有人的地方就有江湖，有组织的地方也就有派系斗争，都是奴隶战士出身，为了权力和财富，马穆鲁克们也根据出身的不同结成不同的派系。
奴隶战士在中东、中亚盛行，最根本的原因是这些国家都是部族社会，人们对部族的忠心远远高于君主。因此苏丹和埃米尔们才从远方购买强壮的奴隶，奴隶战士们就成了他们最可靠的武装力量。“马穆鲁克”的原意是“可以拥有的人”，他们在苏丹心中并不是简单的奴隶和打手，其中“持剑的人”就是我们最常说的马穆鲁克战士，“持笔的人”要给苏丹充当最核心的行政官员。黑人公公马穆鲁克要给苏丹的妃子们站岗放哨、教育下一代的马穆鲁克战士（这才是太监战士）。马穆鲁克从12世纪起就垄断了埃及军政主要职位，是左右政局的主要力量。
早在法蒂玛王朝（就是被萨拉丁消灭的苦主）时代，奴隶战士就有了拉帮结派内斗的黑历史，柏柏尔奴隶战士、突厥人奴隶战士、苏丹黑人奴隶战士的大乱斗甚至把埃及分成几块。苏丹黑人奴隶战士占据了上埃及大部分地区，柏柏尔奴隶战士占据了尼罗河三角洲，而突厥人奴隶战士则占据了开罗，突厥奴隶战士逼迫苏丹卖掉自己的珠宝当奖金。
法蒂玛王朝的苏丹不得不请阿克里总督巴德尔充当维齐尔（宰相），巴德尔最大依靠就是自己的亚美尼亚奴隶战士。他摆平了苏丹手下的三大奴隶战士帮派，也把埃及当成了自家产业。萨拉丁建立自己的王朝后，把手下的“库尔德古拉姆”与“突厥古拉姆”变成了我们熟知的马穆鲁克，但他们也没有成为萨拉丁希望的理想战士。
萨拉丁最大的缺点就是太大方，他不光自己是月光族，还把众多的封地赏赐给自己的亲戚，让阿尤布王朝的苏丹在集权上非常困难，只能越来越依靠马穆鲁克。1249年马穆鲁克大首领法克尔.埃尔丁接盘了主人的妻子沙加尔杜尔，但他在战斗中被十字军杀死。由于沙加尔杜尔是突厥人，她就找上了突厥马穆鲁克的首领阿伊贝格，双方在肉体和权力上都进行了亲密无间的合作。突厥马穆鲁克又被称为湖水马穆鲁克（因为训练中心在开罗湖心小岛罗达而得名），他们的地位岌岌可危，因为新苏丹图兰.沙有自己的马穆鲁克。
湖水马穆鲁克干掉了图兰.沙，把自己的长官阿伊贝格送上了王座。阿伊贝格死后，实权被湖水马穆鲁克的库图兹掌握。库图兹在袍泽们，尤其是在湖水马穆鲁克另一大巨头拜巴尔的帮助下打赢了蒙古人。由于分赃不均，库图兹被湖水马穆鲁克抛弃，在一场围猎中被杀，拜巴尔坐上了苏丹宝座。拜巴尔希望自己的后代江山永固，这一梦想被湖水马穆鲁克的新首领卡拉乌恩粉碎。
卡拉乌恩也想自己的后代坐稳江山，对此他引进了切尔克斯马穆鲁克，这就是马穆鲁克中另一大派别“城堡马穆鲁克”。湖水马穆鲁克直接杀死了他的后代，但这阻止不了“城堡马穆鲁克”的崛起。此后两大派别互相争斗，一个个苏丹都成了牺牲品。
1517年以后埃及被奥斯曼统治，由于奥斯曼只在埃及保留了一万人的军队，这只军队还分成了七大部分，因此马穆鲁克们迅速恢复了实权。他们分成几十个贝伊家族继续权力的游戏，直到拿破仑和阿里到来。
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