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在這項研究中，這些研究人員報道了9名被確診為原因不明的病毒性肺炎的患者的流行病學數據。
在一項新的研究中，來自中國疾病預防控制中心（China CDC）和中國科學院等多家中國研究機構的研究人員報道對來自中國武漢的9名患者的10個新型冠狀病毒（2019-nCoV）基因組序列進行了新的遺傳分析，發現這種病毒與兩種蝙蝠來源的SARS-CoV（嚴重急性呼吸道綜合徵冠狀病毒）樣冠狀病毒存在最為密切的親緣關係。
相關研究結果於2020年1月30日在線發表在Lancet期刊上，論文標題為“Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding”。論文通訊作者為中國的武桂珍（Guizhen Wu）教授、Weijun Chen教授、Weifeng Shi教授和Wenjie Tan教授。
圖片來自Lancet, 2020, doi:10.1016/S0140-6736(20)30251-8
這些研究人員說，儘管他們的分析提示著蝙蝠可能是這種病毒的原始宿主，但是在武漢華南海鮮市場出售的一種野生動物可能是讓這種病毒能夠出現在人體中的中間宿主。因此，對這種病毒的未來進化、適應和傳播應當開展緊急調查。在這項研究中，這些研究人員報道了9名被確診為原因不明的病毒性肺炎的患者的流行病學數據。從這些患者肺部採集的細胞和分泌物樣本以收集2019-nCoV病毒樣本，然後對這些病毒樣本進行分析以確定這種病毒的起源以及它如何進入人細胞。在這9名患者中，8人去過華南海鮮市場。剩下的一名患者從未去過這家市場，但是在病發之前住在這家市場附近的一家旅館裡。這些研究人員在從這些患者身上採集的全部10個遺傳序列--包括8個完整的基因組和2個部分基因組---中發現了2019-nCoV。這些遺傳序列幾乎相同（它們的基因組序列具有99.98％以上的相似性），這表明這種病毒是最近出現在人體內的。Shi教授說，“令人吃驚的是，文中描述的來自不同患者的2019-nCoV序列幾乎相同。這一發現表明2019-nCoV在很短的時間內起源於一個來源，並且被相對快速地檢測到。但是，隨著這種病毒傳播給更多人，不斷監測突變的出現是必要的。”通過將2019-nCoV基因組序列與病毒文庫進行比較，這些研究人員發現與這種病毒親緣關係最為密切的病毒是兩種蝙蝠來源的SARS-CoV樣冠狀病毒：bat-SL-CoVZC45和bat-SL-CoVZXC21，
它們具有88%的基因組序列相似性。 2019-nCoV與人類SARS-CoV（具有大約79％的基因組序列相似性）和中東呼吸綜合徵（MERS）冠狀病毒（MERS-CoV）（具有大約50％的基因組序列相似性）具有相對較遠的親緣關係。通過研究這種病毒的刺突蛋白（它如何結合並進入人細胞），這些研究人員發現2019-nCoV和人SARS-CoV具有相似的結構，不過也存在一些細微差異。為此，他們提出2019-nCoV可能使用與SARS（稱為ACE2的受體）相同的分子入口---人細胞表面上的ACE2受體---進入人細胞，但請注意，這將需要確認。根據這些數據，這些研究人員說，這似乎表明導致這次武漢疫情爆發的2019-nCoV也可能最初是由蝙蝠攜帶，並通過在華南海鮮市場出售的一種目前未知的野生動物傳播給人類。他們說，蝙蝠冠狀病毒發生突變的可能性要高於2019-nCoV，這意味著2019-nCoV不太可能是由於偶然突變而出現。但是，還需要更多的信息來確認這一點，而且如果發現了親緣關係更為密切的動物病毒，那麼這一建議可能是錯誤的。中國疾病預防控制中心的武桂珍教授說，“這些數據總體上與蝙蝠的冠狀病毒庫一致，特別是與2019-nCoV一致。然而，儘管蝙蝠很重要，但這似乎表明其他的動物宿主充當蝙蝠與人類之間的中間宿主。”她解釋說，“首先，這次疫情爆發是在2019年12月下旬首次報道的，當時武漢的大多數蝙蝠種類正在冬眠。其次，在華南海鮮市場上沒有出售或發現蝙蝠，然而許多非水生動物（包括哺乳動物）在那裡出售或發現。第三，2019-nCoV和它的近親bat-SL-CoVZC45和bat-SL-CoVZXC21的遺傳序列相似性不到90％，這意味著這兩種蝙蝠來源的冠狀病毒並不是2019-nCoV的直接祖先。第四，在SARS-CoV和MERS-CoV中，蝙蝠都是天然的冠狀病毒庫，另一種動物是中間宿主，人類是終末宿主，這再次凸顯了野生動物中隱藏的病毒庫以及它們傳播到人群中的潛力。”
1.Roujian Lu et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet, 2020, doi:10.1016/S0140-6736(20)30251-8.
2.2019 novel coronavirus is genetically different to SARS and should be considered a new human-infecting coronavirushttps://medicalxpress.com/news/2020-01-coronavirus-genetically-sars-human-infecting.html
作 者 / towersimper 來 源 / 生物谷
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