Shell是什么？
shell本身是一个命令解释器，介于操作系统的内核（kernel）和用户之间，可以执行系统调用及系统命令等，让用户以此来与操作系统实现互动。同时，它也用来指一种计算机程序语言（类似于C、Python等）。一个shell程序一般被称为一个脚本。
Shell语言的流派
目前，shell主要有两大流派：
sh:
burne shell (sh)
burne again shell (bash)
csh:
c shell (csh)
tc shell (tcsh)
korn shell (ksh)
目前，大部分Linux系统预设的shell都是bash。
Shell 编程概述
在 Linux 下有一门脚本语言叫做：Shell 脚本，这个脚本语言可以帮助我们简化很多工作，例如批量运行一些命令等，所以还是很有必要学习它的基本用法的，一个简单的 hello.sh 脚本像下面这样。
#!/bin/bash
echo "Hello World!"
第一行 #!/bin/bash 标识该 Shell 脚本由哪个 Shell 解释：/bin/bash。将上面的两行内容写到文件hello.sh中，就可以执行了：
执行shell脚本方法1：
#这样可以省略第一行的：#!/bin/bash
sh ./hello.sh
执行shell脚本方法2：赋予权限才可以执行：
# 赋予可执行权限
chmod a+x hello.sh
# 执行 文件的第一行必须指定执行shell的路径：#!/bin/bash
./hello.sh
# 结果
Hello World!
Shell 变量
Shell 变量分为 3 种：
- 用户自定义变量
- 预定义变量
- 环境变量
定义变量需要注意下面 2 点：
- 等号前后不要有空格：NUM=10
- 一般变量名用大写：M=1
使用 $ 符号调用变量，例如：
VAR="Hello Shell!"
echo $VAR
注意：变量定义直接给变量取名字，变量值如果字符串中有空格等特殊字符需要用引号引起来，这样VAR变量中存储了一个字符串，再次调用变量的值需要加符号：$VAR
1. 用户自定义变量
支持字符串类型，浮点等类型，常见有这 3 个前缀：
- unset：删除变量
- readonly：标记只读变量
- export：指定全局变量
注：可将上面内容存入一个sh结尾的文件中运行；
2. 预定义变量
预定义变量常用来获取命令行的输入，有下面这些：
一个例子：
执行./hello.sh 1 2 3 4 5 的结果：
3. 环境变量
环境变量默认就存在的变量，常用的有下面这几个：
- HOME：用户主目录
- PATH：系统环境变量 PATH
- TERM：当前终端
- UID：当前用户 ID
- PWD：当前工作目录，绝对路径
还是看例子：
运行结果：
shell 语句
1. if 语句
这个跟高级语言的 if - else - if 类似，只是格式有些不同而已，也来看个例子吧：
2. for 循环
这是一个 for 循环基本使用例子，挺简单的，有点类似 Python：
运行结果：
3. while 循环
注意与 for 循环的区别：
运行结果：
shell命令应用：
其实我们打开的linux的终端也是一个shell，上面很多命令不用存到文件中也可以直接在终端运行；下面举例shell编程的运用；
1.利用循环批量生成命令，分别存储到不同的文件：
#注意：命令写成一行的时候用 ; 分隔不同语句块。
for i in xaa xab xac xad xae xaf xag xah xai xaj xak xal xam xan;do echo "perl /share/work/huangls/piplines/01.script/kegg_update_get_anno.pl $i $i.anno $i.fa" >$i.sh;done
2.利用循环批量修改文件名：
这里我想把下面文件名字中红色字符批量删除：（这里需要提前学习字符截取）
命令示例如下：
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