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民辦大學的學費之所以比公立大學的學費比較貴，主要是因為民辦大學的辦學費用主要是依靠學校自己籌措，而公立院校的學費可以享受到財政補貼。
不過最近隨著物價水平的大幅度攀升，不少高校都開始提高自己的收費標準。
有不少三本院校的學費，不僅僅是比公立院校的學費貴一倍以上，有的甚至達到了三倍以上。
從2015年開始不少省份發文，民辦院校可以根據自己的辦學成本和專業情況來調整學費，民辦高校出現了學費漲價潮。學費調整以後，民辦院校的平均學費是在每年1.5萬元左右，而一些藝術類的專業平均學費是在2萬元左右。
雖然三本院校的學費不斷的上漲，但是還是有不少學生願意選擇三本院校。根據保守的統計獨立院校和民辦院校在內的三本院校，每年將吸納近百萬的考生。
在2014年的時候，就有部分學者提議取消本科三批次，將本科生批次納入到職業教育，用於解決大學生就業難和藍領工人缺乏的問題。
不過這樣的建議沒有被採納。
大部分考生和家長之所以願意花，很高的費用去讀民辦院校，而不是去讀專科院校，主要是社會的主流觀念有很大的關係。
雖然，專科教育和本科教育都屬於高等教育，但是在不少人看來專科就不算是嚴格意義上的大學，更多的是一種職業培訓。同時專科畢業意味著較低的薪酬待遇，較低的社會地位。
大部分人都有專科存在的偏見，並不是毫無根據。本科生和專科生在就業和升學上確實存在著較大的差異。
大部分企業在招聘非銷售類的崗位，對於學歷的要求普遍是本科以上學歷。就連在公務員招聘考試的時候，大部分的崗位也都要求是本科以上學歷。
除了薪酬待遇比較好的用人單位在招聘的時候，會要求985或者211院校之外，大部分用人單位其實不會對於本科做出具體的區分，並不具體要求是一本、二本還是三本。
在升學上同樣也是如此。對於專科生來說，要想提升自己的學歷，可以通過專升本。
專升本途徑有統考、自考、網絡教育和成人高考。在所有的途徑之中，統考獲得的畢業證書含金量是最高的。而統考在報名條件、錄取比率、報考專業等方面都是有諸多的限制。
專升本能報考的學校普遍是本科二批次的院校，並且通過專升本之後，最少需要兩年的時間，才能夠順利的拿到本科的畢業證書和學位證書。
所以，不論是在升學還是就業上，其實本科和專科還是存在著很大的差異。
另外大部分家長之所以願意選擇，本科分批次的院校，和目前的高等教育改革也有很大的關係。
在很長一段時間內，民辦院校成為花錢買學歷的代名詞。
根據網上查找的數據，這些數據可能有些不準確，在2010年之前，三本院校的錄取率幾乎是達到了90%以上，2010年三本錄取率有所下降，到2012年的時候三本院校的錄取率，才降到了50%左右。
隨著民辦教育相關管理規定的出臺，大部分的民辦教育在招生、教學以及管理上，都逐步趨於完善。
特別是新一輪的高考改革中，大部分省份的本科批次和三批次進行了合併，三本中的民辦高校也有了和公立院校公平競爭的機會。
現在的絕大多數民辦院校的招生已經規範，早已不是有錢就能入學就讀的年代了，在大部分省份本科批次的分數線比專科批次高很多。比如，河南省2018年高考理科的本科二批（其實就是過去的本科三批分數線）理科的分數線是436分，而專科的分數線只有200分。
有不少民辦高校在綜合實力和發展潛力上，遠遠超過了部分二本院校，有的三民辦高校已經有獨立的碩士點。
