兖州站,中国铁路济南局集团有限公司管辖的一等站,建于1911年,站台规模5台10线,是鲁西南地区最大的综合铁路交通枢纽
济宁火车站,中国铁路济南局集团有限公司兖州车务段管辖的二等站,始建于1912年,任城区唯一的一座火车站
邹城站,京沪铁路上的二等站,始建于1911年
曲阜火车站,兖石铁路上的三等站,建于1981年
嘉祥站,隶属于聊城车务段管辖,三等站,建于1978年
梁山站,三等站,又名梁山西站,当地俗称杨营火车站,建于1996年
泗水站,临沂车务段管辖,现为三等站,建于1984年
韩庄站,微山县境内唯一一座火车站,四等站,建于1910年,不再办理客运业务。济宁剩余金乡、鱼台、汶上等县暂无火车站。