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《轉》譯
《轉》譯是轉化醫學網原創編譯類品牌欄目， 重點關注基因檢測、細胞治療、體外診斷、精準醫療等轉化醫學領域，旨在傳遞國外新技術、新動態，同時圍繞這些領域的知名企業、專家觀點、商業模式等也是《轉》譯關注的重點。
長久以來，學術界已知認為特定基因通過轉錄產生mRNA並繼續翻譯產生蛋白質以對細胞活動乃至機體性狀進行調節與控制。然而，偉大的中心法則事實上並不能涵蓋和解釋所有的生命現象，最近幾年，越來越多的研究闡述著中心法則之外的基因故事。科學家發現即便不通過轉錄與翻譯，某些特殊的DNA片段也能夠通過獨特的方式對疾病的發生產生影響。
日本理化學研究所（RIKEN，RIkagaku KENkyusho/Institute of Physical and Chemical Research）領導的FANTOM項目團隊（fantom.gsc.riken.jp）在十年前發現並開創了非編碼RNA研究領域，首次揭示了哺乳動物基因組轉錄過程的複雜性。
十年之中，FANTOM項目團隊繼續著對非編碼RNA起源和功能的研究。
FANTOM對於非編碼RNA的最新研究進展發表在最新一期Nature雜誌上，標題為“An atlas of human long non-coding RNAs with accurate 5′ ends ”。
在這一最新的研究中，FANTOM團隊建立了一個全面的人類非編碼長鏈RNA圖譜，基本對既有的基因表達模型進行了深度的改進，讓其他研究人員能夠更好地對RNA的多樣性與不同功能進行評估。
目前大多數與RNA轉錄圖譜繪製相關的研究相對過分依賴準確度較低的RNA轉錄產物起始或5'端測序。為了克服這個限制，FANTOM團隊使用了一種稱為基因表達Cap分析（CAGE）的新技術。該技術用於構建具有更為精確的5'末端人非編碼長鏈RNA圖譜，可以精確定位相關RNA在基因組中的起始位置。
FANTOM的最新圖譜包含了27,919個非編碼長鏈RNA，首次闡明並總結了它們在主要人類細胞類型和組織上的表達模式。通過該圖譜與基因組遺傳數據的綜合分析，研究人員發現人類基因組中存在的19,175個功能相關非編碼長鏈RNA，這意味著人類基因組內可能存在大約20,000個與蛋白編碼基因同樣會對疾病發生髮展造成影響的非編碼長鏈RNA。
“學界對於我們基因組中數以千計非編碼長鏈RNA存在著激烈的爭論。這些RNA究竟是像蛋白編碼DNA一樣影響著我們的性狀，還是僅僅作為轉錄翻譯的副產物存在於細胞中，一直都是一個令人費解的問題。”文章的作者，RIKEN生命科學技術中心（Center for Life Science Technologies ，CLST）高級訪問學者，西澳大利亞大學哈里珀金斯醫學研究所的Alistair Forrest教授表示。 “通過整合和改進基因的表達模型，結合進化和遺傳研究的相關數據，我們發現
這些非編碼長鏈RNA中的大多數看起來似乎是擁有某些功能的。同時，我們發現其中將近2,000個非編碼長鏈RNA與疾病和其他相關遺傳性狀有著潛在的聯繫。”“有趣的是，”文章的第一作者，CLST的Chung-Chau Hon博士表示，“我們發現大多數非編碼長鏈RNA似乎是從增強子中轉錄產生的，這一發現加深了我們對非編碼長鏈RNA主要異質起源的理解。”
An atlas of human long non-coding RNAs with accurate 5′ ends. Nature, 2017; DOI: 10.1038/nature21374
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