最近討論「馬來人種」比較多。那麼我想有必要澄清一點，即我這裡所說的「馬來人種」首先是遺傳概念其次才是體質概念，也相當於「新亞洲人」的概念。在遺傳上是以Y-O/N，mt-N/R（主要是A、N9、Y、B、F、R9等）為主要標記的人群，在體質上接近現代的東南亞人，但現代的印支-馬來人，東南亞人其實大部分都是與尼格利陀人不同程度混雜的人群。
下面我以現代馬來人的mtDNA成分來進行分析哪些可能是原始馬來人種的成分。見2006年Hill'Phylogeography and Ethnogenesis of Aboriginal Southeast Asians'附件中的數據。
B*/B4/B5a：這是馬來人種的基本成分。
E/M9*：不是。M9主要分佈在藏族人和日本人中，因此顯然不是馬來人種的主要成分。而根據'Climate change and post-glacial human dispersals in Southeast Asia'一文，E大約3.3萬年前從M9中分離出來，分化地點很可能就在印支-馬來半島。主要出現在在馬來人中，Semang/Senoi人中未見，因此可確定是古南亞底層成分。
R9*/F1a/F4b:是。
N*/N21/N22：可能是。根據最近泰國和越南人的論文來分析應該是印支-北部灣起源的早期成分。
N9a/Y2：是。
M*：M*集中分佈在雲南、藏南和印支半島西部等地，因此不是馬來人種的原初成分。主要出現在在馬來人中，土著人Semang/Senoi中很少見，因此是早期混雜的古南亞底層成分。
M21/M22：不是。主要出現在Semang/Senoi中，在馬來人中較少見而且分佈不均勻。是尼格利陀人的原始成分。
R21/R22：不是。主要出現在Semang/Senoi中，在馬來人中較少見而且分佈不均勻。是尼格利陀人早期混入的N*/R*成分。
M7*/M7b/M7c：考慮到M7的分支M7a、M7b2等獨特支系分佈在日韓、阿伊努人中，因此不是馬來人種的原初成分。很可能是起源於印支-北部灣的古南亞成分。出現在在馬來人中，Semang/Senoi人中未見。
其它（各僅見一例）:I、U7應該是印度晚期移民成分。Z是東亞移民的底層成分。
綜上所屬，馬來人的母系基本成分可以分成以下4類：
原始 馬來人種成分：B*/B4/B5a、R9*/F1a/F4b、N9a/Y2、N*/N21/N22？
遠古時期混入的古南亞底層成分：M*、M7*/M7b/M7c、E/M9*
晚期擴張時同化的尼格利陀人成分：M21/M22、R21/R22
其他晚近外來移民成分：I、U7、Z
附：
1.泰國清邁人的mtDNA論文
Forensic and phylogeographic characterization of mtDNA lineages from northern Thailand (Chiang Mai)
Bettina Zimmermann & Martin Bodner & Sylvain Amory & Liane Fendt & Alexander Röck & David Horst & Basil Horst & Torpong Sanguansermsri & Walther Parson & Anita Brandstätter
從附件的數據看，我之前發現的N-16111,16172,16189,16362對應N-5581-4562；另外在清邁人中還發現N-5581-4977，這樣看來它們應屬同一未命名的單倍群N-5581。而我發現的N-16263,16274,16343,16357屬於另一N*小支。清邁人中還發現pre-N22。
綜上所述，東亞和東南亞的絕大部分N*支系都源自印支半島。
2.越南人的mtDNA控制區序列
Mitochondrial control region sequences from a Vietnamese population sample
Jodi A. Irwin & Jessica L. Saunier & Katherine M. Strouss & Toni M. Diegoli & Kimberly A. Sturk & Jennifer E. O’Callaghan & Carla D. Paintner & Carsten Hohoff & Bernd Brinkmann & Thomas J. Parsons
從附件數據中可以看到幾個未定義的N*，與泰國北部清邁人比較可以發現：其中存在pre-N22和N-5581-4977。這樣看來泰國清邁人的N*罕見類型很可能仍屬於北部灣起源。
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