蔑視屠臣悔你孟
準確來說是長門想要殺自來也，佩恩六道也只是在長門的操控下做出的命令，長門和自來也對和平的理念和實現方式不同，早晚是會爆發戰鬥的。
在《火影忍者》故事中，自來也因為調查需要潛入雨忍村，意外發現雨忍村實際的掌控者是擁有輪迴眼的佩恩，一度以為是自己的曾經的弟子，但經過交談後兩者的對立態度就出來了，自來也是主張交流的方式來實現和平，這個是大部分人都會贊同的做法，但長門的做法是希望通過消滅一部分人讓其他人對戰爭產生恐懼，也讓其中一方沒有參與戰爭的能力，不再參與戰爭。
兩者的最終目的都是為了和平，但立場和實現方式不同，矛盾爆發是肯定的，趁現在自來也還是孤立無援的狀況可以直接殺死，避免後期帶來更大的麻煩，道不同不相為謀，自來也肯定是明白的，既然勸說不行，那麼就只能靠拳頭了。
長門在這次的戰鬥中表現出非常明確的立場和堅定的意志，只要不贊同他實習和平的方式就必須要消滅，只是讓人有些意外的是，明明是自己熟悉的那個老師，也能狠下心殺死，為何到了木葉村後，意志就不堅定了。鳴人僅僅是嘴遁了幾句，意志就鬆懈，之前的堅持又為了什麼，這一點很多人都有疑問，但這樣的劇情發展對觀眾來說毫不意外，對鳴人而言，打不贏的就靠嘴遁，比什麼招式都要強。
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首先要說一下，長門的曉組織和自來也，乃至整個木葉的思想是不一樣的，前期的長門作為僱傭兵組織，挑起戰爭，企圖打破大國忍者體系。
後期就直接利用尾獸作為兵器征服世界，這跟木葉一貫的和平作風相駁，站在敵對面只能是你死我活，另外從側面上來說，長門把兒時認可他的恩師殺死，也是證明了他要構建新世界的決心！從此，他再無迴轉的餘地！
而長門之所以會這樣，是有原因的：
長門、彌彥、小南是孤兒，在村子裡光是為了生存就已經很艱辛，但是彌彥希望通過變強，去改變所有人的現狀，後來三人在一場意外中被自來也相救，也因此成為了3人的師傅，延緩了回木葉的計劃，自來也知道了長門六道之眼時，也曾經告訴長門，他應該就是傳說中的“預言之子”，對他寄予希望（後來大蛤蟆仙人透露預言之子是鳴人）
自來也走後，彌彥帶著長門、小南在村子裡立足成立了曉組織，後來彌彥為了保護夥伴被殺害，長門才建立了新的世界觀、價值觀，認為只有以力量毀滅現有的一切，重新構建新規則，這個糜爛不堪的世界才有救，才有了佩恩六道，因為行動不便，而用6個人的屍體製造出來的，主體是長門的摯友彌彥，但是所有的能力都來自長門，屍體本身是沒有自己的思想的。 
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自來也去的目的就是為了查明佩恩的身份，然而自來也見到佩恩以後發現都是認識的，還有一個是自己的愛徒，這讓他更肯定要查清楚佩恩的身份，他知道如果不查明那最終倒黴的是木葉，佩恩的強大，一個木葉根本擋不住的。佩恩殺自來也主要是為了不讓秘密洩露，見過佩恩的都要死，自己師父也沒辦法。還有個問題就是憑自來也的本事，他想跑的話再加一倍的佩恩也攔不住。只可惜自來也在搞清楚佩恩的秘密時已經來不及跑了。一，長門因為彌彥的死，性情大變，以清洗世界，讓人們記住傷痛來維持和平為理念。然而，自來也是他執行這理念的最大敵人！如果不是自來也不知道佩恩的秘密，佩恩沒那麼容易打敗自來也，所以他趁此機會，絕不放過自來也。二，自來也探得了他的秘密！就是他面前6個都是屍體，本體長門在不遠處控制屍體，所以長門非殺他不可！不然秘密敗露，一旦被大範圍搜索找到本體，以小南之能，是守不住他那傷殘的本體的。
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雖然這麼說有點不好，但是在我看來，佩恩殺死自來也的確是他應該做的明智選擇，對於拋棄了所有感情，一切為了最終“和平”到來而努力的長門而言，所有擋在他面前可能妨礙他的人都是必須抹殺的，而師從自來也的他，更是明白自己的師父一定會阻止自己，所以先下手為強，將自來也殺死勢在必行。
首先說自來也潛入雨隱村的目的，就是為了獲取儘可能多的情報，揭開佩恩的真面目，而且帶著這個目的和佩恩交戰的他，確實獲取了對方的許多情報：佩恩輪迴眼互通視野的秘密，每個佩恩只能使用單一能力的忍術，以及在他臨死之前悟到的，佩恩真身的秘密。這些情報都是對佩恩十分不利的，如果被自來也送回木葉可能導致的就是他被針對佈置戰術，這當然是佩恩不願看到的，所以只能殺了自來也滅口。
其次，在佩恩扭曲的“和平”觀裡，要建立真正的和平，就要讓大國的忍者們也感受到傷痛，並臣服於自己。也就是說每個和自己作對的人都是必須抹殺的，作為三忍之一的自來也無疑是佩恩眼中的勁敵，能夠在無其他人干擾的情況下和自來也單打獨鬥的機會，他當然不會放過，力圖一役殺死自來也。
說到底，在當時的佩恩眼裡，已經沒有師徒的觀念，只有敵人和臣服的人，對於他無法說服的自來也，也只有除掉，才能保證他的計劃順利實現，這份信念也不可謂不強，只是用錯了地方。
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起初，長門心中一直嚮往著自來也所說的“和平”，然而就是因為這個理想中的“和平”才導致自己失去摯友，當長門對這個世界感到失望甚至絕望的時候，他決定與帶土聯手改變這個醜惡的忍者世界，而就在這個計劃的實施階段，自來也找到了他們（指：佩恩六道）並試圖調查真相，為了讓自己和帶土的計劃可以順利完成，他當然只能選擇親手殺死恩師避免情報洩露。
一開始自來也來到雨隱村並見到佩恩六道時，自來也其實就已經認出在場的所有六道成員都是自己曾經殺死的人，而帶頭的還是自己的徒弟。
在經過幾回合的較量之後，自來也大致瞭解了佩恩六道的基本情況，本想在放倒三個佩恩的時候帶回木葉深入研究，但是想要尋找真相的想法卻驅使自來也走上了一條不歸路，本應該在結界中隱藏的自來也選擇了走出結界，而這也正給了長門一個機會，復活（指：回覆行動能力）了被放倒的佩恩的那一刻，長門便已經下定決心要至自來也於死地，不然一切的計劃將化為泡影，因此佩恩六道開始對自來也展開全力攻擊。
如果那次對戰中長門沒有利用“黑棒”的效果壓制自來也的查克拉，也許佩恩六道會逐一被自來也再次抹殺，而自己也將被自來也發現。
但是，這一切假想的事情都沒有發生，或者說我們所希望的事情沒有發生，當五根黑棒全部貫穿自來也身體的時候，就說明這場對戰的結果已經塵埃落定，無論他是赫赫有名的三忍之一，還是曾培養數名才能出眾的忍者的良師，一切的榮譽與恩情都在他沉入湖底的那一刻成為了人們腦海中的一段記憶。
總而言之，一位試圖通過自己的力量改變世界為世界帶來光明和希望的人，在經歷過黑暗之後自己內心中的希望就會被黑暗淹沒而變得扭曲，當自己貫徹的想法全部被現實顛覆以後，那麼整個人都將變得極端，也正是這種極端的想法才導致長門親手殺死恩師。
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主要原因就是雙方處於敵對陣營，六道佩恩為了貫徹自己的理想，自然是要殺了企圖阻止他的自來也的。
自來也潛入雨忍村是為了獲取情報，而雨忍村被佩恩的忍術控制了，自來也也被發現了。所以與佩恩交戰。由於自來也情報不足，不瞭解佩恩屬性，所以死於佩恩之手。但其實自來也逃走還是可以的，但他選擇用生命換取情報。
在當時，佩恩是個很大的威脅。佩恩殺死自來也也是不可避免的。在那種情況下，不是佩恩死就是自來也亡。即使兩人都希望世界和平，但佩恩很偏激，他是想毀滅世界達到和平的。自來也顯然不是這樣子。
自來也是長門的師父，佩恩實際上是屍體，是長門在控制。雖然兩人有師徒之誼，但木葉於長門亦有殺親之仇。長門是不幸的，他感激自來也，但內心或許也是怨恨自來也的。如果當初自來也帶長門小南他們一起離開，結局會不會不一樣？
複雜的感情，理想的對立，對世界的絕望，等等，都是佩恩殺自來也的原因。
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一樂醬
佩恩殺自來也是很正常的事情，如果佩恩不殺自來也，自來也就會殺他，雖然說佩恩其實都是傀儡，難保自來也跟佩恩的交手中不會看出點什麼，而且事情上自來也已經看出佩恩都不是本體，如果讓自來也把這個情報帶出去，長門就危險了。
所以自來也非死不可，如果自來也打敗了佩恩，那麼下一步是什麼？肯定是要把長門找出來，再把長門給殺了，忍者的世界就是這樣不是你死就是我亡，忍者之間爭鬥不斷，死亡到處都是，自來也不過是期中的一個犧牲品。
當時那種情況，任何一個人都會殺自來也，只要他有那個能力，就不可能放自來也走，而且自來也跟佩恩打的時候也沒含糊，自來也有那個能力的話也會殺佩恩。所以佩恩殺了自來也不能說他錯了，真正錯的是這個忍者的世界。
雨淋動漫
自來也是理想主義者，他發現自己的學生道路走彎了以後，想掰回來，他想告訴長門，世界還是很美好的，老師就沒有放棄你們，一直都沒有放棄你們，這是自來也一個人接觸佩恩最直接的原因，這也是佩恩要殺自來也最根本的原因，自來也的老師的品性、長門建立新世界的理想，讓兩個主體產生矛盾，導致一方面死亡。
馬上就到教師節了，自來也是一位偉大的老師，在臨近教師節的日子裡回想起二次元培育人才數一數二的大人物，讓自來也活了過來，自來也好色的背後隱藏著很都悲傷，有機會講給大家聽，自來也老師，教師節快樂!動漫迷們，記得關注下哦。
白草元
我想說，自來也是佩恩，小南，長門的師傅，從小教過他們一些忍術，還跟他們生活過。那為什麼六道佩恩會殺害自來也，我有以下想法。
首先，長門等人作為自來也小說第二部的主人公，自來也以他們的故事為題材，在他們相處時，長門的話給了自來也很大感悟，認為這個世界會有大變革，而這個變革由他的弟子發起，最終會使得忍界走向和平。
其次，在他們分開之後，長門等人一直為這個信念而奮鬥，加入雨忍村，與不同的敵人抗戰。但是，他們遇到了山椒魚半藏，這個實力接近半神的首領言而無信，最後害死了彌彥。
最後，長門等人在痛苦中認為，這個世界唯有經歷過痛楚才能進行變革，因此，他們認為自來也得話是錯誤的，他的信念是不行的。這個世界唯有讓別人感受到痛楚才能走向和平。而這個時候，他們遇到了帶土，於是他們合作，收集尾獸，最後對忍界進行改革。所以，在最後遇到自來也時，六道佩恩與自來也大戰，最終自來也去世。
綜上所述是我個人的想法，不知道你有什麼想法，歡迎在評論下方留言。
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小哥愛動漫
自來也為獲曉的真正目的,孤身一人潛入隱雨村.獲知隱雨村的掌權人是被稱為神的佩恩,其一定和曉有莫大關係.自來也見到佩恩時發現他和自己的一個徒弟一樣擁有輪迴眼,就以為佩恩就是長門,佩恩就是那個能改變世界(造福或毀滅)的預言之子.
六道佩恩,六個身體,各個有輪迴眼.自來也剛和佩恩打時只出現3個佩恩,自來也用仙人狀態以幻術殺死了這3個,不料另3個將死的3個又復活了,並將自來也打成重傷.
自來也這才發現6個佩恩裡沒一個是長門,都是自己曾經殺死的人.
自來也將其中一人引入結界內殺死,讓蛤蟆帶回木葉.他為求佩恩真身,冒險出結界,在知道佩恩真正秘密的同時被殺.
自來也在臨死前將佩恩秘密以密碼形式寫在了蛤蟆身上,讓蛤蟆帶回木葉.自己長眠於隱雨村的湖底.
至於佩恩也就是長門為什麼要殺曾經為恩師的自來也，這個跟兒時好友彌彥的死有莫大的關係，因為自己的當初的信念和和平的意義被扭曲了！當看到團藏和半藏殺死彌彥的時候就徹底被扭曲了！
長門彌彥小蘭，3個人組織曉的時候，為的就是繼承自來也的教誨為和平而存在。但是卻被忍者世界一次又一次的作為傭兵利用，慢慢的曉的組織壯大，便被其他人起了顧忌，對這樣不穩定力量的存在感到威脅，便在一次委託任務裡幾個忍者村的人把曉襲擊了，彌彥就是在救長門的時候擋下了團藏的攻擊死的，當時長門就徹底對這個老師所希冀的和平世界絕望了，召出外道， 集聚著對世界的不信任，對曾今和平的理解產生了扭曲的甚至是痛恨的心態。
他殺自來也完全是為了否定自來也的‘和平’，他要靠自己創造他想要的和平，所以他殺了自來也。
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