韭菜一般是在秋冬季節養根，在第二年春夏期間收穫。韭菜根系的好壞決定了韭菜的產量，所以在秋季韭菜停止收割以後，菜農就會特別注意對韭菜根喜的養護工作。
在秋季韭菜養根期間，此時是不能收割的，因為天氣變得涼爽，很適合韭菜生長，所以此時不收割韭菜，就很容易出現倒伏現象，倒伏後的韭菜很容易出現病害，所以在養根期間，可以在韭菜畦兩旁搭上支架拉上鐵絲，防止韭菜倒伏，還有利於田間通風，促進韭菜生長的同時減少病蟲害的發生。韭菜停止收割是為了使韭菜更好的進行光合作用，這樣光合作用的產物可以向根部輸送，從而使韭菜根系得到更充足的養分促進根系生長。
在韭菜養根前，可進行一次重施肥在提高土壤肥效的同時促進根系發育。此次追肥可使用充分腐熟的豆餅，將豆餅放到行間地面的小溝內，再施肥後澆一次大水，使韭菜更好的吸收到養分。
在韭菜養根期間，除了停止收割和施肥以外，也要注意病蟲害的防治。因為韭菜是多年生植物，和其他蔬菜不同之處就是不能清園徹底消滅病菌和害蟲蟲卵，所以在韭菜養根期間進行對病蟲害的防治工作，才能減少病菌和蟲卵越冬。韭菜的病蟲害只要是疫病、灰黴病和韭蛆，在選擇藥劑進行防治時，要選擇針對性強的農藥，還可以通過根施的方式對韭菜根系進行澆灌，消滅在土壤中越冬的病菌和蟲卵。
在霜降以後，露地種植的韭菜便會枯萎，可以趁著韭菜枯萎時清除田間雜草。在土壤上凍前配合灌水追肥一次，如果當地溫度過低，還可以在韭菜上面覆蓋麥秸或者是落葉來保護韭菜根系不被凍害。
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