羚牛不傷害農民的農作物，過去曾經有村民將羚牛養大用作交通運輸工具，也傳說曾有人將羚牛幼仔從小養大，馴化讓其馱運行李，還可以騎行代步。
然而，羚牛與人之間也發生過沖突。20世紀80年代，秦嶺山區周邊發生過多起羚牛闖入村莊或農戶家中頂傷人事件。這是因為羚牛的棲息地大面積減少，人類生產生活對羚牛產生干擾，加上那些失群的獨羚牛四處遊蕩，與人發生衝突的事就時有發生。羚牛的生存一度受到人類活動的威脅。
盜獵:一些違法分子為了獵取羚牛的肉，牟取暴利，使用高壓電纜、鋼絲套、 鐵夾等非法獵具殺害羚牛，對物種資源造成很大破壞。
交通設施:在秦嶺已有兩條鐵路，還有數十條幹線公路穿越秦嶺，這些將羚牛的棲息地分割為若干斑塊、片斷，羚牛棲息地因此而破碎化。
患口蹄病。
盜獵者獵殺羚牛後剔肉並遺棄皮骨。
疾病:疾病也是造成羚牛資源損害的原因之一。在秦嶺山地中的有蹄類動物，包括斑羚、野豬、鬣羚，和羚牛一樣，會感染病菌，致使動物皮下患幹烙樣壞死，身體逐漸喪失抵抗力衰竭而死亡，對種群的增長具有一定的影響。圖為冬、春季節患病的羚牛獨自行進在雪地中。
保護現狀: 羚牛是珍貴物種，我國政府為保護珍稀野生動物制定了一系列政策和法規，頒佈了《中華人民共和國野生動物保護法》，建立了各類自然保護區。1998年起還實行了天然林禁伐和退耕還林政策，秦嶺林區因此恢復了寧靜。經過近20年的自然修復，秦嶺森林植被得到了恢復，為野生動物提供了更多的保護和更好的棲息環境。
目前，秦嶺已建立了16處自然保護區，保護面積佔秦嶺羚牛棲息地總面積的60%左右，有70%以上羚牛得到了有效的保護。一些針對羚牛的傷害還在繼續，好在隨著國家生態文明建設的發展，人們的保護意識不斷提高，羚牛種群必將得到更好的保護和繁衍。
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