截至1月29日13時，阿壩州暫未發現新型冠狀病毒感染肺炎確診病例，馬爾康市發現疑似病例1例。
持續加強防疫卡點設置，1月28日13時至1月29日13時出動衛生防疫人員212人、執勤警力（含輔警）304人，累計出動衛生防疫人員843人、執勤警力（含輔警）1305人，各縣（市）交通要道設置衛生防疫卡點增加至47處，對過往車輛及人員進行24小時全覆蓋檢測，累計檢查車輛75750臺次、人員253382人次，未發現發熱病人。依法依規對遊客進行勸返。公安機關摸排走訪重點疫區的人員696人，均通過體溫體徵檢查無異常。醫療機構、衛生防疫卡點開展有關消殺工作，消殺面積達到49.45萬平方米。
全州共185個醫療機構設置發熱門診，1月28日0-24時，全州醫療機構發熱門診共接診91人、留觀7人，全州發熱門診累計共接診571人、留觀51人。
在13縣（市）城區和部分村莊設置了零散醫用廢棄物集中收集點，累計設置口罩及特殊有害垃圾收集桶696個。醫療優化4條醫療廢物收集運輸路線，除九寨溝縣通過焚燒的應急方式處置醫療廢物外，其餘12縣（市）179個醫療機構實現全覆蓋，加大了醫療廢物收集處置速度、力度、精度。
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