蔑视屠臣悔你孟
准确来说是长门想要杀自来也，佩恩六道也只是在长门的操控下做出的命令，长门和自来也对和平的理念和实现方式不同，早晚是会爆发战斗的。
在《火影忍者》故事中，自来也因为调查需要潜入雨忍村，意外发现雨忍村实际的掌控者是拥有轮回眼的佩恩，一度以为是自己的曾经的弟子，但经过交谈后两者的对立态度就出来了，自来也是主张交流的方式来实现和平，这个是大部分人都会赞同的做法，但长门的做法是希望通过消灭一部分人让其他人对战争产生恐惧，也让其中一方没有参与战争的能力，不再参与战争。
两者的最终目的都是为了和平，但立场和实现方式不同，矛盾爆发是肯定的，趁现在自来也还是孤立无援的状况可以直接杀死，避免后期带来更大的麻烦，道不同不相为谋，自来也肯定是明白的，既然劝说不行，那么就只能靠拳头了。
长门在这次的战斗中表现出非常明确的立场和坚定的意志，只要不赞同他实习和平的方式就必须要消灭，只是让人有些意外的是，明明是自己熟悉的那个老师，也能狠下心杀死，为何到了木叶村后，意志就不坚定了。鸣人仅仅是嘴遁了几句，意志就松懈，之前的坚持又为了什么，这一点很多人都有疑问，但这样的剧情发展对观众来说毫不意外，对鸣人而言，打不赢的就靠嘴遁，比什么招式都要强。
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首先要说一下，长门的晓组织和自来也，乃至整个木叶的思想是不一样的，前期的长门作为雇佣兵组织，挑起战争，企图打破大国忍者体系。
后期就直接利用尾兽作为兵器征服世界，这跟木叶一贯的和平作风相驳，站在敌对面只能是你死我活，另外从侧面上来说，长门把儿时认可他的恩师杀死，也是证明了他要构建新世界的决心！从此，他再无回转的余地！
而长门之所以会这样，是有原因的：
长门、弥彦、小南是孤儿，在村子里光是为了生存就已经很艰辛，但是弥彦希望通过变强，去改变所有人的现状，后来三人在一场意外中被自来也相救，也因此成为了3人的师傅，延缓了回木叶的计划，自来也知道了长门六道之眼时，也曾经告诉长门，他应该就是传说中的“预言之子”，对他寄予希望（后来大蛤蟆仙人透露预言之子是鸣人）
自来也走后，弥彦带着长门、小南在村子里立足成立了晓组织，后来弥彦为了保护伙伴被杀害，长门才建立了新的世界观、价值观，认为只有以力量毁灭现有的一切，重新构建新规则，这个糜烂不堪的世界才有救，才有了佩恩六道，因为行动不便，而用6个人的尸体制造出来的，主体是长门的挚友弥彦，但是所有的能力都来自长门，尸体本身是没有自己的思想的。 
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自来也去的目的就是为了查明佩恩的身份，然而自来也见到佩恩以后发现都是认识的，还有一个是自己的爱徒，这让他更肯定要查清楚佩恩的身份，他知道如果不查明那最终倒霉的是木叶，佩恩的强大，一个木叶根本挡不住的。佩恩杀自来也主要是为了不让秘密泄露，见过佩恩的都要死，自己师父也没办法。还有个问题就是凭自来也的本事，他想跑的话再加一倍的佩恩也拦不住。只可惜自来也在搞清楚佩恩的秘密时已经来不及跑了。一，长门因为弥彦的死，性情大变，以清洗世界，让人们记住伤痛来维持和平为理念。然而，自来也是他执行这理念的最大敌人！如果不是自来也不知道佩恩的秘密，佩恩没那么容易打败自来也，所以他趁此机会，绝不放过自来也。二，自来也探得了他的秘密！就是他面前6个都是尸体，本体长门在不远处控制尸体，所以长门非杀他不可！不然秘密败露，一旦被大范围搜索找到本体，以小南之能，是守不住他那伤残的本体的。
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虽然这么说有点不好，但是在我看来，佩恩杀死自来也的确是他应该做的明智选择，对于抛弃了所有感情，一切为了最终“和平”到来而努力的长门而言，所有挡在他面前可能妨碍他的人都是必须抹杀的，而师从自来也的他，更是明白自己的师父一定会阻止自己，所以先下手为强，将自来也杀死势在必行。
首先说自来也潜入雨隐村的目的，就是为了获取尽可能多的情报，揭开佩恩的真面目，而且带着这个目的和佩恩交战的他，确实获取了对方的许多情报：佩恩轮回眼互通视野的秘密，每个佩恩只能使用单一能力的忍术，以及在他临死之前悟到的，佩恩真身的秘密。这些情报都是对佩恩十分不利的，如果被自来也送回木叶可能导致的就是他被针对布置战术，这当然是佩恩不愿看到的，所以只能杀了自来也灭口。
其次，在佩恩扭曲的“和平”观里，要建立真正的和平，就要让大国的忍者们也感受到伤痛，并臣服于自己。也就是说每个和自己作对的人都是必须抹杀的，作为三忍之一的自来也无疑是佩恩眼中的劲敌，能够在无其他人干扰的情况下和自来也单打独斗的机会，他当然不会放过，力图一役杀死自来也。
说到底，在当时的佩恩眼里，已经没有师徒的观念，只有敌人和臣服的人，对于他无法说服的自来也，也只有除掉，才能保证他的计划顺利实现，这份信念也不可谓不强，只是用错了地方。
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起初，长门心中一直向往着自来也所说的“和平”，然而就是因为这个理想中的“和平”才导致自己失去挚友，当长门对这个世界感到失望甚至绝望的时候，他决定与带土联手改变这个丑恶的忍者世界，而就在这个计划的实施阶段，自来也找到了他们（指：佩恩六道）并试图调查真相，为了让自己和带土的计划可以顺利完成，他当然只能选择亲手杀死恩师避免情报泄露。
一开始自来也来到雨隐村并见到佩恩六道时，自来也其实就已经认出在场的所有六道成员都是自己曾经杀死的人，而带头的还是自己的徒弟。
在经过几回合的较量之后，自来也大致了解了佩恩六道的基本情况，本想在放倒三个佩恩的时候带回木叶深入研究，但是想要寻找真相的想法却驱使自来也走上了一条不归路，本应该在结界中隐藏的自来也选择了走出结界，而这也正给了长门一个机会，复活（指：回复行动能力）了被放倒的佩恩的那一刻，长门便已经下定决心要至自来也于死地，不然一切的计划将化为泡影，因此佩恩六道开始对自来也展开全力攻击。
如果那次对战中长门没有利用“黑棒”的效果压制自来也的查克拉，也许佩恩六道会逐一被自来也再次抹杀，而自己也将被自来也发现。
但是，这一切假想的事情都没有发生，或者说我们所希望的事情没有发生，当五根黑棒全部贯穿自来也身体的时候，就说明这场对战的结果已经尘埃落定，无论他是赫赫有名的三忍之一，还是曾培养数名才能出众的忍者的良师，一切的荣誉与恩情都在他沉入湖底的那一刻成为了人们脑海中的一段记忆。
总而言之，一位试图通过自己的力量改变世界为世界带来光明和希望的人，在经历过黑暗之后自己内心中的希望就会被黑暗淹没而变得扭曲，当自己贯彻的想法全部被现实颠覆以后，那么整个人都将变得极端，也正是这种极端的想法才导致长门亲手杀死恩师。
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主要原因就是双方处于敌对阵营，六道佩恩为了贯彻自己的理想，自然是要杀了企图阻止他的自来也的。
自来也潜入雨忍村是为了获取情报，而雨忍村被佩恩的忍术控制了，自来也也被发现了。所以与佩恩交战。由于自来也情报不足，不了解佩恩属性，所以死于佩恩之手。但其实自来也逃走还是可以的，但他选择用生命换取情报。
在当时，佩恩是个很大的威胁。佩恩杀死自来也也是不可避免的。在那种情况下，不是佩恩死就是自来也亡。即使两人都希望世界和平，但佩恩很偏激，他是想毁灭世界达到和平的。自来也显然不是这样子。
自来也是长门的师父，佩恩实际上是尸体，是长门在控制。虽然两人有师徒之谊，但木叶于长门亦有杀亲之仇。长门是不幸的，他感激自来也，但内心或许也是怨恨自来也的。如果当初自来也带长门小南他们一起离开，结局会不会不一样？
复杂的感情，理想的对立，对世界的绝望，等等，都是佩恩杀自来也的原因。
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一乐酱
佩恩杀自来也是很正常的事情，如果佩恩不杀自来也，自来也就会杀他，虽然说佩恩其实都是傀儡，难保自来也跟佩恩的交手中不会看出点什么，而且事情上自来也已经看出佩恩都不是本体，如果让自来也把这个情报带出去，长门就危险了。
所以自来也非死不可，如果自来也打败了佩恩，那么下一步是什么？肯定是要把长门找出来，再把长门给杀了，忍者的世界就是这样不是你死就是我亡，忍者之间争斗不断，死亡到处都是，自来也不过是期中的一个牺牲品。
当时那种情况，任何一个人都会杀自来也，只要他有那个能力，就不可能放自来也走，而且自来也跟佩恩打的时候也没含糊，自来也有那个能力的话也会杀佩恩。所以佩恩杀了自来也不能说他错了，真正错的是这个忍者的世界。
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自来也是理想主义者，他发现自己的学生道路走弯了以后，想掰回来，他想告诉长门，世界还是很美好的，老师就没有放弃你们，一直都没有放弃你们，这是自来也一个人接触佩恩最直接的原因，这也是佩恩要杀自来也最根本的原因，自来也的老师的品性、长门建立新世界的理想，让两个主体产生矛盾，导致一方面死亡。
马上就到教师节了，自来也是一位伟大的老师，在临近教师节的日子里回想起二次元培育人才数一数二的大人物，让自来也活了过来，自来也好色的背后隐藏着很都悲伤，有机会讲给大家听，自来也老师，教师节快乐!动漫迷们，记得关注下哦。
白草元
我想说，自来也是佩恩，小南，长门的师傅，从小教过他们一些忍术，还跟他们生活过。那为什么六道佩恩会杀害自来也，我有以下想法。
首先，长门等人作为自来也小说第二部的主人公，自来也以他们的故事为题材，在他们相处时，长门的话给了自来也很大感悟，认为这个世界会有大变革，而这个变革由他的弟子发起，最终会使得忍界走向和平。
其次，在他们分开之后，长门等人一直为这个信念而奋斗，加入雨忍村，与不同的敌人抗战。但是，他们遇到了山椒鱼半藏，这个实力接近半神的首领言而无信，最后害死了弥彦。
最后，长门等人在痛苦中认为，这个世界唯有经历过痛楚才能进行变革，因此，他们认为自来也得话是错误的，他的信念是不行的。这个世界唯有让别人感受到痛楚才能走向和平。而这个时候，他们遇到了带土，于是他们合作，收集尾兽，最后对忍界进行改革。所以，在最后遇到自来也时，六道佩恩与自来也大战，最终自来也去世。
综上所述是我个人的想法，不知道你有什么想法，欢迎在评论下方留言。
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自来也为获晓的真正目的,孤身一人潜入隐雨村.获知隐雨村的掌权人是被称为神的佩恩,其一定和晓有莫大关系.自来也见到佩恩时发现他和自己的一个徒弟一样拥有轮回眼,就以为佩恩就是长门,佩恩就是那个能改变世界(造福或毁灭)的预言之子.
六道佩恩,六个身体,各个有轮回眼.自来也刚和佩恩打时只出现3个佩恩,自来也用仙人状态以幻术杀死了这3个,不料另3个将死的3个又复活了,并将自来也打成重伤.
自来也这才发现6个佩恩里没一个是长门,都是自己曾经杀死的人.
自来也将其中一人引入结界内杀死,让蛤蟆带回木叶.他为求佩恩真身,冒险出结界,在知道佩恩真正秘密的同时被杀.
自来也在临死前将佩恩秘密以密码形式写在了蛤蟆身上,让蛤蟆带回木叶.自己长眠于隐雨村的湖底.
至于佩恩也就是长门为什么要杀曾经为恩师的自来也，这个跟儿时好友弥彦的死有莫大的关系，因为自己的当初的信念和和平的意义被扭曲了！当看到团藏和半藏杀死弥彦的时候就彻底被扭曲了！
长门弥彦小兰，3个人组织晓的时候，为的就是继承自来也的教诲为和平而存在。但是却被忍者世界一次又一次的作为佣兵利用，慢慢的晓的组织壮大，便被其他人起了顾忌，对这样不稳定力量的存在感到威胁，便在一次委托任务里几个忍者村的人把晓袭击了，弥彦就是在救长门的时候挡下了团藏的攻击死的，当时长门就彻底对这个老师所希冀的和平世界绝望了，召出外道， 集聚着对世界的不信任，对曾今和平的理解产生了扭曲的甚至是痛恨的心态。
他杀自来也完全是为了否定自来也的‘和平’，他要靠自己创造他想要的和平，所以他杀了自来也。
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