兵封雪帝
二者的区别在于：
一、保证金存款是一种质押担保方式，而普通存款则没有担保。
根据最高法的司法解释，保证金存款属于质押担保，占有人是银行，出质人不得随意动用；而普通存款的占有人是存款人，存款人有权自由支配。
二、法院执行规定不同。
在法院执行时，对于出质人保证金账户中的存款，可以冻结但不能划扣。如果保证金有对应的银票、信用证等担保，也不能冻结。必须等到其质押解除后，方能划扣。而存款人普通账户上的存款，法院可以直接执行划扣。
三、存款利率不同。
由于有质押属性，银行会专门制定保证金存款利率，这个利率通常低于银行正常的对外挂牌利率；普通存款则按对外挂牌价执行。
四、转出凭证不同。
保证金存款转出，不需要客户发出指令，而是凭银行内部的联系单；普通账户对外转出，需要客户下达指令，并提供相关银行凭证。
以上是本人的一些总结，只是凭经验整理，未必全对。我是空谷寒潭，与您分享我的知识。
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