一、分公司一樣要辦理稅務登記（三證合一後的統一代碼是稅務登記的標識）
主席令第49號《徵管法》第十五條：
企業、企業在外地設立的分支機構和從事生產、經營的場所，個體工商戶和從事生產、經營的事業單位（以下統稱從事生產、經營的納稅人）自領取營業執照之日起三十日內，持有關證件，向稅務機關申報辦理稅務登記。稅務機關應當自收到申報之日起三十日內審核併發給稅務登記證件 分支機構要辦稅務登記
國務院令第362號12條：第十二條 從事生產、經營的納稅人應當自領取營業執照之日起３０日內，向生產、經營地或者納稅義務發生地的主管稅務機關申報辦理稅務登記，如實填寫稅務登記表，並按照稅務機關的要求提供有關證件、資料
總局令第36號第3條：三、第十條修改為：“企業，企業在外地設立的分支機構和從事生產、經營的場所，個體工商戶和從事生產、經營的事業單位（以下統稱從事生產、經營的納稅人），向生產、經營所在地稅務機關申報辦理稅務登記
二、總分公司的會計處理
1、相關稅法和會計準則規定：
（1）分公司獨立核算：是指分公司作為一個單獨的會計核算主體，進行單獨核算，單獨建賬進行管理
（2）分公司非獨立核算：
①是指分公司不作為一個單獨的會計核算主體，和公司總部一起核算，不用再設立新的賬套進行核算管理
②非獨立核算單位，亦稱“報帳單位”，與“獨立核算單位”相對。對本單位經營活動過程及其成果不進行獨立的完整的會計核算的單位。這些單位除負責保管使用一定的固定資產外，主要向上級領取一定數額的資金、物資來進行業務活動，並把日常發生的經濟業務，經填制憑證和整理彙總報送上級進行會計核算。如商業企業中心店所屬的分銷店，企業、事業單位中的學校等
③公司要求確定
④非獨立核算：國稅這塊，經總公司主管稅務機關同意後，分公司實行增值稅預徵，然後由總公司統一抵扣； 營業稅按公司所屬地分別繳納。如果分公司與總公司經營的業務相同，分公司實行報賬制度，同時要在所屬地辦理相關證照。
⑤非獨立核算，指的是分公司不能單獨開立基本賬戶，不能單獨領用發票，可以在總公司下設單獨賬戶，統一納稅。
（3）獨資企業：
應該在年終比照個體工商戶的核算要求計算出本年的利潤總額，然後按個人所得稅稅率繳納個人所得稅，不需要繳納企業所得稅。
借：個人所得稅 借：本年利潤
貸：應交稅費-個人所得稅 貸：個人所得稅
2、專業建議
（1）非獨立核算總公司會計也要單獨建賬
分公司哪怕選擇非獨立核算，也建議將交到總公司的單據獨立建賬套，因為2012年57號公告說得很清楚，跨省總分所得稅實行彙總計算，分配繳納，分公司的稅務有權檢查分公司的賬務，如果把單據和總公司的單據一起做進總公司的賬中，分公司的稅務如何查分公司的賬呢？
（2）總分增值稅各交各的：
想彙總由總公司繳納，跨省的由財政部和總局批准，省內的由總財政和稅務批准
（3）總分企業所得稅：
所得稅嚴格按照國家稅務總局2012年57號公告和四川的62號文件
電話碼為028內的由總公司彙總計算彙總繳納
電話號碼028外的，由總公司計算總公司分配給各分公司繳納
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