灵谷寺位于江苏省南京市玄武区紫金山东南坡下，中山陵以东约1.5千米处，始建于天监十三年(514年)，是南朝梁武帝为纪念著名僧人宝志禅师而兴建的"开善精舍"，初名开善寺。明朝时朱元璋亲自赐名"灵谷禅寺"，并封其为"天下第一禅林"，为明代佛教三大寺院之一。《金陵梵刹志》将其与大报恩寺、天界寺并列为大刹。
灵谷寺内有放生池、金刚殿、天王殿、无量殿(又称无梁殿)、五方殿、毗卢殿、观音阁等殿堂，寺后有宝公塔。灵谷寺玄奘纪念堂中供奉玄奘法师坐像，像前的玄奘法师顶骨纪念塔中有玄奘顶骨舍利。
1982年，灵谷寺无梁殿被列为江苏省文物保护单位。1983年，南京灵谷寺被定为汉族地区佛教全国重点寺院。2006年，国务院将国民革命军阵亡将士公墓、中山陵附属谭延闿墓、邓演达墓列为全国重点文物保护单位。灵谷寺最初为南朝梁武帝为尊崇宝志禅师兴建的"开善精舍"，位于紫金山独龙阜玩珠峰南麓，始建于南朝天监十三年(514年)，梁武帝为埋葬宝志和尚，在独龙岗建开善精舍和志公塔。
唐朝乾符年间改名为"宝公院"。
宋开宝年间， 易名为开善道场。
宋太平兴国四年(979年)，宋太宗题寺额为"太平兴国禅寺"。
元朝及明朝初年时被称作"蒋山寺"。
明太祖朱元璋选定此处修建自己的陵墓明孝陵，于洪武十四年(1381年)将原寺移到灵谷寺现址，地形是"左群山右峻岭"之间的一片谷地，可谓山有灵气，谷有合水，故而命名为"灵谷禅寺"。用砖石砌成的无量殿(又称无梁殿)，安置无量寿仏本尊，灵谷寺的寺匾额是朱元璋所赐，并敕封寺名"灵谷禅寺"。当时灵谷寺规模很大，占地500余亩。还有灵谷塔和三绝碑等胜境;玄奘纪念堂中供奉玄奘法师坐像，像前的玄奘法师顶骨纪念塔中有玄奘顶骨舍利。
清朝初年，遭受冰火打击，但次年很快地就复兴了，清康熙四十六年(1707年)，康熙南巡时，临幸钟山，御赐"灵谷禅林"匾额，并书"天香飘广殿，山气宿空廓"对联赐寺。 虽接待过康熙帝与乾隆帝在这里逗留。但是，建筑大
灵谷寺建筑
多毁于清朝咸丰同治年间清军与太平军的兵火，虽然同治年间寺院在曾国藩等人得以重建，规模已大不如明代灵谷寺的威容盛况。
民国十七年(1928年)，国民政府在灵谷寺原址建设国民革命军阵亡将士公墓，原灵谷寺则迁至东侧同治六年所建的龙神庙。四方墙壁设置了110座石碑，刻有国民革命军阵亡将士名单。
1949年，中华人民共和国成立后，这一带被改为"灵谷寺公园"。
1973年，南京灵谷寺修复开放，经有关部门批准，从市文管会请回供奉玄奘法师灵骨，寺内专设"玄奘法师纪念堂"，纪念堂正中心设13层密檐楠木塔，玄奘法师顶骨即安奉于此中。
1980年，真慈大和尚住持灵谷寺后，对灵谷寺进行了全面维修，重建了山门、大雄宝殿、祖堂、客堂、志公殿、藏经楼，新建了观音宝阁、玄奘院等建筑。
1983年，南京灵谷寺被定为汉族地区佛教全国重点寺院。
2004年，灵谷寺新建仿唐建筑玄奘院。
2014年4月，灵谷寺举行开山1500周年庆典暨第四届金陵礼佛文化月活动。
2016年1月8日，灵谷寺玄奘院地宫举行落成仪式，镇寺之宝--玄奘的顶骨从玄奘院大殿移驾地宫内保存。以后，地宫将作为这份玄奘顶骨的永久存放和供奉之地。
灵谷寺山门是灵谷公园的大门，这座仿古建筑的山门是20世纪30年代重建的，其形式为三拱门，绿色琉璃瓦檐顶，外墙为红色，所以也叫红山门。门额上有"灵谷胜境"四字，是现代书法家钱松岳先生的手笔。门外的一对石狮，是建造阵亡将士公墓的北平军分会赠送的。红山门后一条青石铺就的两道，在道的尽头，矗立着一座阵亡将士牌坊，牌坊建于民国二十四年(1935年)，是为纪念北伐阵亡将士而建，牌坊的台基长32.7米，宽16.6米，高10米，共五间，全部用钢筋水泥构筑，座基外镶花岗岩，绿色琉璃瓦覆顶。牌坊前中门门额上横刻"大仁大义"四字，背面刻"救国救民"四字，都是国民党元老张静江题写的。
无梁殿
无梁殿
无梁殿是明代灵谷寺仅存的一座建筑，因殿内供奉无量寿佛而得名。由于这座殿是砖石拱券结构，不用梁木，所以俗称"无梁殿"。无梁殿建于明朝洪武十四年(138年)，大殿的东西长53.8米，殿前露台宽敞，面阔5间，进深3间。殿顶是重檐九脊琉璃瓦，屋脊上的3个琉璃瓦塔是喇嘛塔。其建筑结构改变了中国古建筑梁柱结合框架式的建筑传统。整座建筑找不到梁柱，全部用砖砌造而成。采用了中国古代石拱桥的建造方法，由基层用砖先砌5个洞，合缝后叠成一个大型的拱形殿顶。5个开门的每一间就是一券，每排为5券，正中一间券洞最大，宽11.4米，高14米。内部虽为券洞结构，外部却仍以仿木结构的形式出现，檐下有出挑的斗拱，正面还设有门窗，是一座采用多样券法，错综
白玉赑屃
连接后构成的建筑。
灵谷寺无梁殿前有一汉白玉赑屃，上驮一碑，这块碑是谭延闿的墓碑，上面原有蒋介石题书的"中国国民党中央执行委员前国民政府主席行政院长谭公延闿之墓"字样。墓碑之下有龟趺座，四周围有石栏，为谭延闿墓的起点。后来原碑文磨平，由中山陵园管理处第一任处长高艺林摹乾隆笔意题书"灵谷深松"。
灵谷塔
灵谷塔--原名阵亡将士纪念塔，是阵亡将士公墓的主要建筑之一，建于民国二十年~民国二十二年(1931~1933年)。塔的设计者是美国著名建筑师茂非和中国建筑师董大酉。该塔高约60米，九层八面，全部用钢筋水泥建筑。每层以绿色琉璃瓦披檐，塔外绕有走廊(云座)，围以石栏杆的平台，塔之中部用螺旋式，扶梯有260多级围转而上，每层每面有门通至塔外绕之平座，绕台可鸟瞰钟山景物。正门横帽上的"灵谷塔"三个字是解放后陵园管理处第一任处长高艺林所书。塔底层外壁石刻 "精忠报国"为蒋中正题书。侧门分别是"成功"、"成仁"，后门为"有志竟成"。
松风阁
松风阁
松风阁是一座依山而建的仿走马楼式建筑，面阔9间，屋顶为重檐式，铺以蓝色琉璃瓦。这座建筑是"国民革命军阵亡将士"的纪念馆。纪念馆于1931年起建造，由美国建筑师茂非按中国传统的民族建筑形式设计，造价21.5万元。1933年完工后正式定名"革命纪念馆"。这幢二层楼建筑，东西长41.7米，南北宽19.7米，为钢筋水泥仿木结构。外有回廊，楼下为9间，中为穿堂，上面是走马楼式的楼屋。上下遍设架柜，供陈列阵亡将士遗物或举办展览。
宝公塔
宝公塔
宝公塔是南朝梁武帝用来安葬宝志和尚舍利的塔，当时建塔耗资20万银两。后因朱元璋建明孝陵，将塔与寺一起迁往这里，改名叫灵谷塔。塔初建时为5层，可惜原塔早已毁尽。宝志和尚是南京栖霞东阳人，7岁出家，死于梁大监十三年，是梁武帝最敬仰的和尚之一。
宝公塔原为七级，砖木结构，明初在今灵谷塔位置，建造烈士公墓时迁移至此，为覆钵体形式，1941年完工。
折叠
将士公墓
国民革命军阵亡将士公墓位于无梁殿东西后三个方位，于民国二十四年(1935年)落成，共建筑有公墓3座，第一公墓居中，位于无梁殿后面;第二、三公墓位于无梁殿东西两侧。三个公墓共葬入1029名国军阵亡官兵，多数是北伐和12.8淞沪会战阵亡将士。牌坊建于1933年，建造在42级石阶之上，台基长32.7米，宽16.6米，高10米，共5间，钢筋水泥结构，座基外镶花岗石，绿色琉璃瓦盖顶，饰有有水泥脊兽，斗拱三级，四角起翘。前后门额上镌刻有"大仁大义"、"救国救民"八个大子，左右门额上配有瓷质国民党党徽。第一、二、三公墓的地上建筑基本已经被毁。
玄奘纪念堂
大雄宝殿东跨院的正厅为玄奘法师纪念堂，里面陈放着六面七级飞檐桃角檀香宝塔一座，塔内安放着玄奘法师的部分顶骨。玄奘，通称三藏法师，唐朝高僧，唯识宗的的创始人之一，与鸠摩罗什、真帝并称为中国佛教三大翻译家。据文献记载，玄奘法师圆寂于西安，葬于兴教寺塔，黄巢起义时遭盗而捐残。后来，宋朝天禧寺和尚法政，在陕西终南山紫阁寺得玄奘法师顶骨，迁葬于南京中华门外的大报恩寺，建一座砖塔，埋藏顶骨，名为"三藏塔"。清未遭兵燹而毁。
1973年，南京灵谷寺修复开放，将存放于文管会的顶骨迎回，后建玄奘院、造金丝楠木纯金构建玄奘大师顶骨舍利塔进行供奉。
2016年1月8日，灵谷寺玄奘院地宫举行落成仪式，镇寺之宝--玄奘的顶骨从玄奘院大殿移驾地宫内保存
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