增值税发票综合服务平台发票批量抵扣勾选功能针对发票数据量较大、逐票勾选模式不太适用的状况给纳税人提供的一项优化服务。通过文件导入的形式实现批量勾选，达到提高发票勾选效率、降低勾选工作量的目的。
1、在线批量操作
1)发票批量抵扣勾选
(1）在勾选标志选项中，选择“未勾选”选项后，用户可以对开票日期范围或销方税号进行设置，完成设置后，点击“查询”按钮。
(2) 数据汇总情况表格里看到符合筛选条件的未勾选发票汇总信息
（3）在数据汇总情况表格里汇总的未勾选发票，在操作栏点击“全部勾选”可实现对上述发票的全部在线勾选。
（4）提交成功后点击“确定”按钮，在批量勾选日志表里可以看到本次批量勾选的汇总信息。
2）发票批量抵扣撤销勾选
（1）在勾选标志选项中，选择“已勾选”选项后，用户可以对勾选日期范围或销方税号进行设置，完成设置后，点击“查询”按钮。
（2）数据汇总情况表格里看到符合筛选条件的已勾选发票汇总信息
（3）在数据汇总情况表格里汇总的已勾选发票，在操作栏点击“全部撤销”可实现对上述全部发票的在线取消勾选（即发票状态变为未勾选状态）操作。
（4）数据提交成功后点击“确定”按钮，系统会以红色字体标识出最近一次的日志记录。
2、文件异步操作
（1）根据查询结果下载发票文件
用户可以根据未勾选或已勾选发票的筛选条件，查询当前税款所属期的未勾选或已勾选的发票。在数据汇总情况表格里可以看到符合条件的发票汇总信息，点击“查询”按钮后面的 “下载发票文件”按钮后，可以下载一个符合设置筛选条件、发票状态为正常的发票清单文件（文件名规则：纳税人识别号_随机数.zip），使用winrar等解压缩软件解压后可以得到一个excel文件（excel 2003格式）。
（2）对下载发票文件的修改
纳税人根据需要筛选出需要勾选的发票清单，分别保存为excel 2003格式的xls文件，将对应的“是否勾选”列的值改为“是”或“否”，并根据企业需要调整有效抵扣税额，实现对所属期勾选数据或撤销勾选数据的准备。
（3）上传已修改过的下载文件
点击“上传”按钮，然后点击“浏览”按钮选择之前准备好的勾选清单文件（excel 2003格式的xls文件，建议文件大小不超过500k），再点击“打开”按钮，最后点击“上传”按钮即可实现文件的上传，文件上传成功后即实现了批量勾选或撤销处理。
（4）批量文件上传操作成功后，系统会先显示如下的提示信息，对本次文件批量勾选操作中的勾选和撤销勾选情况进行汇总显示。
如果上传的文件类型不正确，系统会出现如下提示：
如果上传数据不符合校验格式（如勾选标志不合法），系统会出现如下提示：
（5）点击“确定”按钮后，系统会以红色字体标识出最近一次的日志记录：
3、注意：在申报期内，对当期的勾选和撤销勾选操作在未进行申请统计前有效，如需继续勾选，需要撤销统计才能执行此操作，否则会看到如下提示：
对于通行费电子发票比较多的企业，可以借助飞鱼ETC电子发票助手把企业的ETC电子发票的内容批量提取汇总成Excel报表，简单修改后即可按照上述步骤导入勾选平台进行批量勾选，非常快捷。
可以自定义提取发票项目和Excel列顺序，通过可以通过选项设定跳过不征税的发票。
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