在嫦曦转世的嫦娥吃下长生不老药之后，恢复了法力，也恢复了前世记忆，当她看着眼前妖族敌人，又是射杀了帝俊九位孩子，更是导致自己身陨的元凶。但是上天仿佛在跟嫦娥开了个天大的玩笑，今生却让后羿成了自己的丈夫。嫦娥悲痛欲绝，默默回到孕育她的太阴星。
而后羿被嫦娥镇住，只能眼睁睁看着嫦娥飞向太阴星，后羿到现在都还不明白这到底是怎么回事，本来好好的，为什么吃下了长生不老药之后就变了。但是后羿在看着嫦娥飞走时却也是知道嫦娥一去就不会回来，想要挣脱嫦娥的封印，但是力有不绐，也只能发出一声声的大喝，一遍遍的说着为什么。
当天地间响起东皇太一的怒喝时，后羿隐隐明白事情并不简单。东皇在西方二圣散去天机时，立马察觉到了嫦曦，而后稍微一掐算，就知道了前因后果。当知道嫦曦投胎成了后羿的妻子时，那真的是怒火中烧，而且东皇的颜面可谓是丢失殆尽，头上隐隐有绿光冒出。东皇这一次说什么都不能放过后羿，随后就出了南天门往后羿部落急驰而去。
而同时东皇的一声大喝也把十二祖巫惊醒，十二祖巫听到东皇话语中饱含怒火，虽然不知道发生了什么事情，但是十二祖巫也不能看着后羿出事，因为巫族已经损失了一位大巫夸父，不能在损失一位，而且后羿的箭术奇高，眼看一会元时间就要过去了，巫妖战争中后羿还有大作用的。随后十二祖巫就朝着后羿部落赶过去。
当后羿正为嫦娥的无故离去而伤痛时，屋内走进来一位老者，后羿看到这位老者仿佛是即将溺死之人看到一根救命草。后羿连忙询问老者长生不死药的事情，为什么嫦娥会无缘无故的离去。老者看着后羿，不悲不喜，脸色平静，不管后羿如何询问，老者都没有回答，最后只是告诉后羿，嫦娥乃嫦曦转世，现在已回了太阴星。又询问后羿是否愿意陪着嫦娥，随嫦娥而去。
当后羿知道嫦娥的前身时，顿时明白了嫦娥之前的反常是因为什么，同时也为之前自己怀疑嫦娥而羞愧。也明白嫦娥离自己而去不告诉原因是想把这一切都自己扛着，不想让后羿左右为难。但是现在后羿明白了一切，如果还让嫦娥一个人去承受那噬心蚀骨之痛，让其一人孤零零的在太阴星上，后羿做不到。随后告诉老者愿意陪着嫦娥。
老者知道后羿的意愿后，还是一副高高在上的样子，仿佛这一切本就该如此的样子。而后老者告诉后羿，太阴星为妖族掌管，而后羿又是巫族，需要散去自身血肉，毁去巫族道纹。再以大神通帮助后羿从新凝聚肉身，但是这样一来后羿就变成了另外一人，嫦娥也不认识。后羿听完之后，朝着盘古殿的方向跪下，遥遥行了一礼。老者又告诉后羿，天地间一切皆有定数，后羿为嫦娥改命是逆天之举，会受到相应的惩罚，在太阴星上有一颗桂树，要求后羿砍倒桂树才能与嫦娥相认，如果提前相认，嫦娥就会飞灰湮灭。后羿却不知道这桂树乃是天地初开是就已经存在的一颗月桂树，此树高五百丈，历伤而愈，经久不倒。
当老者说完以后，后羿用神通打碎血肉，击碎道纹，只余留真灵附着在头骨上，老者也没有食言，朝着后羿头骨打出一道金光，头骨慢慢变成一人族男子模样，上半身赤裸，而同时后羿血肉以及其余骨头在老者的神通下变为一把黑色斧头。而后后羿变的人族男子拿着斧头，又抱起嫦娥喜欢的兔子看着老者，老者又对着男子打出一道神通，男子缓缓朝着太阴星飞去，最后落在一颗桂树下面。从此以后太阴星上就多了一位拿着斧头的男子，日复一日的砍着桂树。而嫦娥怀里多了一只兔子。
当东皇赶到后羿部落后，在后羿部落找不到后羿，也找不到嫦娥，随后含怒出手，顿时后羿十多万族人的部落化为飞灰。东皇灭了后羿部落后，怒火发泄了一些，慢慢冷静下来。也知道此事终究是不光彩，也不宜太过招摇，只当日后巫妖大战时再找后羿算账。随后往南天门而去。
当东皇离去不久后，十二祖巫也来到此地。当看着眼前天翻地覆的景象，以及消失不见的后羿部落，后羿巫族道纹更是消散天地间，祖巫们顿时脸色一变，随后更是怒不可遏。暴脾气的祝融首先就忍不住了，跟帝江说妖族欺人太甚，作为统领天下万族的两位妖皇，对自己孩子做下的恶视而不见，却对巫族毫不留情，如此不公。又后羿解救苍生，却落得身死道消的下场，要为巫族讨个公道，为后羿讨个公道。
就连平时比较冷静的烛九阴都对帝江说是东皇先不顾鸿钧老祖的命令，对巫族出手，巫族可以名正言顺的出对妖族出手，不用顾忌。帝江本来看着眼前的一切就及其恼火，而且也忍了妖族差不多一个会元的时间，现在可以名正言顺的攻打妖族，帝江当场就表示召集巫族族人，一起打上妖庭。
在帝江表态之后祖巫散去分别去找剩下的大巫，召集巫族部落，路中遇到妖族二话不说，祖巫悍然出手，不留情面，这下子洪荒大陆妖族遭了殃，很多的妖族种族被灭族，消失在洪荒大舞台上。
当东皇灭了后羿的巫族部落，而祖巫有灭了妖族种族后，天上的劫云越加厚重，缓缓覆盖洪荒整个大陆，当巫族召集部落聚集在不周山脚下时，劫云完全覆盖洪荒，却是劫云已成。
妖族在知道巫族的行动时，也没有闲着，召集妖族人手，严阵以待。同时帝俊把自己侥幸活下来的唯一的孩子，交给女娲看管，帝俊也知道此次大战变数极多，自己又身在劫中，把孩子交给女娲看管也是为保住孩子的性命，另一方面如果自己身有不测则为妖族留下一份香火。
而这次巫妖大战可以说是包含洪荒大陆所有种族的，不过却有一族不在其中，人族因之前妖族炼宝屠杀人族，对妖族极其仇恨，而同时现在的人族之王伏羲又是妖族转世，所以人族两不相帮，却也是逃过此劫，成为巫妖大战之后最强大的一族。
几位圣人却是高高在上，不会过问此事，女娲身为妖族，但是也不敢逆天数，参与其中。就这样巫妖大战终究是没有等过一会元时间，提前打响，这一战直接打的天地破碎，洪荒大陆被打小了数倍（下节详表）
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