雷鎬
您這番高見從何而來？可以說完全是錯誤的認識。
首先，清廷從1862年5月30日湘軍水師攻到天京護城河口起，直到天京城破，要的是“破城擒渠”，即攻破天京，抓獲洪秀全，最好當然是活捉並“獻俘闕下”，實在不行也要“活見人，死見屍”，這是為了驗明正身，確認洪秀全的確已經被消滅，而不會再死灰復燃或被他人借屍還魂，而不是要對一具死屍進行侮辱，事實上目前看到的上諭並沒有如何處理洪秀全屍體的明確指示，《欽定剿平粵匪方略》裡卻能找到許多朝廷在破城後追問洪秀全下落及他是否真的已死、有何為證的硃批，所謂“要對洪秀全屍體施以酷刑”真不知從何說起。
找到洪秀全屍體是在破城後二十多天，在這期間朝廷一再催問，是因為惟恐前線謊報戰功，洪秀全漏網（這並不是多餘的顧慮，石達開早在1852年就被報“殲畢”一回，沒過幾天又活了，在金田被曝“陣斃”的軍帥周錫能差不多一年後因為在永安被楊秀清指為清方臥底處死，還編了本書，而就在彙報洪秀全屍體被找到的前後，曾國藩兄弟還謊報了湖熟鎮大捷，稱在那裡消滅了巨王洪和元、順王李春發、幼西王蕭有和、章王林紹璋等太平天國重要人物，疑似消滅幼天王，但實際上根據幼天王口供和其它資料，這些人沒有一個死於湖熟鎮，湘軍大將鮑超1860年彙報的一次皖南大捷，宣稱擒斬的4名太平軍將領都沒有死，後來都在正式史料中“活了”），當曾國藩彙報已經發現並處理了洪秀全屍體，且“軍中人人得見”後，朝廷認為可信，就不再追問此事，這足以表明清廷關注的是確認洪秀全“已服冥誅”，而不是怎麼虐洪的屍體——當然，如果真的活捉了洪秀全，對他的活人“施以酷刑”是必然的。
其次，曾國藩兄弟對洪秀全的屍體也並沒有客氣。
因為必須“活見人死見屍”，曾國藩兄弟破城後不顧酷暑，督促部下到處尋找洪秀全埋葬地，折騰了20多天才在親手安葬洪秀全的“偽宮婢道州黃氏”的指點下，在天王府後林苑土山上把洪秀全屍體挖出，“雖腿胯處皆裹以黃綾”，對屍體，曾氏兄弟“驗畢戮屍，舉烈火而焚之”（見曾國藩奏稿），也就是說先驗屍，然後斬首示眾，最後用火焚燒屍體，據口碑相傳，骨灰都被放在大炮裡打出去，這就是所謂“挫骨揚灰”，差不多是對待死屍最殘酷的手段了，可以說，清廷並沒有“對屍體施以酷刑”的明確指示，但曾國藩倒是真這麼做了。
但曾國藩似乎並未把洪秀全首級送到北京或傳送各地示眾（相反被俘後處死的李秀成，首級被傳送各地示眾），這恐怕是因為洪秀全屍體被發現時已埋葬約兩個月，破城時又是酷暑，南京還是出了名的火爐，洪秀全首級大約腐爛到不太適合遠距離傳遞、即便傳遞也不會起到“宣傳效果”的緣故吧。
曾國藩“抗旨不遵”是有的，最典型一是拒絕在英法聯軍攻打天津、北京時北上勤王，二是不拿下安慶堅決不攻打南京，三是不顧獻俘指示堅持就地處死李秀成，但在洪秀全屍體處理上並非如此
陶短房
1864年7月19日，湘軍全線攻破天京之後，曾國藩還沒到天京，他的弟弟曾國荃暫時坐鎮在南京。
此時，屢經苦戰鏖戰的湘軍像瘋了一樣，湧入天京，疏解壓抑緊張的心情。有的燒殺搶掠，有的姦淫婦女，趁亂行樂，這種現象在大戰之後比較常見，主將也不會太約束或懲罰縱慾士兵，畢竟他們給朝廷賣命作戰，九死一生，需要藉機發洩。
朝廷當然痛恨洪秀全叛亂，曾國藩也痛恨洪秀全侮辱名教，逆魁必須授首，活要見人死要見屍。但普通士兵只知道打仗，大部分不知道為何打仗。
進入天京之後，幾乎每個士兵都參與了洗劫了天王府及其他王府和倉庫，並縱火焚燒，獲得財富或尋求身體歡愉是他們的訴求。
7月20幾日，曾國荃部在野外抓到忠王李秀成之後，咬牙切齒，天京保衛戰中，李秀成多次給湘軍極大打擊，下令割掉其臀股肉，以洩私憤，之後曾國藩來勸說李秀成，李秀成妥協投降，寫成了自述，8月7日被殺。洪秀全死於1864年6月1日，終年50歲。天京城攻破時間在7月19日，曾國藩坐火輪船來到天京在7月28日，等到發現洪秀全的屍體已經是7月31日，而且等到被處置已經是8月初。
也就是說，南京天氣酷熱，兩個月下來屍體已經面目全非，勉強辨認確實是洪秀全。曾國藩和曾國荃驗明洪秀全正身之後，就“驗畢戮屍，舉烈火而焚之”。
據一些野史傳說，曾國藩兄弟甚至下令用大炮挫骨揚灰，屍體被打成了粉末，以安撫湘軍戰死之士兵，曾國藩兄弟可謂心狠手辣，也可見洪秀全基本上是死無全屍。
朝廷的原意是想要確認洪秀全是否真的死了，這是其一。洪秀全的首級想要割下來，廣傳四處，震懾不安定力量，這是其二。
故而，朝廷對一具已經腐爛發臭的屍體施以酷刑是沒有什麼實際意義的，主要是確認死訊同時宣佈全國，這是政治意義。
曾國藩奏報洪秀全確實已經死了之後，朝廷也就不再追問了，屍體任由你處理吧。畢竟，拿一具腐爛的頭顱四處宣傳，似乎達不到效果也不太合適。所以，曾國藩談不上抗旨不遵，而是隨機應變。
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首先，清廷有關旨意的重點不在酷刑上，其次，曾國藩也沒有不對洪秀全的屍體施以酷刑。
下面，小編便按照時間順序擼一擼洪秀全屍體有關的故事：
1864年7月19日，太平天國首都天京陷落，湘軍攻入城內。
湘軍攻破天京
幾天後，洪秀全屍體上的土快蓋不住了。
為啥？
不是因為湘軍的所作所為，而是沒人理洪秀全。因為每一個湘軍都沉溺在搶劫的快樂中。他們搶了財物，便挑著擔子在天京街頭穿梭搬運，連營中的廝役都加入了進來。
搶來的財物是自家的，挖出的天王只是一塊臭肉。湘軍將士算得門兒清。當然，也有不愛財的，以一等子爵記名提督歸德鎮總兵信字營營官李臣典為例，他更喜歡當地的小姐姐。於是，城破後李臣典沒日沒夜沒羞沒臊出演愛情動作片，以實際行動為廣大湘軍將士做出表率。
躺在地下的洪秀全痛心疾首：天啊，你們還有沒有一點點敵軍的樣子？喂喂，姓李的，放開那個姑娘，衝朕來！朕才是太平天國最大的boss。
不過，洪秀全的抗議被黃土壓的瓷實，即使有湘軍推著裝有金銀財寶的獨輪車從他頭頂軋過，也會對屍體的怒吼充耳不聞。
直到9天后。
這九天當中，發生了李秀成被俘、洪仁達被俘事件。二人被俘後，曾國荃親自審訊，但他並沒有想起詢問洪秀全屍體的下落，而是看見仇人，分外眼紅，捅了對方几刀洩憤。
7月28日，即天京陷落的9天之後，曾國藩乘坐小火輪自安慶到達南京。當晚7點左右，他審問了李秀成。不過，此時的曾國藩已經十分疲倦，只匆匆問了幾句話，便結束了這次審訊。相信曾國藩根本沒有來得及詢問洪秀全屍體的下落。
第二天，曾國藩在日記中記下了未來幾天的工作內容，其中之一就是尋找洪秀全的屍體。終於，在天京陷落的10天后，處置洪秀全屍體的工作排上了工作日程。
湘軍大帥親自過問就是不一樣，果然，有人出來告發了。此人是個姓黃的宮女，聲稱洪秀全是她親自埋在大殿之內的。一天後，即7月30日，洪秀全的屍體被挖了出來。31日，扛到曾國藩等人面前，黃宮人指認：就是他。曾國藩與諸將、幕僚紛紛點頭，一致通過，這廝就是洪秀全。
《蕩平發逆圖記》中挖掘洪秀全屍體的畫面
按說，此時就該趁熱打鐵，處置屍體了。然而，洪秀全的屍身又一次華麗麗的被無視了。原來，曾國藩有一種怪僻，就是喜歡寫輓聯。他輓聯癮有多大呢？曾國藩曾經在京城為官，當沒有認識的親朋好友死去，導致他無法寫輓聯時，曾國藩竟然會給活著的朋友寫，還美其名曰生挽。如今，看到洪秀全的屍體，曾國藩豈能放過，於是扔下洪屍在三伏天臭著，他過癮寫輓聯去了。
第二天，曾國藩輓聯癮過足，傳令把洪秀全的屍體焚化為灰燼。坊間流傳，洪秀全屍體被化為灰燼後，用大炮打出云云，都是後世網絡寫手的發明。就包括曾國藩奏報、趙烈文日記等相關史料所給的信息來看，也就“舉烈火而焚之”而已。
結果，曾國藩前腳剛燒完，後腳朝廷的旨意就下來了。原來，按朝廷的意思是要把洪秀全的腦袋摘下來，在太平軍戰鬥過的地方搞個巡迴展覽。曾國藩聽完聖旨一拍大腿，“哎呀，不好，我忘了。”然而，屍體已經點了，難不成用骨灰和水，捏出一顆頭來？曾國藩只得在奏報中向朝廷鄭重其事的道歉。後來，這事兒也就不了了之了。
其實，重要的是內容，而不是形式。朝廷和曾國藩需要確認洪秀全已經死了，這就夠了。更重要的是活著的太平天國殘部如何剿撫，湘軍怎樣裁撤等一系列後續問題。再說，一個屍體你怎麼施加酷刑？難不成讓李臣典出馬，先奸再燒嗎？
真正按照清朝法律，應該凌遲而被曾國藩網開一面，施以砍頭之刑的人是李秀成，至於為什麼，小編在悟空問答上曾經寫過答案，關注就可以一睹為快。^_^
最後，有關洪秀全的屍體還有一點貓膩。
1864年10月25日，幼天王被清軍在江西俘獲，審訊後留下了幾份供詞。在供詞中，他告訴清方官員，爸爸埋在了御花園的山上。
納尼？黃宮女不是說洪秀全埋在大殿中嗎？而且，也的確從大殿裡挖出了一個死人。那麼，誰在說謊？
小編的推理是：幼天王為了保命，說了實話。他被俘後一心求生，連“如今我不做長毛，一心一德輔清朝”都寫出來了。試問，如果清方較真，真帶著幼天王去御花園起屍，結果發現啥也沒有，他可就要吃不了兜著走了。
所以，洪秀全死後，鑑於天京城眼看就要守不住的情況，太平天國方面把洪秀全真正的屍體埋在了御花園的山上，而把一具高度仿真屍埋在了大殿下。試想，誰家會把屍體埋在房子裡面啊？然後，他們安排一個忠心耿耿的女官，由她在清軍尋找屍體的時候出面指認假屍。事實上，真正的洪秀全死後入土為安了。
雁小驢
1864年6月1日，洪秀全病逝，幼主洪天貴即位，此時的的天京已曾國藩曾國荃帶領的湘軍被圍困多日，7月19日，天京失守，清軍屠城，忠王李秀成，洪仁玕等人護送幼天王突圍，李秀成好馬讓幼主，在同年7月22日在南京城被俘，於8月7日被曾國藩處死。
而幼天王在同年10月江西石城一役後被俘，於11月18日，在南昌城內被凌遲處死。
天京失守，李秀成被俘，意味著十幾年的太平天國運動走向了覆滅。
1851年到1864年，這十幾年的時間裡，太平天國起義，聲勢浩大，轟轟烈烈，嚴重動搖了清王朝的統治，被視為眼中釘肉中刺，心腹大患，一直以來都是欲除之而後快！而對於太平天國的領袖，天王洪秀全更是恨之入骨，因此在曾國藩攻破金陵城之後，雖然洪秀全已死，但是清廷依舊下達了一個決定，要求對洪秀全的屍體進行懲罰。
在發給曾國藩的諭旨中，清廷一方面表揚了湘軍的表現，表示要論功行賞，另一方面則是要求對太平天國的戰俘，嚴懲不貸。在此事上，清廷提出來兩個要求。
第一，要求將李秀成等要犯押至京師，第二就是要求對洪秀全的屍體進行處罰，不僅使其身首異處，更是要讓其頭顱傳至東南。
而這兩點，曾國藩全都沒有做，反而將李秀成等人處死，洪秀全的屍體也一把火燒掉了。按道理說，此時的曾國藩聲望很高，又手握重兵，最是容易遭人猜忌的時候，為何要違反朝廷旨意，留人以柄呢？
曾國藩之所以敢抗旨不尊，那麼一定有著更深層次的原因，那就是因為一條傳言。
在攻克金陵城前，有傳言稱，洪秀全曾將財富藏於金陵城內，因此清政府的打算就是滅了太平天國，將洪秀全搜刮的財富充實國庫。
可是，當曾國藩帶領湘軍攻破金陵城之後，搜遍整個金陵城，一根毛都沒有找到。因此上奏摺稱，洪秀全的老巢並沒有鉅額財富。
當然，也有傳言稱，曾家兄弟大發國難財，中班私囊。在這樣的流言之下，無論真相具體是怎樣的，曾國藩都不能讓一個活口走到北京，否則他們必定有性命之憂！
因此無論是違背朝廷的旨意焚燒洪秀全的屍體，還是擅自殺了李秀成，無疑都是在自保而已。而這兩件事，曾國藩一併以為防止沿途騷擾敷衍了過去。
由於死無對證，而且曾國藩此時大權在握，聲望正高，此時清廷若貿然追究並非明智之舉，因此曾國藩並沒有因為抗旨而獲罪，反而還大大表揚了一番。
以上。
木劍溫不勝
據歷史記載，洪秀全生前並沒有被清軍捉到過，也就不可能被施什麼酷刑。但是在他死後，即1864年7月30日，天京陷落，曾國藩之弟曾國荃從天王府宮女告密中得知洪秀全死後屍體被秘密葬在天王府的後花園裡。曾國荃挖出洪秀全的屍體，曾國藩下達了最嚴厲的懲處方式 ，對洪秀全進行戮屍，並用烈火燒掉屍體，命令人把洪秀全的骨灰和火藥和在一起，裝入炮彈發射出去，使其灰飛煙滅。
不知道我的這個回答可否滿意？
微史
設問者匪夷所思，何為酷刑，何為抗旨不尊！曾國藩在洋人（洋槍隊戈登）的見證下，把草草下葬在後花園的洪秀全屍體挖出焚燒成灰。所以有些設問是怎麼審核的！下圖是容閎給曾國藩拍的唯一一張照片！
