羚牛不伤害农民的农作物，过去曾经有村民将羚牛养大用作交通运输工具，也传说曾有人将羚牛幼仔从小养大，驯化让其驮运行李，还可以骑行代步。
然而，羚牛与人之间也发生过冲突。20世纪80年代，秦岭山区周边发生过多起羚牛闯入村庄或农户家中顶伤人事件。这是因为羚牛的栖息地大面积减少，人类生产生活对羚牛产生干扰，加上那些失群的独羚牛四处游荡，与人发生冲突的事就时有发生。羚牛的生存一度受到人类活动的威胁。
盗猎:一些违法分子为了猎取羚牛的肉，牟取暴利，使用高压电缆、钢丝套、 铁夹等非法猎具杀害羚牛，对物种资源造成很大破坏。
交通设施:在秦岭已有两条铁路，还有数十条干线公路穿越秦岭，这些将羚牛的栖息地分割为若干斑块、片断，羚牛栖息地因此而破碎化。
患口蹄病。
盗猎者猎杀羚牛后剔肉并遗弃皮骨。
疾病:疾病也是造成羚牛资源损害的原因之一。在秦岭山地中的有蹄类动物，包括斑羚、野猪、鬣羚，和羚牛一样，会感染病菌，致使动物皮下患干烙样坏死，身体逐渐丧失抵抗力衰竭而死亡，对种群的增长具有一定的影响。图为冬、春季节患病的羚牛独自行进在雪地中。
保护现状: 羚牛是珍贵物种，我国政府为保护珍稀野生动物制定了一系列政策和法规，颁布了《中华人民共和国野生动物保护法》，建立了各类自然保护区。1998年起还实行了天然林禁伐和退耕还林政策，秦岭林区因此恢复了宁静。经过近20年的自然修复，秦岭森林植被得到了恢复，为野生动物提供了更多的保护和更好的栖息环境。
目前，秦岭已建立了16处自然保护区，保护面积占秦岭羚牛栖息地总面积的60%左右，有70%以上羚牛得到了有效的保护。一些针对羚牛的伤害还在继续，好在随着国家生态文明建设的发展，人们的保护意识不断提高，羚牛种群必将得到更好的保护和繁衍。
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