尼西亞，面積190w。然後190w到300w級別的十個國家，除了沙特是趁著奧斯曼帝國的毀滅，自己打下來的（畢竟沙漠地廣人稀），其他都是殖民者統一的。比如印度被英國統一，印尼被荷蘭統一。
2、東南亞地形地貌太複雜，太破碎。
東南亞分為大陸半島部分和海洋島嶼部分，面積各佔一半。
大陸部分主要就是中南半島。初中地理對中南半島地形的描述是“山河相間，縱列分佈”。因為古代交通能力的限制，河流和山脈很容易成為古代國家的天然疆界。中南半島，河流和山脈大抵南北走向。南北向的大山脈，把東南亞分隔成一個個南北向的低地谷地。所以在中南半島，南北通行沒問題，東西通行就是各種跋山涉水，不方便征服。最終，各個大的族群被大山巨川阻隔，分別在各自的區域內發展，形成了現代中南半島各種南北長條形狀的國家。
如圖：
海洋島嶼部分就更不用說，島嶼有幾萬個，更加破碎。南北東西跨度還極大，很難形成統一實體。
大陸部分和海洋部分，各自都很難統一。想統一整個東南亞，那就更是難。
第二，文化差異。
個人認為東南亞分為海洋民族和大陸民族兩個大的民族集團。
大陸民族分佈在中南半島上除去馬來半島之外的各個國家。每個國家，都有大片被大河潤澤的衝擊平原。這些地方的民族依靠肥沃的土地，很容易生存，因此安分保守。
海洋民族就是南島人。東南亞的南島人主要是馬來族群，分佈在馬來半島和馬來群島的幾萬個島嶼上，他們這群人跟太平洋上的各個尼西亞人同源。南島人在人類的海洋征服史上可是赫赫有名。南島人從大陸來到臺灣，然後又擴散到北抵夏威夷，南達新西蘭，西至馬達加斯加，東到復活節島的廣大地域。可見南島人是崇尚開拓進取的種群。
附個南島人分佈圖：
東南亞的保守安分的大陸民族最終堅守了佛教。海洋民族的信仰則幾經變換，早先信過印度教和佛教，最終他們的大部分信仰了伊斯蘭教。
特別說下菲律賓，其是馬來族群的特例，因為被西班牙殖民，信仰了天主教。 菲律賓位置孤立，一直是文化盲區。南部靠近印尼、馬來，幾百年前才出現伊斯蘭教的封建國家，北部則幾乎蠻荒。所以其在古代，基本沒有參與東南亞或者東亞的政治，東南亞古代的陸上或是海上帝國，都很少探索、征服此地。
實際上， 緬甸東籲王朝一度幾乎統一東南亞大陸部分，而滿者伯夷也差不多統一了島嶼（剔除異類菲律賓）部分。而由於海洋民族和大陸民族差異太大，很難相融，互相也接觸不足，所以這兩個部分很難進一步形成統一。
第三，生產力和科技因素
這個很好理解，生產力大爆發，促進經濟快速發展，給了國家開拓市場和掠奪資源的動力，激發了對外擴張意願。而強大的生產力和科技能力，提供了了較高的遠程物資輸送能力和對外打擊能力，保證了對外擴張能力。
前面說過，除了中俄，現存所有面積超過500w的國家，都是在近代歐美殖民運動中產生的。這就是例證啊。
1、大陸民族互相征伐，仰仗陸軍，擁有大規模兵團作戰經驗，陸戰能力強。但是普遍對海軍重視不夠，無力遠征島嶼。同理，作為海洋民族的馬來族群，也沒有徵服較大的大陸國家的陸戰能力。
前面說過，大陸民族的那幾個國家，基本都擁有大河潤澤的肥沃大平原，守成就好。遠征海島，耗費巨大，還不一定能征服，就算打下來了，也不好管轄，實在沒有必要。這跟中國直到清朝才勉強接受臺灣是一個道理。
2、民族方面。本區域沒有絕對優勢民族。如今，中南半島的緬族，泰族，京族，高棉人，都有千萬級別。而馬來族群人雖多，卻很愛撕逼，分化成若干民族。像中國或者俄羅斯這樣，主體民族佔比極高，所以吃了大塊的肥（ling）肉（tu），也消（zhen）化（ya）的了
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