雲南高原湖泊眾多，是中國五大湖區之一，湖區總面積為1066平方公里，集水面積9000平方公里，總蓄水量約300億立方米。全省面積在1平方公里以上的湖泊共有37個。滇東主要的湖泊有滇池、撫仙湖、陽宗海、杞麓湖及星雲湖等；滇西主要有洱海、程海、瀘沽湖、劍湖、茈碧湖、納帕海、碧塔海等;滇南主要有異龍湖、長橋海.大屯海、普者黑等。
其中,最著名的是被稱為“九大高原湖泊”的滇池、洱海、撫仙湖、瀘沽湖、陽宗海、程海、碧塔海、普者黑、異龍湖。滇池
以湖泊面積而論，滇池最大，在全國名列第六，湖面的海拔高度為1886米，南北長39公里，東西最寬為13公里。湖岸線長163.2公里，面積為306.3平方公里，容水量為15.7億立方米，素稱"五百里滇池"。主要河流有盤龍江、金汁河、寶象河、海源河、馬料河、落龍河、撈魚河等，出水口為螳螂江。滇池水由海口注入普渡河.匯入金沙江.屬長江水系，流域面積2855公里，為我國的第六大淡水湖，是一顆璀璨的高原明珠。
洱海
洱海，湖面積為251平方公里(水位為1974米)，總容量為25.3億立方米，匯水面積為2565平方公里，湖長42.5公里，平均湖寬6.3公里，最大湖深22米，平均湖深10.2米，湖周長117公里。 洱海水位1966米時(85高程)南北長42.0千米，東西寬最大8.8千米，最小3.05千米，最大水深21.5米，平均水深10.8米，湖面面積252.91平方千米，蓄水量27.94億立方米，湖中島嶼面積0.748平方千米，湖岸線129.14千米， 是雲南高原僅次於滇池的第二大淡水湖泊。
撫仙湖
撫仙湖湖面海拔高度為1722.5米，湖面積216.6平方公里，湖水平均深度為95.2米，最深處有158.9米，僅次於長白山天池，是中國第二深水湖。湖容積為206.2億立方米，相當於12個滇池的水量，6倍的洱海水量，太湖的4.5倍，佔雲南九大高原湖泊總蓄水量的72.8%，佔全國淡水湖泊蓄水量的9.16%。撫仙湖水質為I類，是國家一類飲用水源地，也是我國水質最好的天然湖泊之一。
瀘沽湖
瀘沽湖面積50多平方千米，海拔2690米，平均水深45米，最深處達93米，透明度高達11米，最大能見度為12米，湖水清澈蔚藍，是中國最深的淡水湖之一。湖中有5個全島、三個半島和一個海堤連島，形態各異，翠綠如玉。
陽宗海
陽宗海海拔1770米，南北長約12公里，東西寬約3公里．湖面積30平方公里，平均水深22米，最深30米。陽宗海為高原斷陷湖泊，湖岸平直，湖底凹凸不平，有巖洞暗礁，水色碧綠，透明度高，為淡水湖，湖內盛產著名的金線魚。
程海
湖面海拔高程1502米，湖泊面積75.97平方公里，南北長24.98千米，東西最大寬5.205千米，流域面積318.3平方公里，平均水深24.98米，最大水深為35.87米，蓄水量16.8億立方米，為滇西第二大淡水湖，是世界上天然生長螺旋藻的三大湖泊之一。
星雲湖
湖面海拔高出撫仙湖1米，該湖南北長10.5公里，東西平均寬3.8公里，最窄處2.3公里，湖岸線長36.3公里，總面積為34.71平方公里；平均水深7米。最大深度10米，透明度約1.5米，湖容量 1.84億立方米。
杞麓湖
杞麓湖屬斷層陷落湖，湖泊長軸呈東西向，湖水位1796.62米，湖面積36.73平方公里，湖岸線長度45公里，湖泊長度13.5公里，寬度平均2.72，最寬5.2公里，容積1.45億立方米，匯水面積340.8平方公里。
異龍湖
異龍湖海拔1407.11米，周長150華里，水面面積39平方公里，平均水深2米，最深處約7米蓄水約1億立方米。異龍湖屬重富營養型湖泊。
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