大家好，這裡是小蒙說電影，接續上部分馬赫坡頭目莫帶領300多族人那清算日本人後，使日人遭遇殖民佔領以來最大的統治危機，日本駐臺少將彌彥率軍警帶著機槍炮彈去征討莫那。
道澤部落的人跑回去告訴鐵木頭目，莫那已經打響了反抗戰，作為同一部族的人，也應該加入到戰鬥中，原本對賽德克人很親善的小島知道自己妻兒也死在了反抗站中，他激動的以道澤部落和馬赫坡有世仇為由，讓鐵木出兵，協助日本人打敗莫那他們。
莫那放棄了原本已經打下的領地，帶著族人和家人回到以前的部落，藏進了山裡，雖然日軍的武器先進，但是在山裡他們還是舉步難行，為了攻下莫那他們，日軍發動了更猛的攻勢，莫那讓婦女們帶著孩子往更深的大山裡去，因為糧食有限，為了不成為男人們和孩子的負擔，逃進山的賽德克婦女殺死了幼童，集體上吊自縊。
世代山居的賽德克人能在滑壁上健步如飛，導致增援的日軍久攻不下，這讓彌彥很惱火，於是他申請向莫那所在地區投放還在試驗的生化炸彈，這讓賽德克人死傷慘重。
另一邊鐵木帶著人去山裡打莫那，卻碰到了自縊的婦女們，這雖然令他良心稍微受到一點觸動，但是第二天還是領著人繼續尋找莫那的蹤跡。他們沿著被搶食物的血跡找到一處生煙的茅屋，以為找到了莫那他們，舉槍進去卻是陷阱。道澤部落的人損傷嚴重，剩餘的人趕緊跑，逃至半路鐵木看著莫那的兒子追了過來，就好像看到了莫那，這讓他決定不再逃，像一個堂堂正正的賽德克人那樣，拿下敵人人頭回祖靈之家，最後他死在了莫那兒子槍下。
而這時莫那埋伏在深山密林中，等待著巴萬將日軍引過來，防不勝防的日軍被莫那帶領的族人殺盡，而日本援軍這時也趕到，他們在密林外就是一頓炮轟，看著燃燒的森林，日本人以為莫那他們逃了，停止了攻擊，結果莫那帶著族人衝出火海，將日軍打得四處逃竄。
日軍與賽德克的戰爭中，連連受挫，但是莫那帶領的人也所剩無幾，之後日軍將寫滿招降的紙片，撒向了大山，讓每個賽德克人都看到，紙上寫道：如果願意投降，就到收容所。莫那看著漫天飛舞的紅色紙片，跳起了部族的戰舞，將紅領巾傳給兒子，並說要戰要降要自盡，全憑個人意志，而他自己要離開他們了，他不願看到日本人當他的面戲弄族人。
莫那兒子人喝著日軍的酒，叮囑妻子以後好好生活，然後帶著僅剩的幾個賽德克勇士踏上了他們迴歸祖靈的彩虹橋。
原本發誓要一天拿下戰鬥的彌彥，至此也佩服莫那的意志，感嘆：“三百名戰士抵抗數千名大軍，不戰死便自盡……為何我會在這遙遠的臺灣山區，見到我們已經消失百年的武士精神？……是這裡的櫻花開得太紅豔了嗎？”
此次事件過後，小島煽動道澤部落為鐵木報仇，趁夜殺了收容所裡的老弱遺族，而最後剩餘不多的遺族，被送到方便監視的地方生活。
電影到這裡就結束了，故事卻在延續，這是整部電影的下半部分《賽德克巴萊：彩虹橋》，喜歡的小夥伴可以關注、評論喲
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